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root/owl/trunk/tests/proteinstructure/data/2h6fB_BB:SC_5.0.cm
Revision: 884
Committed: Tue Aug 11 16:01:00 2009 UTC (11 years, 2 months ago) by duarte
File size: 31884 byte(s)
Log Message:
Major commit: 
- change of the implementation of Pdb (interface remains backwards compatible). Now data stored in a proper object-oriented way. Pdb not abstract anymore, a protein model can be created by using one of the constructors
- added many tests and test files for Pdb (and merged some already existing tests from the default package)
- removed obsolete classes related to msd
- bug fix: PdbfilePdb now properly reads files with alt codes
- all tests passed
Line User Rev File contents
1 duarte 884 #CMVIEW GRAPH FILE ver: 1.0
2     #SEQUENCE: MASPSSFTYYCPPSSSPVWSEPLYSLRPEHARERLQDDSVETVTSIEQAKVEEKIQEVFSSYKFNHLVPRLVLQREKHFHYLKRGLRQLTDAYECLDASRPWLCYWILHSLELLDEPIPQIVATDVCQFLELCQSPEGGFGGGPGQYPHLAPTYAAVNALCIIGTEEAYDIINREKLLQYLYSLKQPDGSFLMHVGGEVDVRSAYCAASVASLTNIITPDLFEGTAEWIARCQNWEGGIGGVPGMEAHGGYTFCGLAALVILKRERSLNLKSLLQWVTSRQMRFEGGFQGRCNKLVDGCYSFWQAGLLPLLHRALHAQGDPALSMSHWMFHQQALQEYILMCCQCPAGGLLDKPGKSRDFYHTCYCLSGLSIAQHFGSGAMLHDVVLGVPENALQPTHPVYNIGPDKVIQATTYFLQKPVPGFEELKDETSAEPATD
3     #PDB: 2h6f
4     #PDB CHAIN CODE: B
5     #CHAIN: B
6     #MODEL: 1
7     #CT: BB/SC
8     #CUTOFF: 5.0
9     15 16 1.000
10     15 17 1.000
11     16 15 1.000
12     16 17 1.000
13     17 16 1.000
14     17 18 1.000
15     17 19 1.000
16     17 20 1.000
17     18 17 1.000
18     18 19 1.000
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20     19 17 1.000
21     19 18 1.000
22     19 20 1.000
23     19 67 1.000
24     19 69 1.000
25     19 70 1.000
26     20 16 1.000
27     20 17 1.000
28     20 19 1.000
29     20 21 1.000
30     20 22 1.000
31     21 20 1.000
32     21 22 1.000
33     21 23 1.000
34     21 68 1.000
35     21 70 1.000
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40     22 337 1.000
41     23 22 1.000
42     23 24 1.000
43     23 26 1.000
44     23 27 1.000
45     23 68 1.000
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47     23 337 1.000
48     24 23 1.000
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50     24 27 1.000
51     24 30 1.000
52     24 333 1.000
53     24 337 1.000
54     25 23 1.000
55     25 24 1.000
56     25 26 1.000
57     25 30 1.000
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59     25 337 1.000
60     26 23 1.000
61     26 25 1.000
62     26 27 1.000
63     26 28 1.000
64     26 30 1.000
65     26 63 1.000
66     26 337 1.000
67     27 26 1.000
68     27 28 1.000
69     27 29 1.000
70     27 30 1.000
71     28 27 1.000
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347     85 86 1.000
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352     86 107 1.000
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