<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 5.50.4522.1800" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY style="MARGIN-TOP: 2px; FONT: 10pt Arial; MARGIN-LEFT: 2px" 
bgColor=#ffffff>
<DIV>Proteins are polypeptides. Peptides are short chains of amino acids. Just 
how long can a peptide be before it should be called a protein? I'm not going to 
stick my neck out a give a number, but one thing is clear: 2 amino acids does 
not a protein make.</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Andrew</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>===============================================================<BR>Andrew 
Mitchell<BR>Senior Lecturer, Molecular Phylogenetics<BR>School of Molecular and 
Cellular Biosciences<BR>University of Natal<BR>Private Bag X01<BR>Scottsville, 
3209<BR>SOUTH AFRICA</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Tel:  +27 (0)33 260 5815<BR>Fax: +27 (0)33 260 5462</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV><A 
href="http://www.nu.ac.za/department/members/members.asp?dept=bioscienunp&id=123456">http://www.nu.ac.za/department/members/members.asp?dept=bioscienunp&id=123456</A><BR></DIV>
<DIV><BR>>>> bio_bulletin_board-request@bioinformatics.org 02/02/21 
07:02:18 >>><BR>Message: 1<BR>Date: Wed, 20 Feb 2002 13:15:45 
-0500<BR>From: hinaishadh@netscape.net<BR>To: 
bio_bulletin_board@bioinformatics.org<BR>Subject: [BiO BB] Definition of a 
protein<BR>Reply-To: bio_bulletin_board@bioinformatics.org<BR><BR>Hi Kiran,<BR>I 
am sure I will get a lot of flake for this BUT<BR>Amino acids are building 
blocks of protein.  In other words proteins are polymers of amino 
acids.  How many? By definition 2 or more should do.<BR><BR>That said, keep 
in mind that earlier biochemical scientists did not know the nature of the 
molecule thay were working on.  So, the names like toxins, or even "active 
principle" in the ddays of Pasteur and Robert Koch (1870s!).  To further 
complicate matters you have glycoproteins that are mainly proteins with sugar 
side chains, and peptidoglycans that have small peptide backbone but really 
long, branched sugars chains (generally constituting 90% of the mol. wt. of the 
whole molecule).<BR><BR>LOts of work was done using precipitation as one way to 
isolate large biological molecules. So the growth factors and small peptides 
that were soluble by such criteria were not called proteins but peptides or 
peptide hormones etc.<BR><BR>Hope this helps<BR><BR>Naishadh Desai<BR>Perlegen 
Sciences<BR>Mountain View, CA 94043<BR><BR><BR>><BR>>Message: 
3<BR>>Date: Wed, 20 Feb 2002 02:48:00 -0800 (PST)<BR>>From: Ayyagari Kiran 
<kiran_ayyagari@yahoo.com><BR>>To: 
bio_bulletin_board@bioinformatics.org<BR>>Subject: [BiO BB] what is the 
minimum length of protein? and why differentiate protein & 
peptides<BR>>Reply-To: 
bio_bulletin_board@bioinformatics.org<BR>><BR>>hi,<BR>>1)what is the 
minimu length of  A protein ?<BR>>(please mention the minimal possible 
length of<BR>>protein, its minimal mol wt(in kDa) and also types 
of<BR>>proteins by example.<BR>><BR>>2) is it that a biomolecule can be 
called as a protein<BR>>based on its structural organization (like if 
domains<BR>>are present)<BR>>or <BR>>is it that a biomolecule can be 
called as protein<BR>>based on Functional implications??like example can 
be<BR>>toxin of 55 amino acids causes raise in antibodies<BR>>production. 
why is it not called a protein and why it<BR>>is called a peptide toxin 
despite having amino acids.<BR>>  <BR>>thanks in 
advance<BR>><BR>>A.S.Kiran<BR>><BR></DIV></BODY></HTML>