Semester 3
Diese Seite enthaelt begleitendes Material fuer die Biochemische Ausbildung im 3. Semester an der Charite.
Es benoetigt Java und schnellen Internetzugang.
Thema 1: Erythrozytenstoffwechsel
Haemoglobin dient als Transporter für Sauerstoff. Es ist ein Heterotetramer.
Laden Sie die AA-Sequenzen der Alpha und Beta Ketten fuer verschiedene Organismen:
Man erkennt, dass die Haemoglobine der Wirbeltiere sehr aehnlich sind.
Histidine sind für die Bindung des Haem Liganden wichtig. Druecken Sie unten
den Knopf "Sequence-features". Es werden die Histidine markiert. Diese Histidine
sind in allen Hemoglobinen vorhanden.
Hemoglobin ist ein Tetramer:
Haemoglobin ist ein helikales Protein.
Erkennen Sie die 4 Haemringe? Aufgrund der
Doppelbindungen ist Haem eine flache Struktur. Die Atome sind SP2
hybridisiert. Wieviel Pyrrol-Ringe sind in einem Haem?
Stickstoffatome sind blau und Sauerstoffatome rot. Wo ist das 2,3-DPG?
Wer einen schnellen PC und ein schnelles Internet hat der kann sich das auch in einem richtigen 3D-Betrachter anschauen:
Alpha und Beta Ketten sind ursprünglich aus einem Gen durch
Genduplikation und Genveränderung entstanden. Zu der Zeit lebte
der gemeinsame Vorfahre der heutigen Saeugetiere.
Ueberlegen Sie, wie sich das im Stammbaum niederschlägt. Genduplikation vor der Artenbildung:
Thema 2: Gerinnung Plasmaproteine
Serine Proteasen
Rolle bei Verdauung (Trypsin, Chymotrypsin), Gerinnung,
Abszess-Bildung (Elastase), Abwehr (Komplement) ....
Die folgende Struktur zeigt eine Serinprotease. Das aktive
Zentrum ist durch einen Liganden markiert. Man sieht
Unterstreichungen der Aminosaeuren des aktiven Zentrums. Der Name
Serin-Protease leitet sich von dem Serin (S) im aktiven Zentrum ab und nicht von der Substratspezifitaet.
Serine Protease Inhibitoren
Drei Serinprotease Inhibitoren sollten sie kennen, weil sie klinisch sehr wichtig sind:
Complement 1-Inhibitor (Mangel - Hereditäres
Angiooedem), ATIII (Mangel - Thromboseneigung) und Antitrypsin
(Mangel - ,
Emphysem). Wenn man die drei Übereinanderlagert oder
aligniert, erkennt man eine deutliche Ähnlichkeit. Helices sind
rot und Beta-Faltblaetter blau.
Thema 4: Immunabwehr
Ein Immunoglobulin G besteht aus 4 Peptidketten: