ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/owl/tags/aglappe-1.1.2/createGraphDb.sh
(Generate patch)
# Line 59 | Line 59
59   $mysqlbin -pnieve -h $h -B -N $graphDb <<ENDSQL1
60          SET sql_mode = "NO_UNSIGNED_SUBTRACTION,TRADITIONAL";
61          CREATE TABLE chain_graph LIKE abstract.chain_graph;
62 +        CREATE TABLE scop_graph LIKE abstract.scop_graph;
63          CREATE TABLE single_model_graph LIKE abstract.single_model_graph;
64          CREATE TABLE single_model_node LIKE abstract.single_model_node;
65          CREATE TABLE single_model_edge LIKE abstract.single_model_edge;
# Line 74 | Line 75
75                  MODIFY chain_id INT,
76                  MODIFY model_id INT;
77          
78 +        ALTER TABLE scop_graph
79 +                MODIFY graph_id INT UNSIGNED NOT NULL AUTO_INCREMENT,
80 +                MODIFY pchain_code VARCHAR(2) NOT NULL,
81 +                MODIFY sunid INT UNSIGNED,
82 +                MODIFY sccs VARCHAR(10),
83 +                MODIFY domain_type ENUM('UNKNOWN', 'WHOLECHAIN', 'SINGLEFRAGMENT', 'MULTIFRAGMENT', 'MULTICHAIN'),
84 +                MODIFY num_chain INT,
85 +                MODIFY num_fragment INT,
86 +                MODIFY caths INT,
87 +                MODIFY num_chain_res INT,
88 +                MODIFY chain_scops INT,
89 +                MODIFY entry_id INT,
90 +                MODIFY assembly_id INT,
91 +                MODIFY chain_id VARCHAR(35),
92 +                MODIFY model_id INT;
93 +        
94          ALTER TABLE single_model_graph
95                  MODIFY graph_id INT UNSIGNED NOT NULL AUTO_INCREMENT;
96          
97          ALTER TABLE single_model_node
98 +                MODIFY num INT NOT NULL,
99                  MODIFY ssid VARCHAR(5),
100                  MODIFY sheet_serial CHAR(1);
101                  
102          ALTER TABLE single_model_edge
103 +                MODIFY i_num INT NOT NULL,
104                  MODIFY i_ssid VARCHAR(5),
105                  MODIFY i_sheet_serial CHAR(1),
106 +                MODIFY j_num INT NOT NULL,
107                  MODIFY j_ssid VARCHAR(5),
108                  MODIFY j_sheet_serial CHAR(1);          
109   ENDSQL1

Diff Legend

Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines