<p class="MsoNormal" style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><font face="arial,sans-serif">Hi,</font></p>
<p class="MsoNormal" style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><font face="arial,sans-serif"><span style="mso-spacerun: yes">  </span>While analyzing the plot of phi and psi angles on the Ramachandran plot, we found out that there was a lot of overlap between the alpha-helix and beta-sheet regions. By this we mean that just based on the phi and psi angles alpha helices are meant to be both negative, while for beta sheets phi angles take negative values and psi positive. The results we used for generating these plots were obtained from STRIDE and DSSP for top 500 high resolution pdb structures. 
</font></p>
<div class="MsoNormal" style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><font face="arial,sans-serif"><span style="mso-spacerun: yes">  </span>Does anyone have an idea as to what the reason for such an overlap could be? Moreover on further analysis we did see a lot of misclassification particularly related to the pi-helix region (Only about 38% of the residues were classified correctly).We are talking about approximately 40% overlap between the two regions.
</font></div>
<div class="MsoNormal" style="MARGIN: 0in 0in 0pt">  Any feedback on this would be greatly appreciated.</div>
<div class="MsoNormal" style="MARGIN: 0in 0in 0pt">  Thank you,</div>
<div class="MsoNormal" style="MARGIN: 0in 0in 0pt">Vivek</div>