Hi all<br><br>I&#39;ve checked in an updateUniprot.sh script (scripts directory) that grabs the uniprot sequence files from the uniprot ftp if there are new ones and then runs formatdb (for blasting) on them. It should work nicely as a daily cronjob, it will only download a new version if one is available (a release happens about every 3 weeks for uniprot). Beware that the uniprot sequence files are quite big  (4.7GB uncompressed this week) and growing exponentially! Maybe we should think about having uniref as well (i.e. non-redundant version of uniprot)<br>
<br>Enjoy<br><br>Jose<br>