<DIV>Cellular metabolism is extraordinarily complex.  Reversible/nonreversible reactions are only a microcosm of the variables you will have to contend with in developing a "model" such as this.  I believe you will have little trouble finding numbers to plug into your algoritm for any number of reactions involved in cellular respiration for instance.  However, as a cell biologist I would be very skeptical of cell simulation software that attempted to analyze any more than a couple of these reactions simultaneously.  </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>John</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>John G. Hoey, Ph.D.<BR><BR><B><I>deepan chakravarthy n <deepan_3356@yahoo.co.in></I></B> wrote:</DIV>
<BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">hello ,<BR>i am writing algorithm for a cell simulation<BR>software.<BR><BR>1)<BR>we know complex reactions are involved in cell<BR>metabolism.<BR>many reversible rxns, non reversible rxns are<BR>involved.<BR>to calculate the concentration of each component at a<BR>given instant we have to use complex differential<BR>equations.<BR>if someone can suggest me some websites or books to<BR>refer for such calculations plz do it.<BR><BR>2)<BR>i have taken my reference cell as E.Coli . where can<BR>i get the complete set of metabolism rxn involved in<BR>EColi .(along with <BR>the values of equlibrium constants)<BR><BR><BR>plese guide me if possible<BR><BR><BR><BR>=====<BR>---------------------------------------------<BR>deepan chakravarthy n<BR>2nd year,(2nd sem),<BR>b.tech(biotech),<BR>anna university ,<BR>chennai.<BR>ph no:<BR>hostel:22354862(044)room
 no205,<BR>home:04287-241199,04287244399,<BR>address:<BR>ac tech hostel (jh 207),<BR>anna university,<BR>chennai-25.<BR><BR>________________________________________________________________________<BR>Yahoo! India Matrimony: Find your partner online.<BR>Go to http://yahoo.shaadi.com<BR>_______________________________________________<BR>BiO_Bulletin_Board maillist - BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org<BR>https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board</BLOCKQUOTE><p><hr SIZE=1>
Do you Yahoo!?<br>
<a href="http://shopping.yahoo.com/?__yltc=s%3A150000443%2Cd%3A22708228%2Cslk%3Atext%2Csec%3Amail">The New Yahoo! Shopping</a> - with improved product search