<br>
Hii...<br>
I am looking for various options to analyze a set of 300bp long
orthologous sequences from a group of phylogenetically related species.
Its like 5-8 promoter dna sequences per gene for around 2000 genes.<br>
<br>
What can be the best ways to do this analysis, I looked at some
phylogenetic tools, but most have limitations like web-based, just 2
sequences, etc.<br>
<br>
All your suggestions... and anyone experienced with similar stuff. ... I welcome it all...<br>
<br>
Thanks.<br>
Samantha<br>