<div>Hi Iddo,</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>I recall that Steven Brenner at Berkeley did an analysis about 4-5 years ago. He was simply comparing the differences in annotation of comparable databases, (which were considerable), thus avoiding the problem of figuring out what the 'true' answer was.
</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Marty<br><br>&nbsp;</div>
<div><span class="gmail_quote">On 10/8/05, <b class="gmail_sendername">Iddo Friedberg</b> &lt;<a href="mailto:idoerg@burnham.org">idoerg@burnham.org</a>&gt; wrote:</span>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">Hi,<br><br>Is there any recent study regarding the scope of annotation errors in<br>sequnece databases? Especially functional annotations? Something in the
<br>spirit of:<br><br><br>Peer Bork: Powers and pitfalls in sequence analysis: the 70% hurdle.<br>Genome Res. 2000 Apr;10(4):398-400<br><br>Thanks,<br><br>Iddo<br><br>--<br><br>Iddo Friedberg, Ph.D.<br>Burnham Institute for Medical Research
<br>10901 N. Torrey Pines Rd.<br>La Jolla, CA 92037<br>Tel: (858) 646 3100 x3516<br>Fax: (858) 713 9930<br><a href="http://ffas.ljcrf.edu/~iddo">http://ffas.ljcrf.edu/~iddo</a><br><br>_______________________________________________
<br>Bioinformatics.Org general forum&nbsp;&nbsp;-&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org">BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org</a><br><a href="https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board">https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board
</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>-- <br>Martin Gollery<br>Associate Director<br>Center For Bioinformatics<br>University of Nevada at Reno<br>Dept. of Biochemistry / MS330<br>775-784-7042<br>-----------