<div dir="ltr"><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;My name is Roy Lee. With Hunter College in New York city.</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;When I am running a blast search from the command line for a protein fasta</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;file, I keep getting asked where the nr reference database is. May you please</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;let me know what I need to do to access that database on my blast search? I</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;don\&#39;t think I should be downloading a 15GB database onto my ubuntu VM.</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;I\&#39;m in the ubuntu terminal  , so far, I\&#39;ve written</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;$ blastp -query PROTEIN SEQ.fa -db $blastdb/nr -out PROTEIN SEQ.blast</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;I keep getting the error message that the nr database is non-existent. Would</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;you happen to know where this database is? Thanks.</span><br style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">&gt; &gt;Thanks for your help.</span><br></div>