ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/gclib/seqalign/itest.2line
(Generate patch)
# Line 1 | Line 1
1 < # current test:
2 <                                                                                                       GTACTCT-CTGAC-GAATCGTGCAGGGC
3 < ACTCGTGATCGTGATCGTGACTGCTGTAGCTGCTAGTGCTGATCGTGCTAGTCGTAGTCGTGTGTAGCTGACTGACTGACTGTAGTGCGCTAGTGCTAGCCGGGTACTCGACTG-CTGAATCNTGC
1 > # simple gap test:
2 >        ACTCT-CTGACTATGACA
3 > CATAACCGACTCGACTG-CTANC
4 >
5 > # v test 2:
6 >                                      ACTGCTAGACTATGACA
7 > ATCGTAGCTGTGCTAGTGCTGTGACCATAACCGACTCGACTGCTA
8 >
9 > # v test:
10 > ATCGTAGCTGTGCTAGTGCTGTGACCATAACCGACTCGACTGCTACTGTGACGTGCTGATGCTGCTGTCGTGATGC
11 > ATCGTAGCTGTG-TAGTGCTGTGACCATANCCGACTCGACTGCTA
12 >
13 > # simple test:
14 >                                                                                                                               TATGATGAACTATGACACTGATGCTGATG
15 > ACTCGTGATCGTGATCGTGACTGCTGTAGCTGCTAGTGCTGATCGTGCTAGTCGTAGTCGTGTGTAGCTGACTGACTGACTGTAGTGCGCTAGTGCTAGCCCTGCACTCGAACCGACTGCACTGAGCTATGNTG
16  
17   #ctest
18        GGCGACAGCCT-TAGCATG-AGTAGACATACATA
# Line 10 | Line 22
22             ACTGC-CTGAACTATGACACTGATGCTGATG
23   CACTCGAACCGACTGCACTGA-CTATGA
24  
25 < #ctest
25 > #ctest 2
26        GGCGACAGCCT-TAGCATG-AGTAGACATACATA
27   CGGGTACTCGACTG-CTGTAGCATGCNGTAGTG
28  
29 < # simple test:
30 <                                                                                                                               TATGATGAACTATGACACTGATGCTGATG
31 < ACTCGTGATCGTGATCGTGACTGCTGTAGCTGCTAGTGCTGATCGTGCTAGTCGTAGTCGTGTGTAGCTGACTGACTGACTGTAGTGCGCTAGTGCTAGCCCTGCACTCGAACCGACTGCACTGAGCTATGNTG
29 > # c test:
30 >                                                                                                       GTANTCT-CTGACTGAATCGTGCAGGGC
31 > ACTCGTGATCGTGATCGTGACTGCTGTAGCTGCTAGTGCTGATCGTGCTAGTCGTAGTCGTGTGTAGCTGACTGACTGACTGTAGTGCGCTAGTGCTAGCCGGGTACTCTACTGACT-AATCNTGC
32  
33 < # v test:
34 < ATCGTAGCTGTGCTAGTGCTGTGACCATAACCGACTCGACTGCTA
35 < ATCGTAGCTGTG-TAGTGCTGTGACCATANCCGACTCGACTGCTA
24 <
25 < # v test:
26 <                                      ACTGCTAGACTATGACA
27 < ATCGTAGCTGTGCTAGTGCTGTGACCATAACCGACTCGACTGCTA
33 > # current test:
34 >                                                                                                       GTACTCT-CTGAC-GAATCGTGCAGGGC
35 > ACTCGTGATCGTGATCGTGACTGCTGTAGCTGCTAGTGCTGATCGTGCTAGTCGTAGTCGTGTGTAGCTGACTGACTGACTGTAGTGCGCTAGTGCTAGCCGGGTACTCGACTG-CTGAATCNTGC
36  
37 < # simple gap test:
38 <        ACTCT-CTGACTATGACA
39 < CATAACCGACTCGACTG-CTANC
37 > # current test 2:
38 >                                                                                                       GTACTCT-CTGAC-GAATCGTGCAGGGC
39 > ACTCGTGATCGTGATCGTGACTGCTGTAGCTGCTAGTGCTGATCGTGCTAGTCGTAGTCGTGTGTAGCTGACTGACTGACTGTAGTGCGCTAGTGCTAGCCGGGTACTCGACTG-CTGAATCNTGC
40  
41  
42  

Diff Legend

Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines