Is there a good quick and dirty way to find the genes involved in a
particular KEGG pathway .. for a particular organism, say Drosophila ?<br>
<br>
Cheers...<br><br><div><span class="gmail_quote">On 1/19/06, <b class="gmail_sendername">govind mk</b> <<a href="mailto:mkgovindis@yahoo.com">mkgovindis@yahoo.com</a>> wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div>Is this what you are looking for</div>  <div> </div>  <div><a href="ftp://ftp.genome.jp/pub/kegg/tarfiles/" target="_blank" onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)">ftp://ftp.genome.jp/pub/kegg/tarfiles/
</a></div>  <div> </div>  <div>-govind</div><div><span class="e" id="q_108e5d9a2cf064ba_1">  <div><br><br><b><i><a href="mailto:forward@hongyu.org" target="_blank" onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)">forward@hongyu.org
</a></i></b> wrote:</div>  <blockquote style="border-left: 2px solid rgb(16, 16, 255); padding-left: 5px; margin-left: 5px;">I am wondering whether anyone has a downloable file containing all protein<br>sequences of KEGG pathway (
e.g., in FASTA format)? I remember seeing it<br>somewhere on KEGG website, but I couldn't find it anymore.<br><br>Basically, I want to BLAST my query sequences against the file to find<br>out the pathway information of my sequences. I can't use the web
<br>interface of KEGG directly because I have too many sequences to query. It<br>would be nice if I can download a local copy.<br><br>Thanks!<br><br>-- <br>Hongyu Zhang, Ph.D.<br>Computational Biologist<br>Ceres Inc.<br>1535 Rancho Conejo Blvd
<br>Thousand Oaks, CA
 91320<br>Phone: (805)376-6504 ext 1204<br><br><br><br>_______________________________________________<br>Bioinformatics.Org general forum - <a href="mailto:BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org" target="_blank" onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)">
BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org</a><br><a href="https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board" target="_blank" onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)">https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board
</a><br></blockquote>  <div><br></div></span></div><span class="ad"><p>
                </p><hr size="1">Yahoo! Photos  Showcase holiday pictures in hardcover<br> 
<a href="http://us.rd.yahoo.com/mail_us/taglines/photobooks/*http://pa.yahoo.com/*http://us.rd.yahoo.com/mail_us/taglines/photos/evt=38088/*http://pg.photos.yahoo.com/ph//page?.file=photobook_splash.html" target="_blank" onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)">
Photo Books</a>. You design it and we'll bind it!
<p></p></span><br>_______________________________________________<br>Bioinformatics.Org general forum  -  <a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="mailto:BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org">BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org
</a><br><a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board" target="_blank">https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board</a><br>
<br><br></blockquote></div><br>