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root/owl/trunk/tests/proteinstructure/data/1w0nA_SC_5.0.cm
Revision: 884
Committed: Tue Aug 11 16:01:00 2009 UTC (10 years, 2 months ago) by duarte
File size: 3346 byte(s)
Log Message:
Major commit: 
- change of the implementation of Pdb (interface remains backwards compatible). Now data stored in a proper object-oriented way. Pdb not abstract anymore, a protein model can be created by using one of the constructors
- added many tests and test files for Pdb (and merged some already existing tests from the default package)
- removed obsolete classes related to msd
- bug fix: PdbfilePdb now properly reads files with alt codes
- all tests passed
Line File contents
1 #CMVIEW GRAPH FILE ver: 1.0
2 #SEQUENCE: WQFTPNTGGNTITKVEAENMKIGGTYAGKISAPFDGVALYANADYVSYSQYFANSTHNISVRGASSNAGTAKVDLVIGGVTVGSFNFTGKTPTVQTLSNITHATGDQEIKLALTSDDGTWDAYVDFIEFSL
3 #PDB: 1w0n
4 #PDB CHAIN CODE: A
5 #CHAIN: A
6 #MODEL: 1
7 #CT: SC
8 #CUTOFF: 5.0
9 12 14 1.000
10 12 128 1.000
11 12 130 1.000
12 13 15 1.000
13 13 50 1.000
14 13 129 1.000
15 14 16 1.000
16 14 126 1.000
17 14 128 1.000
18 15 20 1.000
19 15 48 1.000
20 15 50 1.000
21 15 127 1.000
22 16 18 1.000
23 16 19 1.000
24 16 125 1.000
25 16 126 1.000
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27 17 20 1.000
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30 17 124 1.000
31 18 19 1.000
32 18 29 1.000
33 18 35 1.000
34 18 37 1.000
35 18 125 1.000
36 20 46 1.000
37 20 48 1.000
38 20 111 1.000
39 20 127 1.000
40 21 45 1.000
41 21 47 1.000
42 22 27 1.000
43 22 29 1.000
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68 34 64 1.000
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103 50 52 1.000
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111 52 104 1.000
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205 85 97 1.000
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214 93 95 1.000
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229 113 119 1.000
230 113 121 1.000
231 113 122 1.000
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