<DIV>I do not think we can find a general random sequence generator for all the case.  At least, we need consider GC content, and maybe even content of  "GC", "GG", "GT", "GA"......"TC"....."TA", etc.   A "real" random sequnce is most likely useless in a specific case. </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Fei<BR><BR><B><I>Dan Bolser <dmb@mrc-dunn.cam.ac.uk></I></B> wrote:</DIV>
<BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">
<P>On Tue, 5 Oct 2004, Joe Landman wrote:<BR><BR>><BR>>That said, you have to be careful about what random means</P>
<P>>Just some thoughts...<BR><BR>That reminds me, you can get random sequences 'in the syle of' a<BR>particular HMM with HMMER (hmmemit). <BR><BR><BR>><BR>>Joe<BR>><BR>>Dan Bolser wrote:<BR>><BR>>>On Tue, 5 Oct 2004, Ryan Golhar wrote:<BR>>><BR>>>perl -e '@x=qw(A T C G);for(1..10000){print $x[rand(@x)]}'<BR>>><BR>>>Other than that it kind of depends on what your requirements are (and<BR>>>aparently the above random generator isn't too good).<BR>>><BR>>>perl -e '@x=qw(all work and no play);while(1){print $x[rand(@x)]}'<BR>>>>Ryan<BR>>>>_______________________________________________<BR></P></BLOCKQUOTE><BR><BR>-------------------------------------------------<br>Fei Li, PhD, Postdoc fellow<br>Institute of Bioinformatics<br>MOE key laboratory of Bioinformatics<br>Tsinghua University<br>Beijing, 100084<br>China<br>Tel:0086-10-62782877<br>Fax:0086-10-62786911<br>E-mail:
 flee@tsinghua.edu.cn<br>Homepages:http://166.111.30.65/member/~lifei/<p><br><hr size=1><b>Do You Yahoo!?</b><br>
<a href="http://music.yisou.com" target=blank>150万曲MP3疯狂搜，带您闯入音乐殿堂</a><br><a href="http://image.yisou.com" target=blank>美女明星应有尽有，搜遍美图、艳图和酷图</a><br>
<a href="http://cn.rd.yahoo.com/mail_cn/tag/1g/*http://cn.mail.yahoo.com/event/mail_1g/" target=blank>1G就是1000兆，雅虎电邮自助扩容！</a>