<P>
Dear friends,<BR>
             I am working to study microsatellites. In this regard, I have to generate the <BR>
equivalent classes of repeat motifs. Hence, I request for your assistance by providing me <BR>
the source code, methodology or algorithm in detail / pseudo code. <BR>
Ex: AA,AC,AG,AT,CA,CC,CG,CT,GA,GC,GG,GT,TA,TC,TG,TT :<BR>
            AC : AC,CA,GT,TG<BR>
            AG : AG,GA,CT,TG<BR>
------------------------------------------------------------------<BR>
In addition: For Tri,Tetra,Penta,Hexa Motifs:<BR>
                Ex: ACG,CGA,GAC      AGC,GCA,CAG should be in two seperate classes. But I am <BR>
getting in single class due to the equal nucleotide composition. Please suggest me some <BR>
solution for this and any additional issues explored by you.<BR>
<BR>
          I appreciate your early response, as it is an urgent requirement.<BR>
 <BR>
Thank you very much.<BR>
<BR>
Regads.<BR>
Sravan.  <BR>
<BR>
Dear Bio_Bulletin_Board,<BR>
               This is an urgent requirement. Hence, I request for your early response.<BR>
<BR>
Thanks.<BR>
Sravan.
</P>
<br><br>
<a href="http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/sigclick.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1507191490@Middle5?PARTNER=3"><IMG SRC="http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/sigimpress.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1963059423@Middle5?OAS_query=null&PARTNER=3" BORDER=0 VSPACE=0 HSPACE=0></a>