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root/owl/trunk/tests/proteinstructure/data/1wb4A_ALL_5.0.cm
Revision: 884
Committed: Tue Aug 11 16:01:00 2009 UTC (10 years, 9 months ago) by duarte
File size: 23172 byte(s)
Log Message:
Major commit: 
- change of the implementation of Pdb (interface remains backwards compatible). Now data stored in a proper object-oriented way. Pdb not abstract anymore, a protein model can be created by using one of the constructors
- added many tests and test files for Pdb (and merged some already existing tests from the default package)
- removed obsolete classes related to msd
- bug fix: PdbfilePdb now properly reads files with alt codes
- all tests passed
Line User Rev File contents
1 duarte 884 #CMVIEW GRAPH FILE ver: 1.0
2     #SEQUENCE: MASDKFPVAENPSSSFKYESAVQYRPAPDSYLNPCPQAGRIVKETYTGINGTKSLNVYLPYGYDPNKKYNIFYLMHGGGENENTIFSNDVKLQNILDHAIMNGELEPLIVVTPTFNGGNCTAQNFYQEFRQNVIPFVESKYSTYAESTTPQGIAASRMHRGFGGFAMGGLTTWYVMVNCLDYVAYFMPLSGDYWYGNSPQDKANSIAEAINRSGLSKREYFVFAATGSEDIAYANMNPQIEAMKALPHFDYTSDFSKGNFYFLVAPGATHWWGYVRHYIYDALPYFFHELEHHHHHH
3     #PDB: 1wb4
4     #PDB CHAIN CODE: A
5     #CHAIN: A
6     #MODEL: 1
7     #CT: ALL
8     #CUTOFF: 5.0
9     15 16 1.000
10     15 17 1.000
11     15 103 1.000
12     15 104 1.000
13     16 17 1.000
14     16 18 1.000
15     16 103 1.000
16     16 104 1.000
17     16 284 1.000
18     16 285 1.000
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20     16 296 1.000
21     16 297 1.000
22     17 18 1.000
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25     17 296 1.000
26     17 297 1.000
27     18 19 1.000
28     18 20 1.000
29     18 253 1.000
30     18 254 1.000
31     18 255 1.000
32     18 256 1.000
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38     19 21 1.000
39     19 22 1.000
40     19 23 1.000
41     19 252 1.000
42     19 253 1.000
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46     20 22 1.000
47     20 252 1.000
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59     22 261 1.000
60     22 263 1.000
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65     23 263 1.000
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67     24 25 1.000
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70     24 264 1.000
71     24 265 1.000
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230     49 51 1.000
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319     62 69 1.000
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