<HTML><FONT FACE=arial,helvetica><FONT  SIZE=2 FAMILY="FIXED" FACE="Courier New" LANG="2">Hi
<BR>
<BR>Yes there do seem to be a few patents/applications out there on the subject.  For example, a recent PCT ("World") application entitled: "MULTIPLE SEQUENCE ALIGNMENT", WO0169508, was published on September 20th last year. Derwent Information does a slightly better job of writing a meaningful title than the author, for its World Patents Index database:
<BR>
<BR>L6   ANSWER 12 OF 127  WPIX   COPYRIGHT 2002   DERWENT INFORMATION LTD  
<BR>TI   Computer-implemented method of aligning protein or nucleic acid sequences
<BR>     involves alignment of a query sequence to target sequence using dynamic
<BR>     programming algorithm.
<BR>
<BR>However I am not an expert, so you'd really have to pay a patent lawyer or a qualified search broker service to get a full answer.
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<BR>Rob 
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<BR>Robert Austin
<BR>Regional Sales Manager USA
<BR>FIZ Karlsruhe
<BR>376 Carter Road
<BR>Princeton, NJ 08540
<BR>Tel: 1 609 333 1466
<BR>mailto:robert.austin@fiz-k.com
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<BR>www.fiz-k.com
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