<table cellspacing='0' cellpadding='0' border='0' ><tr><td valign='top' style='font: inherit;'>Hi Scott,<br>How can I combine all the suffix array files for an organism into a single suffix array so that mcp_sarray is just run once?<br>I'd like to compare two sarray files for each two organisms comparison such as human vs mouse...<br>thanks<br><br><br><br>--- <b>Lun 14/7/08, Scott Christley <i><schristley@mac.com></i></b> ha scritto:<br><blockquote style="border-left: 2px solid rgb(16, 16, 255); margin-left: 5px; padding-left: 5px;">Da: Scott Christley <schristley@mac.com><br>Oggetto: Re: [Biococoa-dev] Biococoa2 Install issue<br>A: paolo_siniselli@yahoo.it<br>Cc: "biococoa" <biococoa-dev@bioinformatics.org><br>Data: Lunedì 14 luglio 2008, 23:27<br><br><div id="yiv2007688281">Hello Paolo,<div><br></div><div>There is an environment configuration script that comes with GNUstep, you need to "source" this script to setup the GNUstep
 environment before compiling or running applications.  Maybe something like this:</div><div><br></div><div>. /usr/share/GNUstep/Makefiles/GNUstep.sh<br></div><div><br></div><div>As a side note, some of the reports I've heard from people is that the GNUstep which comes with Debian is old and has bugs, I cannot say how well it will work with BioCocoa.</div><div><br></div><div>cheers</div><div>Scott</div><div><br></div><div><br></div><div><div>On Jul 14, 2008, at 2:06 PM, paolo siniselli wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td style="font-family: inherit; font-style: inherit; font-variant: inherit; font-weight: inherit; font-size: inherit; line-height: inherit; font-size-adjust: inherit; font-stretch: inherit;" valign="top">I'm trying to install BioCocoa2 on my Linux Debian (Lenny)<br>I've already installed GNUstep<br>So I went into truck/GNUstep folder
 and I typed "make install" but I received an error back:<br>GNUmakefile:27: *** You need to run the GNUstep configuration script before compiling!.  Stop.<br><br>Those are the files in GNUstep directory:<br>aminoacids.plist  GNUmakefile.postamble  GNUmakefile.subproj<br>GNUmakefile       GNUmakefile.preamble   nucleotides.plist<br><br>And those are the file in truck direcotry:<br>BCAppKit           BioCocoa.xcodeproj  Examples     Publications.txt<br>BCFoundation       Copying.txt         GNUstep      Readme.txt<br>BC.icns            DeveloperDocs       license.txt  Resources<br>BioCocoa_Prefix.h 
 Documentation       main.c       Tests<br><br>Thanks<br>Paolo<br></td></tr></tbody></table><br>       <hr size="1"> Posta, news, sport, oroscopo: tutto in una sola pagina<br> <a rel="nofollow" target="_blank" href="http://us.rd.yahoo.com/mailuk/taglines/isp/control/*http://us.rd.yahoo.com/evt=52437/*http://www.yahoo.it/latuapagina">Crea l'home page che piace a te!</a>._______________________________________________<br>Biococoa-dev mailing list<br><a rel="nofollow" target="_blank" href="mailto:Biococoa-dev@bioinformatics.org">Biococoa-dev@bioinformatics.org</a><br><a rel="nofollow" target="_blank" href="http://www.bioinformatics.org/mailman/listinfo/biococoa-dev">http://www.bioinformatics.org/mailman/listinfo/biococoa-dev</a><br></blockquote></div><br></div></blockquote></td></tr></table><br>



      <hr size=1>
Posta, news, sport, oroscopo: tutto in una sola pagina<br> <a  
href="http://us.rd.yahoo.com/mailuk/taglines/isp/control/*http://us.rd.yahoo.com/evt=52437/*http://www.yahoo.it/latuapagina" target=_blank>Crea l'home page che piace a te!</a>.