<DIV>You can also try SCPD( saccharomyces cerevisea Promotor Database<BR><BR><B><I>Ryan Golhar &lt;ryangolhar@hotmail.com&gt;</I></B> wrote:
<BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">I've done something like this before. I used the tool Spidey from NCBI<BR>to determine exon locations, then used a perl script to parse that<BR>information and grab 2500 bp upstream of the first exon.<BR><BR>-----<BR>Ryan Golhar<BR>Computational Biologist<BR>The Informatics Institute at<BR>The University of Medicine &amp; Dentistry of NJ<BR><BR>Phone: 973-972-5034<BR>Fax: 973-972-7412<BR>Email: golharam@umdnj.edu<BR><BR>-----Original Message-----<BR>From: bio_bulletin_board-admin@bioinformatics.org<BR>[mailto:bio_bulletin_board-admin@bioinformatics.org] On Behalf Of Junguk<BR>Hur<BR>Sent: Friday, October 01, 2004 8:54 AM<BR>To: bio_bulletin_board@bioinformatics.org<BR>Subject: [BiO BB] Getting promotor region sequences of Yeast<BR><BR><BR><BR>Dear all, <BR><BR>I am trying to get intergenic sequences of yeast genes for promotor<BR>analyses. <BR><BR>I have a gene list of 7K but 
 don't
 know how to get the upstream region<BR>sequences. <BR><BR>The gene list and relevant data was obtained from the following sites,<BR>Professor Young's Lab, <BR><BR>http://web.wi.mit.edu/young/location/<BR><BR>Does anybody have idea how to get thoes upstream region sequences?<BR><BR>Many thanks in advance, <BR><BR>Junguk<BR><BR>_______________________________________________<BR>BiO_Bulletin_Board maillist - BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org<BR>https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board<BR>_______________________________________________<BR>BiO_Bulletin_Board maillist - BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org<BR>https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board<BR></BLOCKQUOTE></DIV><p>
                <hr size=1>Do you Yahoo!?<br>
<a href="http://us.rd.yahoo.com/mail_us/taglines/aac/*http://promotions.yahoo.com/new_mail/static/ease.html">Yahoo! Mail Address AutoComplete</a> - You start. We finish.