
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">

<HTML><HEAD>

<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">

<META content="MSHTML 6.00.2900.2604" name=GENERATOR>

<STYLE></STYLE>

</HEAD>

<BODY bgColor=#ffffff>

<DIV><FONT face=Arial size=2>Hi all,</FONT></DIV>

<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>

<DIV><FONT face=Arial size=2>I am reading the Protein Sequence Comparison and 

Protein Evolution tutorial ISMB2000 by William R. Pearson, on Page 13 Table 3 it 

list down searchhing the database with human ATP-ase, high scoring sequences. I 

can figure out how SW was done, but I cannot understand how to calculate z-score 

and E and percentage. XCan anyone guide me of how to get material or examples or 

books or website where it show detail example how to get those value starting 

from the input value to output value.. </FONT></DIV>

<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>

<DIV><FONT face=Arial size=2>Thanks a lot.. I have no statistic background and 

though I got some notes on how to calculate z-score but this is 

different.</FONT></DIV>

<DIV> </DIV>

<DIV><FONT face=Arial size=2>Nur'Aini binti Abdul Rashid<BR>Pusat Pengajian 

Sains Komputer<BR>Universiti Sains Malaysia<BR>Pulau 

Pinang.</FONT></DIV></BODY></HTML>