<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-size:small;color:rgb(11,83,148)">Hi,<br><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small;color:rgb(11,83,148)">I upgraded a new installation of Bio-Linux (my desktop - a Dell ystem with 2x i7 processor) to BioLinux 8.0.8 as per instruction provided. Everything works well. So, most probably I will upgrade my BioLinux servers as well. However, while running 'apt-get update' I get the following errors. Can anyone  explain what is happenning here?<br><br><br><span style="color:rgb(0,0,0)"><br>Ign <a href="http://dl.google.com">http://dl.google.com</a> stable InRelease<br>Ign <a href="http://dl.google.com">http://dl.google.com</a> stable InRelease<br>Ign <a href="http://extras.ubuntu.com">http://extras.ubuntu.com</a> trusty InRelease<br>Ign <a href="http://nebc.nerc.ac.uk">http://nebc.nerc.ac.uk</a> unstable InRelease<br>Ign <a href="http://www.stats.bris.ac.uk">http://www.stats.bris.ac.uk</a> trusty/ InRelease<br>Ign <a href="http://archive.ubuntu.com">http://archive.ubuntu.com</a> trusty InRelease<br>Ign <a href="http://nebc.nerc.ac.uk">http://nebc.nerc.ac.uk</a> unstable/bio-linux Translation-en_IN<br>Ign <a href="http://extras.ubuntu.com">http://extras.ubuntu.com</a> trusty/main Translation-en_IN<br>Ign <a href="http://dl.google.com">http://dl.google.com</a> stable/main Translation-en_IN<br>Ign <a href="http://nebc.nerc.ac.uk">http://nebc.nerc.ac.uk</a> unstable/bio-linux Translation-en<br>Ign <a href="http://extras.ubuntu.com">http://extras.ubuntu.com</a> trusty/main Translation-en<br>Ign <a href="http://dl.google.com">http://dl.google.com</a> stable/main Translation-en<br>Ign <a href="http://www.stats.bris.ac.uk">http://www.stats.bris.ac.uk</a> trusty/ Translation-en_IN<br>Ign <a href="http://www.stats.bris.ac.uk">http://www.stats.bris.ac.uk</a> trusty/ Translation-en<br>Ign <a href="http://archive.ubuntu.com">http://archive.ubuntu.com</a> trusty/main Translation-en_IN<br>Ign <a href="http://archive.ubuntu.com">http://archive.ubuntu.com</a> trusty/multiverse Translation-en_IN<br>Ign <a href="http://archive.ubuntu.com">http://archive.ubuntu.com</a> trusty/restricted Translation-en_IN<br>Ign <a href="http://archive.ubuntu.com">http://archive.ubuntu.com</a> trusty/universe Translation-en_IN<br>W: Failed to fetch <a href="http://dl.google.com/linux/chrome/deb/dists/stable/Release">http://dl.google.com/linux/chrome/deb/dists/stable/Release</a>  Unable to find expected entry 'main/binary-i386/Packages' in Release file (Wrong sources.list entry or malformed file)<br><br>E: Some index files failed to download. They have been ignored, or old ones used instead</span>.<br><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small;color:rgb(11,83,148)">However, I am not sure whether this is a new phenomenon that can be linked with BioLinux 8.0.8 or it existed earlier too.<br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small;color:rgb(11,83,148)"><br>Mahendra<br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small;color:rgb(11,83,148)"><br></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">________________________<div><font color="#073763"><b>Prof. Mahendra K Modi</b></font><div><font color="#073763"><b>Head, Agril Biotechnology & Coordinator, DIC</b></font></div><div><font color="#073763"><b>Assam Agricultural University</b></font></div><div><font color="#073763"><b>Jorhat 785013, India</b></font></div><div><br></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Tue, Aug 8, 2017 at 4:44 PM, Tony Travis <span dir="ltr"><<a href="mailto:tony.travis@minke-informatics.co.uk" target="_blank">tony.travis@minke-informatics.co.uk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">On 08/08/17 11:57, Timms-Wilson, Tracey wrote:<br>
<span class="">>> -----Original Message-----<br>
>> From: Steffen Hin [mailto:<a href="mailto:hinz@biochemie-tud.de">hinz@biochemie-tud.de</a>]<br>
>> Sent: 24 July 2017 13:57<br>
>> To: Timms-Wilson, Tracey <<a href="mailto:tmt@ceh.ac.uk">tmt@ceh.ac.uk</a>>; Timms-Wilson, Tracey<br>
>> <<a href="mailto:tmt@ceh.ac.uk">tmt@ceh.ac.uk</a>><br>
>> Subject: New contact form received<br>
>><br>
>><br>
>> You have received a new contact form message.<br>
</span>>> Name : Steffen Hinz<br>
>> Email : <a href="mailto:hinz@biochemie-tud.de">hinz@biochemie-tud.de</a><br>
>> Message : Hi,<br>
>> I just want to know if it is planned to release BioLinux on a newer Ubuntu<br>
>> version (for example 16.04) in the near future.<br>
<br>
Hi, Steffen.<br>
<span class=""><br>
Tracey forwarded your email to me and I've CC'ed it to the Bio-Linux<br>
</span>mailing list in case anyone else has the same question.<br>
<br>
I've already upgraded several Bio-Linux 8.0.7 machines to Ubuntu 16.04<br>
LTS, but broken packages dependencies mean that a lot of work will be<br>
needed to get everything working. At present, we are seeking funding to<br>
do the necessary work.<br>
<br>
The Bio-Linux 8.0.8 point-release that my student Will McCaffery has<br>
been working on will address the main problem with the 'old' Linux<br>
kernel in the current Bio-Linux 8.0.7. However, this will make no<br>
difference to a Bio-Linux 8.0.7 instance installed to disk if you keep<br>
Bio-Linux up-to-date (i.e. not running it from a USB-stick) because it<br>
will then have the same kernel and updated packages as the new 8.0.8:<br>
<br>
  # login to an installed Bio-Linux instance and open a terminal<br>
  sudo -i<br>
  apt update<br>
  apt full-upgrade<br>
  apt-get autoremove<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
HTH,<br>
<br>
  Tony.<br>
<br>
--<br>
Minke Informatics Limited, Registered in Scotland - Company No. SC419028<br>
Registered Office: 3 Donview, Bridge of Alford, AB33 8QJ, Scotland (UK)<br>
tel. +44(0)19755 63548                    <a href="http://minke-informatics.co.uk" rel="noreferrer" target="_blank">http://minke-informatics.co.uk</a><br>
mob. +44(0)7985 078324        mailto:<a href="mailto:tony.travis@minke-informatics.co.uk">tony.travis@minke-<wbr>informatics.co.uk</a><br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Bio-Linux-list mailing list<br>
<a href="mailto:Bio-Linux-list@bioinformatics.org">Bio-Linux-list@bioinformatics.<wbr>org</a><br>
<a href="http://www.bioinformatics.org/mm/listinfo/bio-linux-list" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.bioinformatics.org/<wbr>mm/listinfo/bio-linux-list</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>