Hi, <br>  I have some Agilent microarray data. I am not familiar with the format. (I am more familiar with Affy data). There are some columns named "gProcessedSignal" "rProcessedSignal", "LogRatio", etc. I guess it's more like cDNA with two channels. So should I use the LogRatio value to perform the next step analysis (gene selection, PCA, clustering, etc).  <br><br>  Thanks,<br>  James<br><p>
                <hr size=1>Yahoo! Messenger with Voice. <a href="http://us.rd.yahoo.com/mail_us/taglines/postman1/*http://us.rd.yahoo.com/evt=39663/*http://voice.yahoo.com">Make PC-to-Phone Calls</a> to the US (and 30+ countries) for 2¢/min or less.