Ok adding something to that I just found that they provide the data in RDF format:<br><br><a href="http://dev.isb-sib.ch/projects/uniprot-rdf/">http://dev.isb-sib.ch/projects/uniprot-rdf/</a><br><a href="ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/rdf/">ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/rdf/</a><br>
<br>Now, I don&#39;t know much about RDF but that seems to be almost the solution. There must be standard tools out there to go from RDF to relational, aren&#39;t there?<br><br>Jose<br><br><br><br><div class="gmail_quote">
On 17 March 2010 14:37, Jose M. Duarte <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:jose.m.duarte@gmail.com">jose.m.duarte@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Not exactly belonging to this list, but I thought it was an easy way to reach all of you together :-)<br><br>I am after having a local copy of the Uniprot Knowledge Base in relational db format. I remember that Dan had something like this running locally before. <br>

<br>The data seems to be available here:<br><br><a href="http://www.uniprot.org/downloads" target="_blank">http://www.uniprot.org/downloads</a><br><br>in a nice XML format, plus the schema is also available. So really converting it into a database should be pretty straight forward.<br>

<br>Somebody knows of tools to do this?<br><br>Cheers<br><font color="#888888"><br>Jose<br>
</font></blockquote></div><br>