Hi Eric,<div><br></div><div>Under OS X 10.5 (Lion), Jmol runs on Safari. However it does not run on Firefox or Chrome, both of which state: "You do not have Java applets enabled in your web browser, or your browser is blocking this applet," even though Java is enabled in both browsers.</div>
<div><br></div><div>Cheers,</div><div>Don<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jan 31, 2013 at 3:01 PM, Eric Martz <span dir="ltr"><<a href="mailto:emartz@microbio.umass.edu" target="_blank">emartz@microbio.umass.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">If you are running Snow Leopard (Apple OS X 10.6) you are probably unable to use Proteopedia until further notice. This is because apparently Apple has blocked all java applets (including Jmol, required for Proteopedia) in Snow Leopard, pending a java upgrade not yet released. I am not sure about Leopard, Lion, and Mountain Lion -- I am interested to know!<br>

<br>
When you go to a Jmol-using web page in any web browser on Snow Leopard, you see a small gray "Inactive plug-in" message. When you click that, it runs Apple Software Update, which tells you that you are already up to date -- there is nothing new (yet).<br>

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Here is confirmation<br>
<a href="http://www.usatoday.com/story/tech/2013/01/31/apple-blocks-java-on-macs-due-to-vulnerabilities/1880783/" target="_blank">http://www.usatoday.com/story/<u></u>tech/2013/01/31/apple-blocks-<u></u>java-on-macs-due-to-<u></u>vulnerabilities/1880783/</a><br>

<br>
There is a very technical method for re-enabling java, but apparently you need to do that once a day as Apple will undo it periodically.<br>
<br>
<a href="https://discussions.apple.com/thread/4761112?tstart=0" target="_blank">https://discussions.apple.com/<u></u>thread/4761112?tstart=0</a><br>
<br>
What is blocked are all java applets in Snow Leopard, where the current java is 1.6.0_37.<br>
I can still run the Jmol application in Snow Leopard.<br>
<br>
I don't know about Leopard, Lion, or Mountain Lion -- I'd like reports from people using those.<br>
<br>
Also I can still run java applets/Jmol in Windows.<br>
<br>
Eric<br>
<br>
/* - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -<br>
Eric Martz, Professor Emeritus, Dept Microbiology<br>
U Mass, Amherst -- <a href="http://Martz.MolviZ.Org" target="_blank">http://Martz.MolviZ.Org</a><br>
<br>
Top Five 3D MolVis Technologies <a href="http://Top5.MolviZ.Org" target="_blank">http://Top5.MolviZ.Org</a><br>
FirstGlance, used by Nature - <a href="http://firstglance.jmol.org" target="_blank">http://firstglance.jmol.org</a><br>
3D Wiki with Scene-Authoring Tools <a href="http://Proteopedia.Org" target="_blank">http://Proteopedia.Org</a><br>
Biochem 3D Education Resources <a href="http://MolviZ.org" target="_blank">http://MolviZ.org</a><br>
ConSurf - Find Conserved Patches in Proteins: <a href="http://consurf.tau.ac.il" target="_blank">http://consurf.tau.ac.il</a><br>
Atlas of Macromolecules: <a href="http://atlas.molviz.org" target="_blank">http://atlas.molviz.org</a><br>
Interactive Molecules in Public Spaces <a href="http://MolecularPlayground.Org" target="_blank">http://MolecularPlayground.Org</a><br>
Workshops: <a href="http://workshops.molviz.org" target="_blank">http://workshops.molviz.org</a><br>
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - */<br>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
Proteopedialist-for-users mailing list<br>
<a href="mailto:Proteopedialist-for-users@bioinformatics.org" target="_blank">Proteopedialist-for-users@<u></u>bioinformatics.org</a><br>
<a href="http://www.bioinformatics.org/mailman/listinfo/proteopedialist-for-users" target="_blank">http://www.bioinformatics.org/<u></u>mailman/listinfo/<u></u>proteopedialist-for-users</a><br>
<br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Donald Voet<br>Chemistry Department<br>University of Pennsylvania<br>231 South 34th St.<br>Philadelphia, PA 19104, USA<br>Tel. 215-898-6457<br>Fax 215-573-2112
</div>