cluster # 3579

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Anopheles gambiae
cluster # 3579 cluster # 3579 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3579#0 length = 646 sequences # 3

consensusID : consensus_3579#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 646
fasta sequence

                              [TTTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGTTCCGTTAAGTCTTAATTAAACGTGTATTTGTTTTTTAGTTAATTTTCTCGTAAGTCGTTGCGATTTGTTGTTGTTGATTTTTTCTACAAAGTTTCTTTTATAAAGGCATTATTTGACTTATCGTTTAGAACGTATCGGTTTACATTTGTGCATGCTTGAACGTGGTACGAATGGTAAGTAAGAAACTATGATTGGCAATCGATATTGCAGCAAAACGATTAATGCGTATCGAATGAGACAAATTATCTTTCTTCGCCCTATAAACTAATACACTCATACACACGCATACGCACACATACAATTGATACAAAATACTCGTTTGTCTCTCGTTCTCTCTCCCTCGCGTATCTTCGCACGTACGTTTTTGTGTTATGAACAATGCTAAAAACAAACAGTAAAGCTACTAAATTGCGCAATTTACTAGACCCTTTATGGCGTGCTCACAACATTCCTATTGGGACATGAATGCTGAGTTTAAATTTTAAAACACACAAATTAATTACTGGGGGACATAGTTATTAAGTAATGCAAGAGGAGAAGACAAAATGCACAACTTCCTCCTCACTGGTTCTTGTTTCGTGAAAGGAATTATGTATTGTGTAACACATGAT-CACAAAAAAAAA]

[+] EMBL AGA285161            [TTTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGTTCCGTTAAGTCTTAATTAAACGTGTATTTGTTTTTTAGTTAATTTTCTCGTAAGTCGTTGCGATTTGTTGTTGTTGATTTTTTCTACAAAGTTTCTTTTATAAAGGCATTATTTGACTTATCGTTTAGAACGTATCGGTTTACATTTGTGCATGCTTGAACGTGGTACGAATGGTAAGTAAGAAACTATGATTGGCAATCGATATTGCAGCAAAACGATTAATGCGTATCGAATGAGACAAATTATCTTTCTTCGCCCTATAAACTAATACACTCATACACACGCATACGCACACATACAATTGATACAAAATACTCGTTTGTCTCTCGTTCTCTCTCCCTCGCGTATCTTCGCACGTACGTTTTTGTG                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL AGA284345            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TACTCGTTTGTCTCTCGTTTTCTCTCCCTCGCGTATCTTCGCACGTACGTTTTTGTGTTATGAACAATGCTAAAAACAAACAGTAAAGCTACTAAATTGCGCAATTTACTAGACCCTTTATGGCGTGCTCACAACATTCCTATTGGGACATGAATGCTGAGTTTAAATTTTAAAACACACAAATTAATTACTGGGGGACATAGTTATTAAGTAATGCAAGAGGAGAAGACAAAATGCACAACTTCCTCCTCACTGGTTCTTGTTTCGTGAAAGGAATTATGTATTGTGTAACACATGAT CACAAAAAA   ]
[-] EMBL AGA283868            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGGCGTGCTCACAACATTCCTATTGGGACATGAATGCTGAGTTTAAATTTTAAAACACACAAATTAATTACTGGGGGACATAGTTATTAAGTAATGCAAGAGGAGAAGACAAAATGCACAACTTCCTCCTCACTGGTTCTTGTTTCGTGAAAGGAATTATGTATTGTGTAACACATGATCCTCGAAAAAAAA]




>consensus_3579#0
TTTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGTTCCGTTAAGTCTTAATTAAACGTGTATTTGTTTTTTA
GTTAATTTTCTCGTAAGTCGTTGCGATTTGTTGTTGTTGATTTTTTCTACAAAGTTTCTT
TTATAAAGGCATTATTTGACTTATCGTTTAGAACGTATCGGTTTACATTTGTGCATGCTT
GAACGTGGTACGAATGGTAAGTAAGAAACTATGATTGGCAATCGATATTGCAGCAAAACG
ATTAATGCGTATCGAATGAGACAAATTATCTTTCTTCGCCCTATAAACTAATACACTCAT
ACACACGCATACGCACACATACAATTGATACAAAATACTCGTTTGTCTCTCGTTCTCTCT
CCCTCGCGTATCTTCGCACGTACGTTTTTGTGTTATGAACAATGCTAAAAACAAACAGTA
AAGCTACTAAATTGCGCAATTTACTAGACCCTTTATGGCGTGCTCACAACATTCCTATTG
GGACATGAATGCTGAGTTTAAATTTTAAAACACACAAATTAATTACTGGGGGACATAGTT
ATTAAGTAATGCAAGAGGAGAAGACAAAATGCACAACTTCCTCCTCACTGGTTCTTGTTT
CGTGAAAGGAATTATGTATTGTGTAACACATGATCACAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case