<div>If performance is not a consideration, you may try irobotsoft from <a href="http://irobotsoft.com">http://irobotsoft.com</a>. </div>

<div>It has a visual interface for programming web robots, and also has an ActiveX interface</div>

<div>for programmers. <br> </div>

<div>They have an example 'blastx.irb' for the blast search automation. </div>

<div> </div>

<div>Yours,</div>

<div>rob</div>

<div><span class="gmail_quote">On 11/7/06, <b class="gmail_sendername">Ahmed Moustafa</b> <<a href="mailto:ahmed@pobox.com">ahmed@pobox.com</a>> wrote:</span>

<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">Hi All, Is there some API or an automated method to retrieve the annotation (gene ontology?) of a set of sequences?

I believe BLAST is necessary but after BLASTing the sequences, how can I get the annotations (e.g. cellular component, pathway, biological function...) of (for example) the best hit for each sequence? Your help will be appreciated so much!

<br>Thanks in advance,<br>Ahmed<br><br>_______________________________________________<br>General Forum at Bioinformatics.Org - <a href="mailto:BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org">BiO_Bulletin_Board@bioinformatics.org</a>

<br><a href="https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board">https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bio_bulletin_board</a><br></blockquote></div><br>