Actually just tried commenting out the conditional expression and links are fine now! So basically we have the normal wgScriptPath=""<br><br>I don't understand why though! so don't ask me ;)<br><br>Jose<br>
<br><br><br><br><br><div class="gmail_quote">On 17 December 2010 23:52, Dan Bolser <span dir="ltr"><<a href="mailto:dan.bolser@gmail.com">dan.bolser@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
<div class="im">On 17 December 2010 21:33, Jose M. Duarte <<a href="mailto:jose.m.duarte@gmail.com">jose.m.duarte@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Ooops there is a problem, just realised by chance. All links on the Main<br>
> Page are like<br>
><br>
> <a href="http://pdbwiki.org/%7Ehstehr/pdbwiki/mediawiki-1.15/index.php/2pdt" target="_blank">http://pdbwiki.org/~hstehr/pdbwiki/mediawiki-1.15/index.php/2pdt</a><br>
><br>
> So they don't work at all. Links in other pages seem to be fine.<br>
><br>
> Could this have something to do with that conditional expression for<br>
> wgScriptPath? First thing that comes to mind<br>
<br>
</div>Yeah, that sprang to my mind too... however, the links work fine for<br>
me. I just clicked the one in this email and it get re-written to the<br>
appropriate new URL (which is weird).<br>
<br>
I remember this from last time, but (naturally) I have forgotten what<br>
triggers it / how to control it... I think it's todo with the short<br>
url scheme...<br>
<br>
<a href="http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Short_URL" target="_blank">http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Short_URL</a><br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
> Jose<br>
><br>
><br>
><br>
> On 17 December 2010 20:11, Dan Bolser <<a href="mailto:dan.bolser@gmail.com">dan.bolser@gmail.com</a>> wrote:<br>
>><br>
>> On 17 December 2010 18:47, Jose M. Duarte <<a href="mailto:jose.m.duarte@gmail.com">jose.m.duarte@gmail.com</a>> wrote:<br>
>> > Nice one! thanks for the good work.<br>
>> ><br>
>> > Next thing will be to test the update pipeline. Let's see if it works<br>
>> > from<br>
>> > MPI this coming Monday. If it does we can then start testing it from<br>
>> > bio.cc<br>
>><br>
>> It was running in this mode previously iirc, so it *should* work ;-)<br>
>><br>
>><br>
>> Cheers Jose!<br>
>> Dan.<br>
>><br>
>> > Jose<br>
>> ><br>
>> ><br>
>> ><br>
>> > On 17 December 2010 18:44, Dan Bolser <<a href="mailto:dan.bolser@gmail.com">dan.bolser@gmail.com</a>> wrote:<br>
>> >><br>
>> >> Seems the DNS records have finally updated, and <a href="http://PDBWiki.Org" target="_blank">http://PDBWiki.Org</a> is<br>
>> >> now being served from the httpd://<a href="http://bifx.org" target="_blank">bifx.org</a> httpd server.<br>
>> >><br>
>> >> So far everything looks good!<br>
>> >><br>
>> >><br>
>> >> It took me longer than expected to decipher the Apache configuration<br>
>> >> on dallas0 (even though I have used it in anger several times before).<br>
>> >> To help, I've updated some of the information here:<br>
>> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="http://www.bioinformatics.org/wiki/Bioinformatics.Org_Wiki:Configuration" target="_blank">http://www.bioinformatics.org/wiki/Bioinformatics.Org_Wiki:Configuration</a><br>
>> >><br>
>> >><br>
>> >> I particularly like this nugget of information:<br>
>> >><br>
>> >> /var/log/httpd -> /etc/httpd/logs<br>
>> >> /etc/httpd -> /usr/local/apache<br>
>> >> /usr/local -> /home/local<br>
>> >><br>
>> >><br>
>> >> which I should probably describe with examples like the .config file<br>
>> >> redirects, but you get the general idea ;-)<br>
>> >><br>
>> >><br>
>> >> Please let me know if you find any problems.<br>
>> >><br>
>> >> Dan.<br>
>> >><br>
>> >> _______________________________________________<br>
>> >> Pdbwiki-devel mailing list<br>
>> >> <a href="mailto:Pdbwiki-devel@bioinformatics.org">Pdbwiki-devel@bioinformatics.org</a><br>
>> >> <a href="http://www.bioinformatics.org/mailman/listinfo/pdbwiki-devel" target="_blank">http://www.bioinformatics.org/mailman/listinfo/pdbwiki-devel</a><br>
>> >> <a href="http://www.pdbwiki.org" target="_blank">http://www.pdbwiki.org</a><br>
>> ><br>
>> ><br>
><br>
><br>
</div></div></blockquote></div><br>