<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">
Hi both!<br><div><div>On Sep 12, 2007, at 2:39 AM, Koen van der Drift wrote:</div><blockquote type="cite"><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><br></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Welcome to the BioCocoa team! It's good to see some new blood in the project, and to know that there is still interest in the framework.</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><br></div></blockquote><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div>Is the BioCocoa project still "alive"? Don't get me wrong, I've received the last mail from the mailing list in... may 2007! How many people are involved?</div><br><blockquote type="cite"><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Not sure if you already found this info on our wiki page, but here you can read about how to commit files to the project:</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><br></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><a href="http://bioinformatics.org/biococoa/wiki/pmwiki.php?n=Main.AddingFiles">http://bioinformatics.org/biococoa/wiki/pmwiki.php?n=Main.AddingFiles</a></div></blockquote><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div>I'm going to read! Thanks</div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><blockquote type="cite"><blockquote type="cite"><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><br></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">As for testing, there is a target in the Xcode project called "Test - BCFoundation" which tests some of the classes, it is not a comprehensive test suite but it does check a number of things.<span class="Apple-converted-space">  </span>If you build that target, it automatically runs the tests; you can see the output of the tests in the Build Results windows, specifically the Build Transcripts view in the middle section.<span class="Apple-converted-space">  </span>I don't believe there are any BCSequenceReader tests yet, maybe you would like to donate the first one with a simple test for the macvector format?</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "></div></blockquote></blockquote><br></div><div>I have ony two demos in Xcode targets. They both work, I can import MacVector protein and nucleotide sequences. </div><div>Give me time to implement "features&annotations parsing" then I can think about a real-world test. Oh, consider that I have less than 30 minutes a day to dedicate to BioCocoa :-)</div><div><br></div><div>d</div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div> <span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-align: auto; -khtml-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -apple-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-align: auto; -khtml-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -apple-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">/*</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Davide Cittaro</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">HPC and Bioinformatics Systems @ Informatics Core</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; min-height: 14px; "><br></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">IFOM - Istituto FIRC di Oncologia Molecolare</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">via adamello, 16</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">20139 Milano</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Italy</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; min-height: 14px; "><br></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">tel.: +39(02)574303007</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">e-mail:<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:davide.cittaro@ifom-ieo-campus.it"><font class="Apple-style-span" color="#0011ED"><span class="Apple-style-span" style="color: rgb(0, 17, 237); -khtml-text-decorations-in-effect: underline; "><span class="Apple-style-span" style="color: rgb(0, 17, 237); -khtml-text-decorations-in-effect: underline; ">davide.cittaro@ifom-ieo-campus.it</span></span></font></a></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">*/</div><br class="Apple-interchange-newline"></span></span> </div><br></body></html>