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root/owl/trunk/tests/proteinstructure/data/2h6fB_Cb_8.0.cm
Revision: 884
Committed: Tue Aug 11 16:01:00 2009 UTC (10 years, 9 months ago) by duarte
File size: 32535 byte(s)
Log Message:
Major commit: 
- change of the implementation of Pdb (interface remains backwards compatible). Now data stored in a proper object-oriented way. Pdb not abstract anymore, a protein model can be created by using one of the constructors
- added many tests and test files for Pdb (and merged some already existing tests from the default package)
- removed obsolete classes related to msd
- bug fix: PdbfilePdb now properly reads files with alt codes
- all tests passed
Line User Rev File contents
1 duarte 884 #CMVIEW GRAPH FILE ver: 1.0
2     #SEQUENCE: MASPSSFTYYCPPSSSPVWSEPLYSLRPEHARERLQDDSVETVTSIEQAKVEEKIQEVFSSYKFNHLVPRLVLQREKHFHYLKRGLRQLTDAYECLDASRPWLCYWILHSLELLDEPIPQIVATDVCQFLELCQSPEGGFGGGPGQYPHLAPTYAAVNALCIIGTEEAYDIINREKLLQYLYSLKQPDGSFLMHVGGEVDVRSAYCAASVASLTNIITPDLFEGTAEWIARCQNWEGGIGGVPGMEAHGGYTFCGLAALVILKRERSLNLKSLLQWVTSRQMRFEGGFQGRCNKLVDGCYSFWQAGLLPLLHRALHAQGDPALSMSHWMFHQQALQEYILMCCQCPAGGLLDKPGKSRDFYHTCYCLSGLSIAQHFGSGAMLHDVVLGVPENALQPTHPVYNIGPDKVIQATTYFLQKPVPGFEELKDETSAEPATD
3     #PDB: 2h6f
4     #PDB CHAIN CODE: B
5     #CHAIN: B
6     #MODEL: 1
7     #CT: Cb
8     #CUTOFF: 8.0
9     15 16 1.000
10     16 17 1.000
11     16 18 1.000
12     16 20 1.000
13     16 21 1.000
14     16 22 1.000
15     17 18 1.000
16     17 19 1.000
17     17 20 1.000
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22     19 70 1.000
23     20 21 1.000
24     20 22 1.000
25     20 66 1.000
26     20 67 1.000
27     20 68 1.000
28     20 69 1.000
29     20 70 1.000
30     21 22 1.000
31     21 23 1.000
32     21 68 1.000
33     21 69 1.000
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40     22 27 1.000
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43     23 25 1.000
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53     24 25 1.000
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55     24 27 1.000
56     24 30 1.000
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61     25 26 1.000
62     25 27 1.000
63     25 30 1.000
64     25 59 1.000
65     25 286 1.000
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67     25 337 1.000
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69     25 341 1.000
70     26 27 1.000
71     26 30 1.000
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2188     423 424 1.000