cluster # 2324

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Anopheles gambiae
cluster # 2324 cluster # 2324 Sequences # 2 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_2324#0 length = 680 sequences # 1

consensus_2324#1 length = 637 sequences # 1

consensusID : consensus_2324#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 680
fasta sequence

                              [CCGCCCACGCGTCCGCTCTTTTCTTTTTAATCCACTTCCAACTGCGTTACGTCCTTCCATCTATGGATGGTTTAGGTATCCGGGACGTGATGAGCGCGAACGAAGTGTCGGTAGCTACGGAGGTGCCAAGCAATCGGCGGACTTTGGCGAAGGAGGGGAGCATCATATGCAGCATCCGAACGTACCGCCTGGCGGCGAGCAACGGCACAGAACAAGCCGACAGTCCAGCCGGCAATCTTCTCCGATGGGTGGTGCTCATCAGCAAGGCGTCGGACATCAAGATCCTGCGCAGCGTGGTAGGGAGGGTGAGTGGCCAGAACACACTGACGATCCCGCCTACCACCACCAACACCATCAGCAACAGCAACAGCATCACGCTGATCGGCCGAGTCCCGAGTCGAAGGGCGCCCGCGGTACGTCCGAACAGCGGCCAGCGTCAATGGCCAGCGGTAGTCACGGTCGGGGAAGATCACGTTCGCGCGACCGCAAGCGCCCTCCCCCGCACCGGGGCAGGTCAGGACGGGTCTGATCGGGATGGTGCGGACCGCAGAAGGCACCGATCGAAACGTTCCGAGTCGGCGGAGCGGCACGAACGATCGAACCGAGGCTCCCGTTCGGCTGGGCGGCGGCGGTGAACATGAGCGGGACAAGCAGGACCGCAAACATCAGCCCTCGGAGAA]

[+] EMBL BM598081             [CCGCCCACGCGTCCGCTCTTTTCTTTTTAATCCACTTCCAACTGCGTTACGTCCTTCCATCTATGGATGGTTTAGGTATCCGGGACGTGATGAGCGCGAACGAAGTGTCGGTAGCTACGGAGGTGCCAAGCAATCGGCGGACTTTGGCGAAGGAGGGGAGCATCATATGCAGCATCCGAACGTACCGCCTGGCGGCGAGCAACGGCACAGAACAAGCCGACAGTCCAGCCGGCAATCTTCTCCGATGGGTGGTGCTCATCAGCAAGGCGTCGGACATCAAGATCCTGCGCAGCGTGGTAGGGAGGGTGAGTGGCCAGAACACACTGACGATCCCGCCTACCACCACCAACACCATCAGCAACAGCAACAGCATCACGCTGATCGGCCGAGTCCCGAGTCGAAGGGCGCCCGCGGTACGTCCGAACAGCGGCCAGCGTCAATGGCCAGCGGTAGTCACGGTCGGGGAAGATCACGTTCGCGCGACCGCAAGCGCCCTCCCCCGCACCGGGGCAGGTCAGGACGGGTCTGATCGGGATGGTGCGGACCGCAGAAGGCACCGATCGAAACGTTCCGAGTCGGCGGAGCGGCACGAACGATCGAACCGAGGCTCCCGTTCGGCTGGGCGGCGGCGGTGAACATGAGCGGGACAAGCAGGACCGCAAACATCAGCCCTCGGAGAA]




>consensus_2324#0
CCGCCCACGCGTCCGCTCTTTTCTTTTTAATCCACTTCCAACTGCGTTACGTCCTTCCAT
CTATGGATGGTTTAGGTATCCGGGACGTGATGAGCGCGAACGAAGTGTCGGTAGCTACGG
AGGTGCCAAGCAATCGGCGGACTTTGGCGAAGGAGGGGAGCATCATATGCAGCATCCGAA
CGTACCGCCTGGCGGCGAGCAACGGCACAGAACAAGCCGACAGTCCAGCCGGCAATCTTC
TCCGATGGGTGGTGCTCATCAGCAAGGCGTCGGACATCAAGATCCTGCGCAGCGTGGTAG
GGAGGGTGAGTGGCCAGAACACACTGACGATCCCGCCTACCACCACCAACACCATCAGCA
ACAGCAACAGCATCACGCTGATCGGCCGAGTCCCGAGTCGAAGGGCGCCCGCGGTACGTC
CGAACAGCGGCCAGCGTCAATGGCCAGCGGTAGTCACGGTCGGGGAAGATCACGTTCGCG
CGACCGCAAGCGCCCTCCCCCGCACCGGGGCAGGTCAGGACGGGTCTGATCGGGATGGTG
CGGACCGCAGAAGGCACCGATCGAAACGTTCCGAGTCGGCGGAGCGGCACGAACGATCGA
ACCGAGGCTCCCGTTCGGCTGGGCGGCGGCGGTGAACATGAGCGGGACAAGCAGGACCGC
AAACATCAGCCCTCGGAGAA

consensusID : consensus_2324#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 637
fasta sequence

                              [CCGCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTTCACGATCACGCTCCTTCTCACGCTCCTTCTCACGTTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCACGCTCCTTCTCGCGTTCTTTTTCCCGCTCGCGATCCTTCTCCATGTCGCGGTCCTTTTCCTTGTCGCGATCCTTTTCCCGCTCTCGATCCTTCTCACCCCGCTCGCGATCCTTTTCCTTGTCGCGTTCCTTTTCTCTGTCCCGCAGCCTTTCCTTCTCGCGCTCCTTTTCGCGTACCTTTTCCCGCTCCCGCTCCTTCTCCCGCTCGCGCTCCTTTTCCTTCTCCTTTTCGCGCTCCTTCTCCTTCCTTCGGTCCCGGTCGCGATCATGATGTTCGGCGTGATCGCCCCGCTCCTTCTCCTTGTTGCGATCCTTCTCCCGCTCACGGTCCCGCTGCCGGTCTCGATCGCGCTCCCGCTCGCGATCACGCTGGTGATCACCTCCGCGCTCATTCTCGCCCCGTTCCTTGCCCCGCTCCCGATGATGATGGTCACGCTCGTCTCCTCCCCGCCGGCCGTGCTGGTCCACCGGCTCGCTGCGCTTGTCCTTCTCCGAGGGCTGAATGTTTGCGGTCCTGCTTGTCCC]

[+] EMBL BM607425             [CCGCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTTCACGATCACGCTCCTTCTCACGCTCCTTCTCACGTTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCACGCTCCTTCTCGCGTTCTTTTTCCCGCTCGCGATCCTTCTCCATGTCGCGGTCCTTTTCCTTGTCGCGATCCTTTTCCCGCTCTCGATCCTTCTCACCCCGCTCGCGATCCTTTTCCTTGTCGCGTTCCTTTTCTCTGTCCCGCAGCCTTTCCTTCTCGCGCTCCTTTTCGCGTACCTTTTCCCGCTCCCGCTCCTTCTCCCGCTCGCGCTCCTTTTCCTTCTCCTTTTCGCGCTCCTTCTCCTTCCTTCGGTCCCGGTCGCGATCATGATGTTCGGCGTGATCGCCCCGCTCCTTCTCCTTGTTGCGATCCTTCTCCCGCTCACGGTCCCGCTGCCGGTCTCGATCGCGCTCCCGCTCGCGATCACGCTGGTGATCACCTCCGCGCTCATTCTCGCCCCGTTCCTTGCCCCGCTCCCGATGATGATGGTCACGCTCGTCTCCTCCCCGCCGGCCGTGCTGGTCCACCGGCTCGCTGCGCTTGTCCTTCTCCGAGGGCTGAATGTTTGCGGTCCTGCTTGTCCC]




>consensus_2324#1
CCGCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTTCACGATCACGCTCCT
TCTCACGCTCCTTCTCACGTTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCACGCTCCT
TCTCGCGTTCTTTTTCCCGCTCGCGATCCTTCTCCATGTCGCGGTCCTTTTCCTTGTCGC
GATCCTTTTCCCGCTCTCGATCCTTCTCACCCCGCTCGCGATCCTTTTCCTTGTCGCGTT
CCTTTTCTCTGTCCCGCAGCCTTTCCTTCTCGCGCTCCTTTTCGCGTACCTTTTCCCGCT
CCCGCTCCTTCTCCCGCTCGCGCTCCTTTTCCTTCTCCTTTTCGCGCTCCTTCTCCTTCC
TTCGGTCCCGGTCGCGATCATGATGTTCGGCGTGATCGCCCCGCTCCTTCTCCTTGTTGC
GATCCTTCTCCCGCTCACGGTCCCGCTGCCGGTCTCGATCGCGCTCCCGCTCGCGATCAC
GCTGGTGATCACCTCCGCGCTCATTCTCGCCCCGTTCCTTGCCCCGCTCCCGATGATGAT
GGTCACGCTCGTCTCCTCCCCGCCGGCCGTGCTGGTCCACCGGCTCGCTGCGCTTGTCCT
TCTCCGAGGGCTGAATGTTTGCGGTCCTGCTTGTCCC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_2324#0      CCGCCCACGCGTCCGCTCTTTTCTTTTTAATCCACTTCCAACTGCGTTACGTCCTTCCAT 60
consensus_2324#1      CCGCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCC--CTCCTTTCCCTCCTTTTCACGATCACGCTC 58
                      *****    * ***  **  * ****      *  ****  *    * ***  *   *  

consensus_2324#0      CTATGGATGGTTTAGGTATCCGGGACGTGATGAGCGCGAACGAAGTGTCGGTAGCTACGG 120
consensus_2324#1      CTTCTCACGCTCCT--TCTCACGTTCCTTCT---CGCGCTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCA 113
                      **    * * *     * **  *  * *  *   ****  *    *  ** *   *    

consensus_2324#0      AGGTGCCAAGCAATCGGCGGACTTTGGCGAAGGAGGGGAGCATCATATGCAGCATCCGAA 180
consensus_2324#1      CGCTCCT-----TCTCGCGTTCTTTTTCCCGCTCGCG----ATCCTTCTCCATGTCGCGG 164
                       * * *          ***  ****  *      * *    *** *   *    **    

consensus_2324#0      CGTACCGCCTGGCGGCGAGCAACGGCACAGAA-CAAGCCGACA-GTCCAGCCGGCAATCT 238
consensus_2324#1      TCCTTTTCCTTGTCGCGATCCTTTTCCCGCTCTCGATCCTTCTCACCCCGCTCGCGATCC 224
                             *** *  **** *     * *     * * **  *    ** **  ** *** 

consensus_2324#0      TCTCCGATGGGTGGTGCTCATCAGCAAGGCGTCGGA-CATCAAGATCCTGCGCAGCGTGG 297
consensus_2324#1      TTTTCCTTG--TCGCGTTCCTTTTCTCTGTCCCGCAGCCTTTCCTTCTCGCGCTCCTTTT 282
                      * * *  **  * * * ** *   *   *   ** * * *     **  ****  * *  

consensus_2324#0      TAGGGAGGGTGAGTGGCCAGAACACACTGACGATCCCGCCTACCACCACCAACACCATCA 357
consensus_2324#1      CGCGTACCTTTTCCCGCTCCCGCTCCTTCTCCCGCTCGCGCTCCTTTTCCTTCTCCTTTT 342
                         * *   *     **     * *  *  *   * ***   **    **  * ** *  

consensus_2324#0      GCAACAGCAACAGCATCACGCTGATC-GGCCGAG-TCCCGAG--TCGAAGGGCGCCCGCG 413
consensus_2324#1      CGCGCTCCTTCTCCTTCCTTCGGTCCCGGTCGCGATCATGATGTTCGGCGTGATCGCCCC 402
                          *  *  *  * **   * *  * ** ** * **  **   ***  * *  * * * 

consensus_2324#0      GTACGTCCGAACAGCGGCCAGCGT-CAATGGCCAGCGGTAGTCACGGTCGGGGAAGATCA 472
consensus_2324#1      GCTCCTTCTCCTTGTTGCGATCCTTCTCCCGCTCACGGTC-CCGCTGCCGGTCTCGATCG 461
                      *  * * *     *  ** * * * *    **   ****   * * * ***    **** 

consensus_2324#0      CGTTCGCGCGACCGCAAGCGCCCTCCCCCGCACCGGGGCAGGTCAGGACGGGTCTGATCG 532
consensus_2324#1      CGCTCCCGC--TCGCGATCACGCTGGTGATCACCTCCGC-GCTCATTCTCGCCCCGTTCC 518
                      ** ** ***   *** * * * **      ****   ** * ***     *  * * ** 

consensus_2324#0      GGATGGTGCGGACCGCAGAAGGCACCGATCGAAA-CGTTCCGAGTCGGCGGAGCGGCACG 591
consensus_2324#1      ---TTGCCCCGCTC-CCGATGATGATGGTCACGCTCGTCTCCTCCCCGCCGGCCGTGCTG 574
                         * *  * *  * * ** *     * **     ***  *    * ** *  **    *

consensus_2324#0      AACGATCGAACCGAGGCTCCCGTTCGGCTGGGCGGCGGCGGTGAACATGAGCGGGACAAG 651
consensus_2324#1      GTCCACCGGCTCGCTGCGCTTGTCCTTCTCCGAGG----GCTGAATGTTTGCGGTCCTGC 630
                        * * **   **  ** *  ** *  **  * **    * ****  *  ****  *   

consensus_2324#0      CAGGACCGCAAACATCAGCCCTCGGAGAA 680
consensus_2324#1      TTGTCCC---------------------- 637
                        *  **