[MeltSim] Meltsim - Explanations

J.W. Bizzaro jeff at bioinformatics.org
Thu Jun 11 17:53:09 EDT 2009


Hi Arnaud,

Here's what the files are for:

.mlt - x,y derivative plot (melting curve)
.pro - x,y,z plot showing the integral (non-derivative) plot for each melting domain
.pos - x,y plot showing just the 50% theta (denatured) point for each melting domain

None of these files are plots in themselves.  They need to be plotted by a graphing program, such gnuplot.  The .pro file produces a unique plot, shown in the screenshot on the Web page for the Windows version, so I made the graphing application that comes with the Windows version.  The application can also display .pro superimposed with .mlt (as in the screenshot).

As for Tm, the graphing application in the Windows version has an option to show that.  The .log file shows Tm in the command-line version.

Cheers,
Jeff

Arnaud LECLERE wrote:
> Dear,
>  
> I work currently about HRM technology since 7 month, and  i try to works 
> with your program MeltSim since 3 weeks.
> I work with it, on Windows  and on Ubuntu.
>  
> With the Windows program, i have a problem, the program create the 3 
> files, *.pos *.mlt and *.pro but doesn't arrive to represente the 
> graphic curves...
>  
> With the Ubuntu program, no problem, the program create the 3 files, but 
> i don't know what to do after !
> I think the *.mlt file represente the Tm, but the two other files...i 
> don't know.
>  
> Could you help me, in explicate quickly what represente each file and 
> please how to create the different graphic with these files.
>  
>  
> Best Regards.
>  
> 
> Arnaud LECLÈRE
> EURALIS COOP
> Avenue Gaston Phoebus
> 64231 LESCAR CEDEX
> Tél : 05 59 92 54 47 / fax : 05 59 92 39 89
> http://www.euralis.fr <http://www.euralis.fr/>
> 
> Ce message et ses éventuelles pièces jointes contiennent des 
> informations strictement confidentielles et/ou privilégiées et sont 
> exclusivement destines aux personnes désignées ci-dessus comme 
> destinataire. Si vous n’êtes pas destinataire de ce message, il vous est 
> interdit de le copier, de le faire suivre, de le divulguer ou d’en 
> utiliser tout ou partie. Si vous avez reçu ce message par erreur, merci 
> de le supprimer de votre système, ainsi que toutes ses copies, et d’en 
> avertir immédiatement l’expéditeur par message de retour. Il est 
> impossible de garantir que les communications par messagerie 
> électronique arrivent en temps utile, sont sécurisées ou dénuées de 
> toute erreur ou virus. En conséquence, l’expéditeur n’accepte aucune 
> responsabilité du fait des erreurs, omissions ou préjudices qui 
> pourraient en résulter.
> 
> 
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J.W. Bizzaro
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