
<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>Dear S2S and Assemble user,<div><br></div><div>We have released Assemble 1.0.4 and S2S 2.0.3. You can follow these links to get them directly:</div><div><br></div><div>- for Assemble 1.0.4: <a href="http://ftp.bioinformatics.org/pub/assemble/1.0.4/Assemble_1.0.4.zip">http://ftp.bioinformatics.org/pub/assemble/1.0.4/Assemble_1.0.4.zip</a></div><div>- for S2S 2.0.3: <a href="http://ftp.bioinformatics.org/pub/s2s/2.0.3/S2S_2.0.3.zip">http://ftp.bioinformatics.org/pub/s2s/2.0.3/S2S_2.0.3.zip</a></div><div><br></div><div>You will find mainly:</div><div><br></div>- a fix to load the Rfam alignments formatted with the Stockholm format (S2S)<br>- a fix to merge several secondary structures (2D Model -> Import... in Assemble)<br>- a fix for the first save of your data under Windows (S2S and Assemble)<br>- a fix to refine a 3D model made with several RNA molecules (Assemble)<br>- any RNA molecule of an S2S alignment can be defined as a reference molecule<br>- an S2S alignment can be extended with molecules stored in a PDB file<br>- an S2S alignment can be constructed from an Assemble model <br><br>When Assemble 1.0.4 is launched for the first time, it will take some time to re-index all the 3D structures stored in the MyPDB library. <br><br><div>You can find all the details about the improvements and the bugs fixed in the CHANGELOG files provided with each tool. </div></div><div><br></div><div>We hope that you will enjoy these new versions.</div><div><br></div><div>Best Regards,</div><div><br></div><div>Fabrice</div><br><div>

<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><div>--</div><div>Dr. Fabrice Jossinet</div><div>Laboratoire de Bioinformatique, modélisation et simulation des acides nucléiques </div><div>Université de Strasbourg</div><div>Institut de biologie moléculaire et cellulaire du CNRS</div><div>UPR9002, Architecture et Reactivite de l'ARN </div><div>15 rue Rene Descartes</div><div>F-67084 Strasbourg Cedex</div><div>France</div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div>Tel + 33 (0) 3 88 41 70 53 </div><div>FAX + 33 (0) 3 88 60 22 18</div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div><a href="mailto:f.jossinet@ibmc.u-strasbg.fr">f.jossinet@ibmc.u-strasbg.fr</a> </div><div><a href="http://www-ibmc.u-strasbg.fr/arn/Westhof/index.html">http://www-ibmc.u-strasbg.fr/arn/Westhof/index.html</a></div></div></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></span><br class="Apple-interchange-newline">

</div>

<br></body></html>