<DIV> </DIV>  <DIV>I think NCBI's map viewer can elp you find neighbouring genes ..... </DIV>  <DIV>Are u looking for an algorithm or just want to map you genes on to genomes and identify their neighbours</DIV>  <DIV> </DIV>  <DIV>-Govind</DIV>  <DIV><BR><BR><B><I>Iddo Friedberg <idoerg@gmail.com></I></B> wrote:</DIV>  <BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">Generally, you can do that by going to the genomic database of choice <BR>for your particular organism. As you have not mentioned which organism <BR>those genes are form, it is rather hard to make a recommendation. <BR>Ensembl, www.fruitfly.org, yeastgenome.org are examples of such <BR>databases for Eukaryotic models.<BR><BR>A list for bacterial projects is available from :<BR><BR>http://www.pasteur.fr/recherche/unites/tcruzi/minoprio/genomics/bacteria.htm<BR><BR><BR>HTH,<BR><BR>Iddo<BR><BR>Pankaj wrote:<BR><BR>>Hi Everybody,<BR>>I have a f
 ew gi
 numbers. I want to find the their neighbouring genes. How can<BR>>I do that?<BR>><BR>>Thanking all in advance<BR>><BR>>Pankaj Khurana<BR>><BR>><BR>>--<BR>>Open WebMail Project (http://openwebmail.org)<BR>><BR>>_______________________________________________<BR>>Bioinformatics.Org general forum - BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org<BR>>https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board<BR>><BR>><BR>> <BR>><BR><BR><BR>-- <BR>Iddo Friedberg, Ph.D.<BR>Burnham Institute for Medical Reseach<BR>10901 N. Torrey Pines Rd.<BR>La Jolla, CA 92037 USA<BR>Tel: +1 (858) 646 3100 x3516<BR>Fax: +1 (858) 713 9949<BR>http://iddo-friedberg.org<BR>http://BioFunctionPrediction.org<BR><BR>_______________________________________________<BR>Bioinformatics.Org general forum - BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org<BR>https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board<BR></BLOCKQUOTE> 
 <DIV><BR></DIV><p>__________________________________________________<br>Do You Yahoo!?<br>Tired of spam?  Yahoo! Mail has the best spam protection around <br>http://mail.yahoo.com