cluster # 1567

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Anopheles gambiae
cluster # 1567 cluster # 1567 Sequences # 2 consensus # 2

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consensus_1567#0 length = 1214 sequences # 1

consensus_1567#1 length = 678 sequences # 1

consensusID : consensus_1567#0
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Sequences nbr = 1
consensus length = 1214
fasta sequence

                              [CCCGCCGTCTCGTCGTACGTTGCCACCGCACCGGTCGTCAGCAAGTACGTGTCGGCCGGCCCCGCTGTCAGCTATTCCGCTGCCCCGGTGGCCAAGGTTGCCACCTACTCGAGCTATGCGCCCGCTGCCAAGGTCGCGACCTATGCTACCCCCGCCTACGGTTATGCTGCGTCCTATGCTCCGGCCGTGAAGGCAGCTACGCCAGCTACGCACCGGCCACGTCGTACGCCAGCTACGCACCGGCCACGACCTACGCCAGCTACACGCCCGCCGCTAAGGTGGCCTCGTACACCCCGGCCGTCGGTTACGCTGCCTATGCGCCGGCCGCTAAGGTTGCGTACGCCGCGCCTGCCGCCAGCTACGCCAGCTCGTACGCCACCACCTCCAAGCTGGCCTATGCCGCGCCGGCCGTCACCAAGACGGTCGTGTCCGCACCGGCCGTCGCTTCCTACTACTCCGCCCCGGCCGTCACCAAGTACTCGCCCGCCCCGGCCGTGTCGACCGCGTACGTGTCCGCCCCGACCGTCACCAAGTATGCCGCGGCCGGCGTTGCCTATGCCCCGGCCGTCTCGAGCTACGTAGCGCCCTACTCGGCCCAAGCGTACACCCCGGCCGTCAGCAAGTACGTCTCGACGCCCGCCGTCTCCTCGTACTACGCCACGCCCGCCGTCTCGAAGGTAGTGTCCAGCCCGGCGTACGCCTCGTACGTGTCCGCCCCGGCCGTCACCAAGTACGCGTCCGCACCGGCCGTGTCCAGCGCGTACGTTTCCACCCCGGTCGTCAGCAAGACGGCTTACTCTGGCGCTTATCTGGCCGCTCCGGCCGTCGCTAAGGTTGCCACCGCGTACGGACCGGCCGTCGCTTCCTACAGCACTGGCCCGGCCGTTTCGGCCTACAGTACCGGCTCGGCCTACAGTACCGGCTCGGCCTACTCGGGCTACTCCGTCGCTCCGGCCGTCTCGAAGGTAGTTTCGAGCCCAGCCGTCGCTGCCTACAGCACTGGACCGGCTTACTCCAGCTACTCGGTCGCTCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCCACGCCAGCCGTTGCCGCCTATAGTGCCGTCCCTGCCGTCTCCAAGGTCTACTCGACCCCGGCCGTCGCTTCTTACAGTGCCGTCCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCGACCCCGGCCGTTGCTAGCTACAGTGCCAGTCCCGCCTACTCCTCCCTTTCC]

[+] EMBL AG50476              [CCCGCCGTCTCGTCGTACGTTGCCACCGCACCGGTCGTCAGCAAGTACGTGTCGGCCGGCCCCGCTGTCAGCTATTCCGCTGCCCCGGTGGCCAAGGTTGCCACCTACTCGAGCTATGCGCCCGCTGCCAAGGTCGCGACCTATGCTACCCCCGCCTACGGTTATGCTGCGTCCTATGCTCCGGCCGTGAAGGCAGCTACGCCAGCTACGCACCGGCCACGTCGTACGCCAGCTACGCACCGGCCACGACCTACGCCAGCTACACGCCCGCCGCTAAGGTGGCCTCGTACACCCCGGCCGTCGGTTACGCTGCCTATGCGCCGGCCGCTAAGGTTGCGTACGCCGCGCCTGCCGCCAGCTACGCCAGCTCGTACGCCACCACCTCCAAGCTGGCCTATGCCGCGCCGGCCGTCACCAAGACGGTCGTGTCCGCACCGGCCGTCGCTTCCTACTACTCCGCCCCGGCCGTCACCAAGTACTCGCCCGCCCCGGCCGTGTCGACCGCGTACGTGTCCGCCCCGACCGTCACCAAGTATGCCGCGGCCGGCGTTGCCTATGCCCCGGCCGTCTCGAGCTACGTAGCGCCCTACTCGGCCCAAGCGTACACCCCGGCCGTCAGCAAGTACGTCTCGACGCCCGCCGTCTCCTCGTACTACGCCACGCCCGCCGTCTCGAAGGTAGTGTCCAGCCCGGCGTACGCCTCGTACGTGTCCGCCCCGGCCGTCACCAAGTACGCGTCCGCACCGGCCGTGTCCAGCGCGTACGTTTCCACCCCGGTCGTCAGCAAGACGGCTTACTCTGGCGCTTATCTGGCCGCTCCGGCCGTCGCTAAGGTTGCCACCGCGTACGGACCGGCCGTCGCTTCCTACAGCACTGGCCCGGCCGTTTCGGCCTACAGTACCGGCTCGGCCTACAGTACCGGCTCGGCCTACTCGGGCTACTCCGTCGCTCCGGCCGTCTCGAAGGTAGTTTCGAGCCCAGCCGTCGCTGCCTACAGCACTGGACCGGCTTACTCCAGCTACTCGGTCGCTCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCCACGCCAGCCGTTGCCGCCTATAGTGCCGTCCCTGCCGTCTCCAAGGTCTACTCGACCCCGGCCGTCGCTTCTTACAGTGCCGTCCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCGACCCCGGCCGTTGCTAGCTACAGTGCCAGTCCCGCCTACTCCTCCCTTTCC]




>consensus_1567#0
CCCGCCGTCTCGTCGTACGTTGCCACCGCACCGGTCGTCAGCAAGTACGTGTCGGCCGGC
CCCGCTGTCAGCTATTCCGCTGCCCCGGTGGCCAAGGTTGCCACCTACTCGAGCTATGCG
CCCGCTGCCAAGGTCGCGACCTATGCTACCCCCGCCTACGGTTATGCTGCGTCCTATGCT
CCGGCCGTGAAGGCAGCTACGCCAGCTACGCACCGGCCACGTCGTACGCCAGCTACGCAC
CGGCCACGACCTACGCCAGCTACACGCCCGCCGCTAAGGTGGCCTCGTACACCCCGGCCG
TCGGTTACGCTGCCTATGCGCCGGCCGCTAAGGTTGCGTACGCCGCGCCTGCCGCCAGCT
ACGCCAGCTCGTACGCCACCACCTCCAAGCTGGCCTATGCCGCGCCGGCCGTCACCAAGA
CGGTCGTGTCCGCACCGGCCGTCGCTTCCTACTACTCCGCCCCGGCCGTCACCAAGTACT
CGCCCGCCCCGGCCGTGTCGACCGCGTACGTGTCCGCCCCGACCGTCACCAAGTATGCCG
CGGCCGGCGTTGCCTATGCCCCGGCCGTCTCGAGCTACGTAGCGCCCTACTCGGCCCAAG
CGTACACCCCGGCCGTCAGCAAGTACGTCTCGACGCCCGCCGTCTCCTCGTACTACGCCA
CGCCCGCCGTCTCGAAGGTAGTGTCCAGCCCGGCGTACGCCTCGTACGTGTCCGCCCCGG
CCGTCACCAAGTACGCGTCCGCACCGGCCGTGTCCAGCGCGTACGTTTCCACCCCGGTCG
TCAGCAAGACGGCTTACTCTGGCGCTTATCTGGCCGCTCCGGCCGTCGCTAAGGTTGCCA
CCGCGTACGGACCGGCCGTCGCTTCCTACAGCACTGGCCCGGCCGTTTCGGCCTACAGTA
CCGGCTCGGCCTACAGTACCGGCTCGGCCTACTCGGGCTACTCCGTCGCTCCGGCCGTCT
CGAAGGTAGTTTCGAGCCCAGCCGTCGCTGCCTACAGCACTGGACCGGCTTACTCCAGCT
ACTCGGTCGCTCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCCACGCCAGCCGTTGCCGCCTATAGTG
CCGTCCCTGCCGTCTCCAAGGTCTACTCGACCCCGGCCGTCGCTTCTTACAGTGCCGTCC
CGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCGACCCCGGCCGTTGCTAGCTACAGTGCCAGTCCCGCCT
ACTCCTCCCTTTCC

consensusID : consensus_1567#1
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Sequences nbr = 1
consensus length = 678
fasta sequence

                              [CAGATCCCCCGCGTTTTTTCTGGTCCGGCGTTTCGGCCTACAGTACCGGCTCGGCCTACTCGAGCTACTCCGTCGCTCCGGCCGTCTCGAAGGTAGTTTCGAGCCCAGCCGTCGCTGCCTACAGCACTGGACCTGGCTTACTCCAGCTACTCGGTCGCTCCGGCCGTCTCTAAGGTGTACTCCACGCCAGCCGTTGCCGCTATAGTGCCGTCCCTGCCGTCTCCAAGGTCTACTCGACCCCGGCCGTCGCTTCTTACAGTGCCGTCCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCGACCCGGCCGTTGCTAGCTACATGTGCCAGTCCCTGCCTACTCCTCCTACTCTGCCACCCTGGCCGTTGCCTCGTACAGTGCCGTCCCTGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCCACCCTGCCGTCGCTTCGTACAGTGCCGTCCCTGCCGTCTCCAAGGTCTACTCCACGCCGGCCGTTGCCAGCTACAGTGCCGTCCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCGAGCCCTGCCGTCGCTGCTTACAGTGCCGGTCCCGCCTACTCCTCCTACTCGGCCACCCGGCCGTCGCTGCGTACAGCGCCGGTCCAGCCTACTCGGCCTACTCCGTCGCTCCGGCCGTCACCAAGTACGCTACGTCCGGTGTTGCCGGCTACGCCACGTCCGGTGCTACGC]

[+] EMBL AL692850             [CAGATCCCCCGCGTTTTTTCTGGTCCGGCGTTTCGGCCTACAGTACCGGCTCGGCCTACTCGAGCTACTCCGTCGCTCCGGCCGTCTCGAAGGTAGTTTCGAGCCCAGCCGTCGCTGCCTACAGCACTGGACCTGGCTTACTCCAGCTACTCGGTCGCTCCGGCCGTCTCTAAGGTGTACTCCACGCCAGCCGTTGCCGCTATAGTGCCGTCCCTGCCGTCTCCAAGGTCTACTCGACCCCGGCCGTCGCTTCTTACAGTGCCGTCCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCGACCCGGCCGTTGCTAGCTACATGTGCCAGTCCCTGCCTACTCCTCCTACTCTGCCACCCTGGCCGTTGCCTCGTACAGTGCCGTCCCTGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCCACCCTGCCGTCGCTTCGTACAGTGCCGTCCCTGCCGTCTCCAAGGTCTACTCCACGCCGGCCGTTGCCAGCTACAGTGCCGTCCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCGAGCCCTGCCGTCGCTGCTTACAGTGCCGGTCCCGCCTACTCCTCCTACTCGGCCACCCGGCCGTCGCTGCGTACAGCGCCGGTCCAGCCTACTCGGCCTACTCCGTCGCTCCGGCCGTCACCAAGTACGCTACGTCCGGTGTTGCCGGCTACGCCACGTCCGGTGCTACGC]




>consensus_1567#1
CAGATCCCCCGCGTTTTTTCTGGTCCGGCGTTTCGGCCTACAGTACCGGCTCGGCCTACT
CGAGCTACTCCGTCGCTCCGGCCGTCTCGAAGGTAGTTTCGAGCCCAGCCGTCGCTGCCT
ACAGCACTGGACCTGGCTTACTCCAGCTACTCGGTCGCTCCGGCCGTCTCTAAGGTGTAC
TCCACGCCAGCCGTTGCCGCTATAGTGCCGTCCCTGCCGTCTCCAAGGTCTACTCGACCC
CGGCCGTCGCTTCTTACAGTGCCGTCCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCGACCCGGCCGT
TGCTAGCTACATGTGCCAGTCCCTGCCTACTCCTCCTACTCTGCCACCCTGGCCGTTGCC
TCGTACAGTGCCGTCCCTGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCCACCCTGCCGTCGCTTCGTAC
AGTGCCGTCCCTGCCGTCTCCAAGGTCTACTCCACGCCGGCCGTTGCCAGCTACAGTGCC
GTCCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCGAGCCCTGCCGTCGCTGCTTACAGTGCCGGTCCC
GCCTACTCCTCCTACTCGGCCACCCGGCCGTCGCTGCGTACAGCGCCGGTCCAGCCTACT
CGGCCTACTCCGTCGCTCCGGCCGTCACCAAGTACGCTACGTCCGGTGTTGCCGGCTACG
CCACGTCCGGTGCTACGC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_1567#0      CCCGCCGTCTCGTCGTACGTTGCCACCGCACCGGTCGTCAGCAAGTACGTGTCGGCCGGC 60
consensus_1567#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_1567#0      CCCGCTGTCAGCTATTCCGCTGCCCCGGTGGCCAAGGTTGCCACCTACTCGAGCTATGCG 120
consensus_1567#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_1567#0      CCCGCTGCCAAGGTCGCGACCTATGCTACCCCCGCCTACGGTTATGCTGCGTCCTATGCT 180
consensus_1567#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_1567#0      CCGGCCGTGAAGGCAGCTACGCCAGCTACGCACCGGCCACGTCGTACGCCAGCTACGCAC 240
consensus_1567#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_1567#0      CGGCCACGACCTACGCCAGCTACACGCCCGCCGCTAAGGTGGCCTCGTACACCCCGGCCG 300
consensus_1567#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_1567#0      TCGGTTACGCTGCCTATGCGCCGGCCGCTAAGGTTGCGTACGCCGCGCCTGCCGCCAGCT 360
consensus_1567#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_1567#0      ACGCCAGCTCGTACGCCACCACCTCCAAGCTGGCCTATGCCGCGCCGGCCGTCACCAAGA 420
consensus_1567#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_1567#0      CGGTCGTGTCCGCACCGGCCGTCGCTTCCTACTACTCCGCCCCGGCCGTCACCAAGTACT 480
consensus_1567#1      ---------------CAG--ATCCCCCGCGTTTTTTCTGGTCCGGC-GTTTCGGCCTACA 42
                                     * *   ** *   *   *  ** *  ***** **  *    *** 

consensus_1567#0      CGCCCGCCCCGGCCGTGTCGACCGCGTACGTGTCCGCCCCGACCGTCACCAAGTATGCCG 540
consensus_1567#1      GTACCGGCTCGGCCTACTCGAGC---TACTCCGTCGCTCCGGCCGTCTCGAAGGTAGTTT 99
                         *** * *****   **** *   ***     *** *** ***** * ***   *   

consensus_1567#0      CGGCCGGCGTTGCCTATGCCCCGGCCGTCTCGAGCTACGTAGC-GCCCTACTCGGCCCAA 599
consensus_1567#1      CGA--------GCCCA-GCCGTCGCTGCCTACAGCACTGGACCTGGCTTACTCCAGCTAC 150
                      **         *** * ***   ** * **  ***   * * * * * *****   * * 

consensus_1567#0      GCGTACACCCCGGCCGTCAGCAAGTACGTCTCGACGCCCGCCGTCTCCTCGTACTACGCC 659
consensus_1567#1      TCGGTCGCTCCGGCCGTCTCTAAGGTGTACTCCACGCCAGCCGTTGCCGC-TATAGTGCC 209
                       **  * * *********   ***     *** ***** *****  ** * **    ***

consensus_1567#0      ACGCCCGCCGTCTCGAAGGTAGTGTCCAGCCCGGCGTACGCCTCGTACGTGTCCGCCCCG 719
consensus_1567#1      GTCCCTGCCGTCTCCAAGGTCTACTCGACCCCGGCCGTCGCTTCTTACAGTGCCGTCCCG 269
                         ** ******** *****    ** * ******   *** ** ***    *** ****

consensus_1567#0      GCCGTCACCAAGTACGCGTCCGCACCGGCCGTGTCCAGCGCGTACGTTTCCACCCCGGTC 779
consensus_1567#1      GCCGTCTCCAAG-GTGTACTCGACCCGGCCGTTGCTAGC-TACATGTGCCAGTCCCTGCC 327
                      ****** *****   *    **  ********  * ***    * **  *   *** * *

consensus_1567#0      G--TCAGCAAGACGGCTTACTCTGGCGCTTATCTGG--CCGCTCCGGCCGTCGCTAAGGT 835
consensus_1567#1      TACTCCTCCTACTCTGCCACCCTGGCCGTTGCCTCGTACAGTGCCGTCCCTGGCC---GT 384
                         **  *          ** *****  **  ** *  * *  *** ** * **    **

consensus_1567#0      TGCCACCGCGTACG--GACCGGCCGTCGCTTCCTACAGCACTGGCCCGGCCGTTTCGGCC 893
consensus_1567#1      CTCCAAGGTGTACTCCACCCTGCCGTCGCTTCGTACAGTGCCGTCCCTGCCGTCTC---- 440
                        ***  * ****     ** *********** *****  * * *** ***** **    

consensus_1567#0      TACAGTACCGGCTCGGCCTACAGTACCGGCTCGGCCTACTCGGGCTACTCCGTCGCTCCG 953
consensus_1567#1      -----------CAAGGTCTACTCCACG---CCGGCCGTTGCCAGCTACAGTGCCGTCCCG 486
                                 *  ** ****   **     *****    *  *****   * **  ***

consensus_1567#0      GCCGTCTCGAAGGTAGTTTCGAGCCCAGCCGTCGCTGCCTACAGCACTGGACCGGCTTAC 1013
consensus_1567#1      GCCGTCTCCAAGGTGTACTCGAGCCCTGCCGTCGCTGCTTACAGTGCCGGTCCCGCCTAC 546
                      ******** *****    ******** *********** *****  * ** ** ** ***

consensus_1567#0      TCCAGCTACTCGGTCGCTCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCCACGCCAGCCGTTGCCGCC 1073
consensus_1567#1      TCCTCCTACTCGGCCAC-CCGGCCGTCGCTGCGTACAGCGCCGGTCCAGCCTACTCGGCC 605
                      ***  ******** * * ********* *   *     * **   ******    * ***

consensus_1567#0      TATAGTGCCGTCCCTGCCGTCTCCAAGGTCTACTCGACCCCGGCCGTCGCTTCTTACAGT 1133
consensus_1567#1      TACTCCGTCGCTCCGGCCGTCACCAAG---TACGCTACGTCCGGTGTTGCCGGCTAC-GC 661
                      **    * **  ** ****** *****   *** * **  * *  ** **    *** * 

consensus_1567#0      GCCGTCCCGGCCGTCTCCAAGGTGTACTCGACCCCGGCCGTTGCTAGCTACAGTGCCAGT 1193
consensus_1567#1      CACGTCCGGTGCTACGC------------------------------------------- 678
                        ***** *  *  * *                                           

consensus_1567#0      CCCGCCTACTCCTCCCTTTCC 1214
consensus_1567#1      ---------------------