<a href="http://bifx.org">bifx.org</a><br><br><br><div class="gmail_quote">On 21 December 2010 18:04, Henning Stehr <span dir="ltr"><<a href="mailto:stehr@molgen.mpg.de">stehr@molgen.mpg.de</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
Thanks Jose!<br>
<br>
Did you check in to the SVN on <a href="http://bifx.org" target="_blank">bifx.org</a> or still on talyn?<br>
<br>
Have a good holiday!<br>
<br>
Henning<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
On Tue, Dec 21, 2010 at 5:58 PM, Jose M. Duarte <<a href="mailto:jose.m.duarte@gmail.com">jose.m.duarte@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Hi guys<br>
><br>
> So I've tried for the first time the upload pipeline from bio.cc. I<br>
> basically only needed changing a few hard coded paths and the table names to<br>
> capitals.<br>
><br>
> I've run it testing against <a href="http://pdbwiki.molgen.mpg.de" target="_blank">pdbwiki.molgen.mpg.de</a> (still up) and it worked.<br>
> The thing is that the the pdbwiki.molgen was more up to date than the pdbase<br>
> in bio.cc so it only needed to remove entries, so it's not a full test yet<br>
> (and it's still running now). But it's a start at least. By the way I've<br>
> modified the paths and all that in the repo so if we svn update at the mpimg<br>
> site it will overwrite the files with wrong paths and all that.<br>
><br>
> For the moment we at least have things more or less set-up so that we can<br>
> start running it from bio.cc regularly soon. The cronjob at mpimg is still<br>
> on anyway.<br>
><br>
> For info pipeline files are in /BiO/Store/PDBWiki/ with more or less the<br>
> same layout as before.<br>
><br>
> That's it for now, I'm off home tomorrow. Hope you guys enjoy the holidays!<br>
> (I'll be reading email but less regularly)<br>
><br>
> Jose<br>
><br>
><br>
</div></div>> _______________________________________________<br>
> Pdbwiki-devel mailing list<br>
> <a href="mailto:Pdbwiki-devel@bioinformatics.org">Pdbwiki-devel@bioinformatics.org</a><br>
> <a href="http://www.bioinformatics.org/mailman/listinfo/pdbwiki-devel" target="_blank">http://www.bioinformatics.org/mailman/listinfo/pdbwiki-devel</a><br>
> <a href="http://www.pdbwiki.org" target="_blank">http://www.pdbwiki.org</a><br>
><br>
><br>
</blockquote></div><br>