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root/owl/trunk/tests/proteinstructure/data/7odcA_BB:SC_5.0.cm
Revision: 884
Committed: Tue Aug 11 16:01:00 2009 UTC (10 years, 9 months ago) by duarte
File size: 29480 byte(s)
Log Message:
Major commit: 
- change of the implementation of Pdb (interface remains backwards compatible). Now data stored in a proper object-oriented way. Pdb not abstract anymore, a protein model can be created by using one of the constructors
- added many tests and test files for Pdb (and merged some already existing tests from the default package)
- removed obsolete classes related to msd
- bug fix: PdbfilePdb now properly reads files with alt codes
- all tests passed
Line User Rev File contents
1 duarte 884 #CMVIEW GRAPH FILE ver: 1.0
2     #SEQUENCE: MSSFTKDEFDCHILDEGFTAKDILDQKINEVSSSDDKDAFYVADLGDILKKHLRWLKALPRVTPFYAVKCNDSRAIVSTLAAIGTGFDCASKTEIQLVQGLGVPAERVIYANPCKQVSQIKYAASNGVQMMTFDSEIELMKVARAHPKAKLVLRIATDDSKAVCRLSVKFGATLKTSRLLLERAKELNIDVIGVSFHVGSGCTDPDTFVQAVSDARCVFDMATEVGFSMHLLDIGGGFPGSEDTKLKFEEITSVINPALDKYFPSDSGVRIIAEPGRYYVASAFTLAVNIIAKKTVWKEQPGSDDEDESNEQTFMYYVNDGVYGSFNCILYDHAHVKALLQKRPKPDEKYYSSSIWGPTCDGLDRIVERCNLPEMHVGDWMLFENMGAYTVAAASTFNGFQRPNIYYVMSRPMWQLMKQIQSHG
3     #PDB: 7odc
4     #PDB CHAIN CODE: A
5     #CHAIN: A
6     #MODEL: 1
7     #CT: BB/SC
8     #CUTOFF: 5.0
9     2 3 1.000
10     2 12 1.000
11     2 13 1.000
12     2 15 1.000
13     3 2 1.000
14     3 4 1.000
15     3 13 1.000
16     4 3 1.000
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29     7 8 1.000
30     7 9 1.000
31     7 74 1.000
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64     14 411 1.000
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68     16 15 1.000
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70     17 16 1.000
71     17 18 1.000
72     17 19 1.000
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