<br>
Hi !<br>
I got this wierd observation.. not really a problem or error, as BLAST
runs fine and gives me the output .. but something to know about.<br>
<br>
So I format the nucleotide database as normal 'formatdb -i data -p F -o T' .. and this makes all the relevant files.<br>
<br>
However, I noticed that after some BLAST runs, a .index file and
.index.___ also appear !! and the next BLAST runs give this sort of
exception:<br>
<br>
------------- EXCEPTION  -------------<br>
MSG: Can't open cache file data.index: Invalid argument<br>
STACK Bio::DB::Fasta::_open_index /usr/local/lib/perl5/site_perl/5.8.5/Bio/DB/Fasta.pm:502<br>
STACK Bio::DB::Fasta::index_file /usr/local/lib/perl5/site_perl/5.8.5/Bio/DB/Fasta.pm:607<br>
STACK Bio::DB::Fasta::new /usr/local/lib/perl5/site_perl/5.8.5/Bio/DB/Fasta.pm:467<br>
STACK toplevel get_ortho.pl.all:43<br>
<br>
<br>
Any BLAST experts here, who can help !<br>
<br>
thanks ..<br>
~S<br>