<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META content="text/html; charset=iso-8859-1" http-equiv=Content-Type>
<META content="MSHTML 5.00.2920.0" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>put the z-dscore in the array of the matrix of 
the  smith and then divide by the waterman and then align the algo 
</FONT></DIV>
<BLOCKQUOTE 
style="BORDER-LEFT: #000000 2px solid; MARGIN-LEFT: 5px; MARGIN-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; PADDING-RIGHT: 0px">
  <DIV style="FONT: 10pt arial">----- Original Message ----- </DIV>
  <DIV 
  style="BACKGROUND: #e4e4e4; FONT: 10pt arial; font-color: black"><B>From:</B> 
  <A href="mailto:prathibha_562@yahoo.co.in" 
  title=prathibha_562@yahoo.co.in>prathibha bharathi</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>To:</B> <A 
  href="mailto:bio_bulletin_board@bioinformatics.org" 
  title=bio_bulletin_board@bioinformatics.org>bio_bulletin_board@bioinformatics.org</A> 
  </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Sent:</B> Monday, January 12, 2004 4:02 
  PM</DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Subject:</B> [BiO BB] How to calculate 
  smithwaterman and z-scores while performing local alignment using 
  smith-waterman algo..</DIV>
  <DIV><BR></DIV>
  <DIV>Hi,</DIV>
  <DIV>can any body of you suggest me how to calculate z-score and 
  smith-waterman score while performing local alignment using smith-waterman 
  algorithm.</DIV>
  <DIV><BR>                                       
  ThankYou</DIV>
  <DIV>                                       
  Prathibha <BR><B><I>com bio <<A 
  href="mailto:combiofriends@yahoo.com">combiofriends@yahoo.com</A>></I></B> 
  wrote:</DIV>
  <BLOCKQUOTE class=replbq 
  style="BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid; MARGIN-LEFT: 5px; PADDING-LEFT: 5px">i 
    have a web page.<BR>when some one visits it , it asks for his name.<BR>i 
    would like to capture the name he enters using a<BR>variable in PERL. how do 
    i go about? <BR>deepan chakravarthy 
    n<BR><BR>=====<BR>-------------------------------------------<BR>center for 
    biotehnology<BR>anna 
    university<BR>chennai-25<BR>india<BR><BR>__________________________________<BR>Do 
    you Yahoo!?<BR>Yahoo! Hotjobs: Enter the "Signing Bonus" 
    Sweepstakes<BR>http://hotjobs.sweepstakes.yahoo.com/signingbonus<BR>_______________________________________________<BR>BiO_Bulletin_Board 
    maillist - 
    BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org<BR>https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board</BLOCKQUOTE>
  <P><FONT face=arial size=-1><A href="http://in.mobile.yahoo.com" 
  target=_blank><B>Yahoo! India Mobile</A>:</B> Ringtones, Wallpapers, Picture 
  Messages and more. <FONT face=arial size=-1>Download <A 
  href="http://in.mobile.yahoo.com" 
  target=_blank><B>now</A></B>.</FONT></FONT></P></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>