To omegamap:No, I expect nothing to see. A remove of the menu icon would be the right thing.<br>To TaxInspector and pedro: No, I don´t want to use it in the moment in anyway.<br><br>What if done was to have a glance of the abilities of biolinux. And I´ve by the way just seen some trivial bugs and send the informations about it to you.<br><br>There is one think that is more important for me:<br><br>I run biolinux as guest in virtualbox. I´ve some problems to get the actual guest additions run.<br>I´ve tried to install the 4.04 guest additions with it´s autorun.sh skript. The installations finished with succes, but causes some visual defects when biolinux starts the next time.<br><br>I have got a indermediate guest addition(4.05) from the developers, but the visual defects happends in the same way.<br><br>When you want to get a look, I´ve filed it in the virtualbox bugtracker(with screenshot):<br><br>http://www.virtualbox.org/ticket/8708<br><br>The problem is, that I think it is not so much a problem with virtualbox, because with the guest additions from the ubuntu repro(3.2) the visual system of the guest works properly.<br>I´ve also tried to get biolinux upgraded to the ubuntu 10.10 version to get a newer guest addition, but exept from a problem with blcr(I just deleted the package, than it works), it transform biolinux in a not bootable state.<br><br>Why all of this:<br>I need some newer guest additions, because I have a bulk of genome data on my host system and want to get acces to this from biolinux with the virutalbox share folder. A run with the 3.2 additions seems not to be a great idea, but I will try it in the next hours I think(last nearby option). <br><br>When you have an idea to get this running or bring a adapted version of the additions up to your repro, it would be great.<br><br><br><br><br><br><br>----- Ursprüngliche Nachricht -----<br>Von: Tim Booth &lt;tbooth@ceh.ac.uk&gt;<br>Datum: Donnerstag, 7. April 2011, 13:30<br>Betreff: Re: [Bio-linux-dev] Some broken programs<br>An: Bio-Linux technical discussion &lt;bio-linux-dev@nebclists.nerc.ac.uk&gt;<br><br>&gt; Hi,<br>&gt; <br>&gt; Many thanks for the bug reports.&nbsp; I'm aware that several <br>&gt; bits of<br>&gt; software are now out of date but most of these problems are new <br>&gt; to me.<br>&gt; <br>&gt; &gt; The programs that are affected are:<br>&gt; &gt; pfaat: there is a missing java file needed for starting,<br>&gt; <br>&gt; This was an issue with in /usr/share/applications/pfaat.desktop giving<br>&gt; the wrong path to javaws - I've updated the package.<br>&gt; <br>&gt; &gt;&nbsp; omegamap:there is no starting<br>&gt; <br>&gt; I think the icon needs to be removed altogether, as OmegaMap now needs<br>&gt; to be run from the command line.&nbsp; Would you expect to see <br>&gt; anything when<br>&gt; running OmegaMap from the menu?<br>&gt; <br>&gt; &gt; sequin:it is older than a year<br>&gt; <br>&gt; OK, I may remove this entirely as Webin is our favoured way to <br>&gt; do INSDC<br>&gt; submissions now.<br>&gt; <br>&gt; &gt; TaxInspector:failed to fetching date on startup and is not in the<br>&gt; &gt; documentation<br>&gt; <br>&gt; I need to sort out a new download mirror for the files to make <br>&gt; this work<br>&gt; again, but TaxInspector is fairly useless as it stands.&nbsp; <br>&gt; Unless you want<br>&gt; to use it with Pedro?<br>&gt; <br>&gt; &gt;&nbsp; tetra: is not in the documentation.<br>&gt; <br>&gt; OK, I'll look into this.<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; Cheers,<br>&gt; <br>&gt; TIM<br>&gt; <br>&gt; -- <br>&gt; Tim Booth &lt;tbooth@ceh.ac.uk&gt;<br>&gt; NERC Environmental Bioinformatics Centre <br>&gt; <br>&gt; Centre for Ecology and Hydrology<br>&gt; Maclean Bldg, Benson Lane<br>&gt; Crowmarsh Gifford<br>&gt; Wallingford, England<br>&gt; OX10 8BB <br>&gt; <br>&gt; http://nebc.nerc.ac.uk<br>&gt; +44 1491 69 2705<br>&gt; <br>&gt; -- <br>&gt; This message (and any attachments) is for the recipient only. NERC<br>&gt; is subject to the Freedom of Information Act 2000 and the contents<br>&gt; of this email and any reply you make may be disclosed by NERC unless<br>&gt; it is exempt from release under the Act. Any material supplied to<br>&gt; NERC may be stored in an electronic records management system.<br>&gt; <br>&gt; _______________________________________________<br>&gt; Bio-Linux-dev mailing list<br>&gt; Bio-Linux-dev@nebclists.nerc.ac.uk<br>&gt; http://nebclists.nerc.ac.uk/mailman/listinfo/bio-linux-dev