I wonder if you couldn't simply download the arabidopsis GO from&nbsp; <a href="ftp://ftp.arabidopsis.org/home/tair/Ontologies/Gene_Ontology/ATH_GO_GOSLIM.20060218.txt">ftp://ftp.arabidopsis.org/home/tair/Ontologies/Gene_Ontology/ATH_GO_GOSLIM.20060218.txt
</a>, import it into (wouuw...) Excel and filter by the 4th field (=GO id)...? The 1st fields would then contain the corresponding gene id. <br><br>Oh. You're not a biologist. So replace Excel by BioPerl or Python or AWK. :-)
<br><br>Take care,<br>Max<br><br><div><span class="gmail_quote">On 21/02/06, <b class="gmail_sendername">Ann Loraine</b> &lt;<a href="mailto:aloraine@gmail.com">aloraine@gmail.com</a>&gt; wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Hi,<br><br>Maybe somebody on the list could point me in the right direction?<br><br>I'm looking for something that takes a list of GO ids and then returns<br>a list of all Arabidopsis 'AGI' codes (gene ids, e.g., AT4G30490 )
<br>that have been annotated with a GO id on the list and/or the child<br>term of any GO term on the list.<br><br>All the best,<br><br>Ann Loraine<br><br>--<br>Ann Loraine<br>Assistant Professor<br>Section on Statistical Genetics
<br>University of Alabama at Birmingham<br><a href="http://www.ssg.uab.edu">http://www.ssg.uab.edu</a><br><a href="http://www.transvar.org">http://www.transvar.org</a><br>_______________________________________________<br>
Bioinformatics.Org general forum&nbsp;&nbsp;-&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org">BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org</a><br><a href="https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board">https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board
</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Maximilian Haeussler, <br>CNRS Gif-sur-Yvette, Paris<br>tel: +33 6 12 82 76 16<br>icq: 3825815&nbsp;&nbsp;-- msn: <a href="mailto:maximilian.haeussler@hpi.uni-potsdam.de">maximilian.haeussler@hpi.uni-potsdam.de
</a> <br>skype: maximilianhaeussler