wowww !!<br>It was to do with length 10.. . I put in 2 extra spaces and it worked !!<br>Such a popular and heavily used program having these kinds of errors !<br><br>Thanks for the help though :)<br>~S<br><br><div><span class="gmail_quote">

On 11/1/06, <b class="gmail_sendername">Peter Rice</b> <<a href="mailto:pmr@ebi.ac.uk">pmr@ebi.ac.uk</a>> wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">

Samantha Fox wrote:<br>> Hi,<br>><br>> I had a very simple question. The distance matrix I input to<br>> Neighbor-Joining gives error for incorrect input file !<br>><br>> Here is the matrix<br>> dmel    0       13      13      25      29      31      28      34

<br><br>Tricky to find good documentation on this.<br><br>I suggest one or more of the following, depending on what version of phylip (or<br>another package) you are using to read the file.<br><br>Missing header record (should say 12 on the line above the data)

The ID is defined as 10 characters generally in phylip, so it may need a couple of extra spaces to save the ID being "dmel     0" The values are floating point so adding .0 after each one could be useful.

<br>Integers in these files are valid as "replicates" and would make some programs<br>read the file as having only half the distance values on each line.<br><br>Hope that helps,<br><br>Peter Rice<br>_______________________________________________

<br>General Forum at Bioinformatics.Org - <a href="mailto:BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org">BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org</a><br><a href="https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board">https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board

</a><br></blockquote></div><br>