
<HTML>

<HEAD>

<TITLE>amino acid distribution in multiple alignment</TITLE>

</HEAD>

<BODY>

<BR>

 <TT>Hi all</TT>,<BR>

<BR>

I am looking for a program or script for calculation of amino acid distribution in specific column in ungaped multiple alignment. Most program I know calculates PSSM that includes weights calculation according to PAM or Blosum matrixes. I  just need a simple representation of amino acid  distribution  in specific column in ungaped multiple alignment.<BR>

<BR>

<BR>

Thanks a lot,<BR>

Dana Reichmann<BR>

-- <BR>

<BR>

<BR>

</BODY>

</HTML>