<P>
Dear Sir,<BR>
        Thanks for your asisstance. During the compilation of lam version I have got this error message. Kindly let me know the solution.<BR>
-----------------------------------------------------------------------<BR>
Process:<BR>
1. Compilation of NCBI-2.2.10-5.x86_64.rpm: creates: /usr/share/ncbi/data. and /usr/bin/exes.<BR>
2. Compilation of mpiblast-1.3.0-2LAM.x86_64.rpm : created exes in /usr/local/bin.<BR>
3. .ncbirc file has been set up in each node at ~sravan/.ncbirc:<BR>
[NCBI]<BR>
Data=/apps/Databases/ncbi/data<BR>
[BLAST]<BR>
BLASTDB=/apps/Databases/blastdb        BLASTMAT=/apps/Databases/ncbi/data<BR>
[mpiBLAST]<BR>
Shared=/apps/Databases/blastdb ( full permission)<BR>
Local=/tmp/mpiblast(full permission)<BR>
4. formatdb -N 20 -i /home/sravan/demorun/blast/silkcds -p F : has created a shared blastable parsed dataset fragments in /apps/Databases/blastdb(drwxrwxrwx): but the files are created as user. So their permissions are: -rw-r--r--.<BR>
5. script:<BR>
/usr/local/lam/bin/mpirun -np 5 /usr/local/bin/mpiblast -p blastn -i /home/sravan/demorun/blast/SWseq -d /apps/Databases/blastdb/silkcds -e 10 -v 5 -b 5 -o /home/sravan/demorun/blast/mpiblast.out --debug=mpiblastlog.<BR>
Error Message I got:<BR>
-------------<BR>
Sat May 21 11:09:14 IST 2005<BR>
(0) Error opening: /apps/Databases/blastdb///apps/Databases/blastdb/silkcds.dbs<BR>
Fatal Error:<BR>
db_spec.cpp(DbSpecFile): Unable to open file<BR>
-----------------------------------------------------------------------------<BR>
One of the processes started by mpirun has exited with a nonzero exit<BR>
code.  This typically indicates that the process finished in error.<BR>
If your process did not finish in error, be sure to include a "return<BR>
0" or "exit(0)" in your C code before exiting the application.<BR>
<BR>
PID 15092 failed on node n0 (172.16.0.17) with exit status 1.<BR>
-----------------------------------------------------------------------------<BR>
MPI_Recv: process in local group is dead (rank 1, SSI:coll:smp:local comm for CID 0)<BR>
Rank (3, MPI_COMM_WORLD): Call stack within LAM:<BR>
Rank (3, MPI_COMM_WORLD):  - MPI_Recv()<BR>
Rank (3, MPI_COMM_WORLD):  - MPI_Recv()<BR>
Sat May 21 11:09:16 IST 2005<BR>
<BR>
Thank you very much.<BR>
Regards.<BR>
Sravan.
</P>
<br><br>
<A target="_blank" HREF="http://clients.rediff.com/signature/track_sig.asp"><IMG SRC="http://ads.rediff.com/RealMedia/ads/adstream_nx.cgi/www.rediffmail.com/inbox.htm@Bottom" BORDER=0 VSPACE=0 HSPACE=0></a>