<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
<br>
<br>
<meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
<div align="left">
<div align="center"><span
 style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;">Next week: it's
not too late to register for the Second Gene and Protein Automated
Function Prediction Meeting.</span><br>
<span style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;"></span></div>
<span style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;"><br>
</span><span style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;"></span></div>
<p class="MsoNormal" style="text-align: center;" align="center"><span
 style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;">The Second
Automated Function Prediction Meeting<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-align: center;" align="center"><span
 style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;">August 30 -- </span><st1:date
 month="9" day="1" year="2006"><span
 style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;">Sep 1 2006</span></st1:date><span
 style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;">, </span><st1:place><st1:PlaceType><span
 style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;">to be held at the
University</span></st1:PlaceType><span
 style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;"> of </span><st1:PlaceName><span
 style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;">California</span></st1:PlaceName></st1:place><span
 style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;"> </span><st1:City><st1:place><span
 style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;">San Diego</span></st1:place></st1:City><span
 style="font-size: 14pt; font-family: TimesNewRoman;"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-align: center;" align="center"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-align: center;" align="center"><b><span
 style="font-size: 14pt;"><a class="moz-txt-link-freetext"
 href="http://BioFunctionPrediction.org">http://BioFunctionPrediction.org</a><o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal" style="text-align: justify;"><span
 style="font-size: 11pt; font-family: TimesNewRoman;">Sequence and
structure genomics have generated a wealth of data, but
extracting meaningful information from genomic information is becoming
an
increasingly difficult challenge. Both the number and the diversity of
discovered genes are increasing, and about 40% of known sequences are
tagged as
“unknown function” Automated protein function prediction is rapidly
gaining
interest among computational biologists in academia and industry. The
first
Automated Function Prediction (AFP) meeting was held alongside ISMB
2005, and
gathered together some 100 attendees for a full day of talks, poster
sessions,
and a discussion panel. The second meeting will be a three day event,
August
30-</span><st1:date year="2006" day="1" month="9"><span
 style="font-size: 11pt; font-family: TimesNewRoman;">September 1st ,
2006</span></st1:date><span
 style="font-size: 11pt; font-family: TimesNewRoman;"> at the campus of
UCSD in </span><st1:place><st1:City><span
 style="font-size: 11pt; font-family: TimesNewRoman;">San Diego</span></st1:City><span
 style="font-size: 11pt; font-family: TimesNewRoman;">, </span><st1:State><span
 style="font-size: 11pt; font-family: TimesNewRoman;">California</span></st1:State></st1:place><span
 style="font-family: TimesNewRoman;">.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style=""><span style="font-family: TimesNewRoman;"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">AFP 2006 will
feature:<o:p></o:p></span></p>
<ul style="margin-top: 0in;" type="disc">
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Symbol;"><span style=""> </span></span><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Plenary talks
delivered by leading researchers in the field<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Symbol;"><span style=""> </span></span><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Conference
proceedings published as research papers in BMC Bioinformatics<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Symbol;"><span style=""> </span></span><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Special
discussion panel on gene and protein annotation<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Symbol;"><span style=""> </span></span><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">A poster session<o:p></o:p></span></li>
</ul>
<p class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Keynote speakers:<o:p></o:p></span></p>
<ul style="margin-top: 0in;" type="disc">
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Shoshana Wodak, </span><st1:place><st1:PlaceType><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">University</span></st1:PlaceType><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;"> of </span><st1:PlaceName><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Toronto</span></st1:PlaceName></st1:place><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;"><o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;" lang="IT">Anna
Tramontano, University of Rome, “La Sapienza”<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Russ B. Altman, </span><st1:place><st1:PlaceName><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Stanford</span></st1:PlaceName><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;"> </span><st1:PlaceType><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">University</span></st1:PlaceType></st1:place><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;"><o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Philip E. Bourne,
UC </span><st1:City><st1:place><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">San Diego</span></st1:place></st1:City><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;"><o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Terry
Gaasterland, Scripps Institute of Oceanography<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;" lang="NO-BOK">Steven
E. Brenner, UC Berkeley<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Adam Godzik,
Burnham Institute and UC </span><st1:City><st1:place><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">San Diego</span></st1:place></st1:City><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;"><o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Christos
Ouzounis, European Bioinformatics Institute<o:p></o:p></span></li>
</ul>
<p class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Session topics
include:<o:p></o:p></span></p>
<ul style="margin-top: 0in;" type="disc">
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Function from
sequence.<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Function from
genomic context<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Phylogeny based
methods<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Function from
molecular interactions<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Function from
structure<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Function
prediction using combined methods<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Assessing
function prediction programs<o:p></o:p></span></li>
  <li class="MsoNormal" style=""><span
 style="font-size: 10pt; font-family: TimesNewRoman;">Towards CAFA:
Critical Assessment of Function Annotation<o:p></o:p></span></li>
</ul>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><b>Full program now available</b>:
<a class="moz-txt-link-freetext"
 href="http://biofunctionprediction.org/AFP/afp06/program/">http://biofunctionprediction.org/AFP/afp06/program/</a><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="text-align: center;" align="center"><b><span
 style="font-size: 14pt;"><a class="moz-txt-link-freetext"
 href="http://BioFunctionPrediction.org">http://BioFunctionPrediction.org</a><br>
</span></b></p>
<p class="MsoNormal" style="text-align: center;" align="left"><br>
</p>
<br>
<pre class="moz-signature" cols="72">-- 

Iddo Friedberg, Ph.D.
Burnham Institute for Medical Research
10901 N. Torrey Pines Rd.
La Jolla, CA 92037
Tel: (858) 646 3100 x3516
Fax: (858) 795 5249 ** NEW **
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://iddo-friedberg.org">http://iddo-friedberg.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://BioFunctionPrediction.org">http://BioFunctionPrediction.org</a></pre>
</body>
</html>