<HTML>
<HEAD>
<TITLE>Oh, one other thing</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<BLOCKQUOTE><FONT FACE="Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:12.0px'>To implement "savability" we would just have to implement the NSCoding protocol, that allows you to save arrays/dictionaries to contain these objects. Although it would perhaps be nice if there was a method to output these to some kind of plist like format in addition.  <BR>
</SPAN></FONT></BLOCKQUOTE><FONT FACE="Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:12.0px'><BR>
Actually, I’d argue against having this be the primary way we store things.  Coding is a way of storing objects, and is only useful to other Cocoa programs.  What I’d like to create is a format that’s also useful outside of BioCocoa, so that it’s useful on other platforms, using other frameworks, in other programming languages, etc.<BR>
<BR>
In the end, pretty much everything else out there views sequence information as a string of single-character symbols – there’s no reason our primary storage mechanism shouldn’t be the same way, to ensure maximal interoperability.<BR>
<BR>
John<BR>
<BR>
By the way, I notice I’m presenting a lot of arguments for or against things.  I want to make sure that those who do not have English as their primary language recognize that when I use the term “argue” I mean it in the sense of presenting a compelling reason, rather than the sense of  getting in an upset yelling match ;)<BR>
<BR>
<BR>
_______________________________________________<BR>
This mind intentionally left blank<BR>
</SPAN></FONT>
</BODY>
</HTML>