cluster # 4205

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Anopheles gambiae
cluster # 4205 cluster # 4205 Sequences # 3 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4205#0 length = 888 sequences # 1

consensus_4205#1 length = 735 sequences # 2

consensusID : consensus_4205#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 888
fasta sequence

                              [CATGCCTGCTTTTGTTTTATTTTTTTTTTCTTATTAACTCTTCTGTTTATTTCATACACGATTTTCTTTTCTTCTGTTTTTGGTCCACAATTGAGCATCTTCCACAAATTCTTATAACATCAACATCAGTCTTTGGAATTCAATCTTTGCTTAAGAGTAACAAAAGCTTACCCCCTCCTTTCAAAGATGTACAGTTCATAGTTTTAACAGTTAACATTGCATTGTAATTTTCTTGAAGTTTTACTTCTTAAATTCACTTACGAGATCCAGCCCTGAAGTAATTATTGATTTGCCAAGTTTTGTGAAAAAAAAACATAATTCGTTTAATCCAAACTACATCTTATTGACTTAAATTCAATTCAATAAAACAACAAAATGAATGAAATATAAAATCGGTAGAGATAGTCTATAAGGAAGATATTACACGATATCAAATGTCTCATAAGTGTTGGAGACCGCTTTTATACTAATTCTAGCAAAACGCTCAGTTTCGCGGTTTACAGACGGGTAAGAAAAAAAAACAGCGTAATAGAAAAATAGGGGTTTAACAAGATTTNGTCTTGTTTAACCTTTAATTCAGATTCATGAACGTTCCTACCAACGGAAATAAAGAATCTCACTTGTTCTTAAAATTTGTTCGCAAAAGGTGAATAATATAAAAGAAAATAGCATGAAGCTTTGTTCCCCTTTTGCTCTACCGGAGGCTTAAAAGGGAACGTTTTAATGCTTCAACAATGGTGACGACTGACATTGGGGGTGATCTGTTAAGGGCCACTTAGGGTTCCGGTTATGGCATTCTCNCTAATTAGGGGATAACACCCAAAAATNTTCTAACCCCAANGGTCAAANTCTAACGTCCAAGGACNNTTATGNAGTTCCCCGAATTGT]

[+] EMBL BX466709             [CATGCCTGCTTTTGTTTTATTTTTTTTTTCTTATTAACTCTTCTGTTTATTTCATACACGATTTTCTTTTCTTCTGTTTTTGGTCCACAATTGAGCATCTTCCACAAATTCTTATAACATCAACATCAGTCTTTGGAATTCAATCTTTGCTTAAGAGTAACAAAAGCTTACCCCCTCCTTTCAAAGATGTACAGTTCATAGTTTTAACAGTTAACATTGCATTGTAATTTTCTTGAAGTTTTACTTCTTAAATTCACTTACGAGATCCAGCCCTGAAGTAATTATTGATTTGCCAAGTTTTGTGAAAAAAAAACATAATTCGTTTAATCCAAACTACATCTTATTGACTTAAATTCAATTCAATAAAACAACAAAATGAATGAAATATAAAATCGGTAGAGATAGTCTATAAGGAAGATATTACACGATATCAAATGTCTCATAAGTGTTGGAGACCGCTTTTATACTAATTCTAGCAAAACGCTCAGTTTCGCGGTTTACAGACGGGTAAGAAAAAAAAACAGCGTAATAGAAAAATAGGGGTTTAACAAGATTTNGTCTTGTTTAACCTTTAATTCAGATTCATGAACGTTCCTACCAACGGAAATAAAGAATCTCACTTGTTCTTAAAATTTGTTCGCAAAAGGTGAATAATATAAAAGAAAATAGCATGAAGCTTTGTTCCCCTTTTGCTCTACCGGAGGCTTAAAAGGGAACGTTTTAATGCTTCAACAATGGTGACGACTGACATTGGGGGTGATCTGTTAAGGGCCACTTAGGGTTCCGGTTATGGCATTCTCNCTAATTAGGGGATAACACCCAAAAATNTTCTAACCCCAANGGTCAAANTCTAACGTCCAAGGACNNTTATGNAGTTCCCCGAATTGT]




>consensus_4205#0
CATGCCTGCTTTTGTTTTATTTTTTTTTTCTTATTAACTCTTCTGTTTATTTCATACACG
ATTTTCTTTTCTTCTGTTTTTGGTCCACAATTGAGCATCTTCCACAAATTCTTATAACAT
CAACATCAGTCTTTGGAATTCAATCTTTGCTTAAGAGTAACAAAAGCTTACCCCCTCCTT
TCAAAGATGTACAGTTCATAGTTTTAACAGTTAACATTGCATTGTAATTTTCTTGAAGTT
TTACTTCTTAAATTCACTTACGAGATCCAGCCCTGAAGTAATTATTGATTTGCCAAGTTT
TGTGAAAAAAAAACATAATTCGTTTAATCCAAACTACATCTTATTGACTTAAATTCAATT
CAATAAAACAACAAAATGAATGAAATATAAAATCGGTAGAGATAGTCTATAAGGAAGATA
TTACACGATATCAAATGTCTCATAAGTGTTGGAGACCGCTTTTATACTAATTCTAGCAAA
ACGCTCAGTTTCGCGGTTTACAGACGGGTAAGAAAAAAAAACAGCGTAATAGAAAAATAG
GGGTTTAACAAGATTTNGTCTTGTTTAACCTTTAATTCAGATTCATGAACGTTCCTACCA
ACGGAAATAAAGAATCTCACTTGTTCTTAAAATTTGTTCGCAAAAGGTGAATAATATAAA
AGAAAATAGCATGAAGCTTTGTTCCCCTTTTGCTCTACCGGAGGCTTAAAAGGGAACGTT
TTAATGCTTCAACAATGGTGACGACTGACATTGGGGGTGATCTGTTAAGGGCCACTTAGG
GTTCCGGTTATGGCATTCTCNCTAATTAGGGGATAACACCCAAAAATNTTCTAACCCCAA
NGGTCAAANTCTAACGTCCAAGGACNNTTATGNAGTTCCCCGAATTGT

consensusID : consensus_4205#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 735
fasta sequence

                              [TCAGATTCATGAACGTTCCTACCAACGGAAATAAAAATCTCACTTGTTCTTAAAATTTGTTCCCAAAAAGTGAATAATATAAAAAGAAAATAAATGAAGCTTTTCTCTTCTCTACGAGCTAAAGAACGTTTTAATGCTAAAAATGTAAATAAATTGGCGTGTTCTGTTAAGGCACTTGGGTTCGTTATGCATCCCTCTATTGGTATAACCCATAAATTCTCACCCATACCTAATTCTTAGTTCAACGAATGTATAATAAGTTCACGATTGTACAGCTCAACGGAAAGAGGTTAATACATCTGTGTGTTATATCAGTGTGTGTCAGTAACGTGTGCCGAAACGAGATTGAATTCCGTAATGTTAATAGTGAAATATAAAGAAGAGAAATTTGCATGCATGCCCTAAGCTGCATGTGTATCAAGTAGCATATAGAAAAAGAGACAAATTCGGAATGGGAATTCCCTGAGATGAACAACACAATTGTCAAAAGAAAAAAAAAATACTCCCTTTGCCGCTCCAAAGTGTGCGCCTTCTTACAGGTAGAACAGCTTGTCGTTCAACGATTCTGCCGGCATTCGCTTGACCGACTGTCCAACAAGAAACAGCCAACTTGTGTGCGTACTGACA-GCACGCCGGCACACGAATCGTGCCGGTCCAGTTGTAGTACATGTAGCACATCTTGTAGCTCAGCTGTTGCAGAATGTCGGGCGAAAACTTGGAATCGTCCCGCAGCAC]

[+] EMBL CNS09O89             [TCAGATTCATGAACGTTCCTACCAACGGAAATAAAAATCTCACTTGTTCTTAAAATTTGTTCCCAAAAAGTGAATAATATAAAAAGAAAATAAATGAAGCTTTTCTCTTCTCTACGAGCTAAAGAACGTTTTAATGCTAAAAATGTAAATAAATTGGCGTGTTCTGTTAAGGCACTTGGGTTCGTTATGCATCCCTCTATTGGTATAACCCATAAATTCTCACCCATACCTAATTCTTAGTTCAACGAATGTATAATAAGTTCACGATTGTACAGCTCAACGGAAAGAGGTTAATACATCTGTGTGTTATATCAGTGTGTGTCAGTAACGTGTGCCGAAACGAGATTGAATTCCGTAATGTTAATAGTGAAATATAAAGAAGAGAAATTTGCATGCATGCCCTAAGCTGCATGTGTATCAAGTAGCATATAGAAAAAGAGACAAATTCGGAATGGGAATTCCCTGAGATGAACAACACAATTGTCAAAAGAAAAAAAAAATACTCCCTTTGCCGCTCCAAAGTGTGCGCCTTCTTACAGGTAGAACAGCTTGTCGTTCAACGATTCTGCCGGCATTCGCTTGACCGACTGTCCAACAAGAAACAGCCAACTTGTGTGCGTACTGACA GCACGCCGGCACACGAATCGTGCCGGTCCAGTTGTAGTACATGTAGCACATCTTGTAGCTCAGCTGTTGCAGAATGTCGGGCGAAAACTTGGAATCGTCCCGCAGCAC]
[+] EMBL CNS09DAC             [                                                       TTTGTTCCCAAAAAGTGAATAATATAAAAAGAAAATAAATGAAGCTTTTCTCTTCTCTACGAGCTAAAGAACGTTTTAATGCTAAAAATGTAAATAAATTGGCGTGTTCTGTTAAGGCACTTGGGTTCGTTATGCATCCCTCTATTGGTATAACCCATAAATTCTCACCCATACCTAATTCTTAGTTCAACGAATGTATAAAAAGTTCACGATTGTACAGCTCAACGGAAAGAGGTTAATACATCTGTGTGTTATATCAGTGTGTGTCAGTAACGTGTGCCGAAACGAGATTGAATTCCGTAATGTTAATAGTGAAATATAAAGAAGAGAAATTTGCATGCATGCCCTAAGCTGCATGTGTATCAAGTAGCATATAGAAAAAGAGACAAATTCGGAATGGGAATTCCCTGAGATGAACAACACAATTGTCAAAAGAAAAAAAAAATACTCCCTTTGCCGCTCCAAAGTGTGCGCCTTCTTACAGGTAGAACAGCTTGTCGTTCAACGATTCTGCCGGCATTCGCTTGACCGACTGTCCAACAAGATAC GCCAGCCTGTGTGCGTACTGACACGCACGCCGGCACACGAA                                                                                           ]




>consensus_4205#1
TCAGATTCATGAACGTTCCTACCAACGGAAATAAAAATCTCACTTGTTCTTAAAATTTGT
TCCCAAAAAGTGAATAATATAAAAAGAAAATAAATGAAGCTTTTCTCTTCTCTACGAGCT
AAAGAACGTTTTAATGCTAAAAATGTAAATAAATTGGCGTGTTCTGTTAAGGCACTTGGG
TTCGTTATGCATCCCTCTATTGGTATAACCCATAAATTCTCACCCATACCTAATTCTTAG
TTCAACGAATGTATAATAAGTTCACGATTGTACAGCTCAACGGAAAGAGGTTAATACATC
TGTGTGTTATATCAGTGTGTGTCAGTAACGTGTGCCGAAACGAGATTGAATTCCGTAATG
TTAATAGTGAAATATAAAGAAGAGAAATTTGCATGCATGCCCTAAGCTGCATGTGTATCA
AGTAGCATATAGAAAAAGAGACAAATTCGGAATGGGAATTCCCTGAGATGAACAACACAA
TTGTCAAAAGAAAAAAAAAATACTCCCTTTGCCGCTCCAAAGTGTGCGCCTTCTTACAGG
TAGAACAGCTTGTCGTTCAACGATTCTGCCGGCATTCGCTTGACCGACTGTCCAACAAGA
AACAGCCAACTTGTGTGCGTACTGACAGCACGCCGGCACACGAATCGTGCCGGTCCAGTT
GTAGTACATGTAGCACATCTTGTAGCTCAGCTGTTGCAGAATGTCGGGCGAAAACTTGGA
ATCGTCCCGCAGCAC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_4205#0      CATGCCTGCTTTTGTTTTATTTTTTTTTTCTTATTAACTCTTCTGTTTATTTCATACACG 60
consensus_4205#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_4205#0      ATTTTCTTTTCTTCTGTTTTTGGTCCACAATTGAGCATCTTCCACAAATTCTTATAACAT 120
consensus_4205#1      ---TCAGATTCATGAACGTT---CCTACCAACGGAAATA----AAAATCTCACTTGTTCT 50
                         *    *** *     **    * ** *  *   **     * **  **   *    *

consensus_4205#0      CAACATCAGTCTTTGGAATTCAATCTTTGCTTAAGAGTAACAAAAGCTTACCCCCTCCTT 180
consensus_4205#1      TAAAATTTGTTCCCAAAAAGTGAATAATATAAAAAGAAAATAAATGAAGCTTTTCTCTTC 110
                       ** **  **      **    *    *    **    ** *** *        *** * 

consensus_4205#0      TCAAAGATGTACAGTTCATAGTTTTAACAGTTAACATTGCATTGTAATTTTCTTGAAGTT 240
consensus_4205#1      TCTACGAGCTAAAGAAC---GTTTTAAT-GCTAAAAATGTAAATAAATTGGCGTG----T 162
                      ** * **  ** **  *   *******  * *** * ** *    ****  * **    *

consensus_4205#0      TTACTTCTTAAATTCACTTACGAGATCCAGCCCTGAAGTAATTATTGATTTGCCAAGTTT 300
consensus_4205#1      TCTGTTAAGGCACTTGGGTTCGTTATGCATCCCTCTATTGGT--ATAACCCATAAATTCT 220
                      *   **     * *    * **  ** ** ****  * *  *   * *      ** * *

consensus_4205#0      TGTGAAAAAAAAACATAATTCGTTTAATCCAAACTACATCTTATTGACTTAAATTCAATT 360
consensus_4205#1      CACCCAT-----ACCTAATTC--TTAGTTCAACGAATGTATAATAAGTTCA----CGATT 269
                           *      ** ******  *** * ***   *  * * **    * *    * ***

consensus_4205#0      CAATAAAACAACAAAATGAATGAAATATAAAATCGGTAGAGATAGTCTATAAGGAAGATA 420
consensus_4205#1      GTACAGCTCAACGGAAAGAGGTTAATAC---ATCTGT----GTGTTATATCAG-----TG 317
                        * *   ****  ** **    ****    *** **     *  * *** **     * 

consensus_4205#0      TTACACGATATCAAATGTCTCATAAGTGTTGGAGACCGCTTTTATACTAATTCTAGCAAA 480
consensus_4205#1      TGTGTCAGTAACGTGTGCCGAAACGAGATTGAATTCCG---TAATGTTAAT---AGTGAA 371
                      *    *  ** *   ** *  *      *** *  ***   * **  ****   **  **

consensus_4205#0      ACGCTCAGTTTCGCGGTTTACAGACGGGTAAGAAAAAAAAACAGCGTAATAGAAAAATAG 540
consensus_4205#1      ATATAAAGAAGAGAAATTTGCATGCATGCCCTAAGCTGCATGTGTATCA-AGTAGCATAT 430
                      *     **    *   *** **  *  *    **     *   *  * * ** *  *** 

consensus_4205#0      GGGTTTAACAAGATTTNGTCTTGTTTAACCTTTAATTCAGATTCATGAACGTTCCTACCA 600
consensus_4205#1      AGA---AAAAGAGACAAATTCGGAATGGGAATTCCCTGAGATGAAC-AACACAATTGTCA 486
                       *    ** *        *   *  *     **   * ****  *  ***     *  **

consensus_4205#0      ACGGAAATAAAGAAT--CTCACTTGTTCTTAAAATTTGTTCGCAAAAGGTGAATAATATA 658
consensus_4205#1      AAAGAAAAAAAAAATACTCCCTTTGCCGCTCCAAAGTGTGCGCCTTC--TTACAGGTAGA 544
                      *  **** *** ***    *  ***    *  **  *** ***      * *    ** *

consensus_4205#0      AAAGAAAATAGCATGAAGCTTTGTTCCCCTTTTGCTCTACCGGAGGCTTAAAAGGGAACG 718
consensus_4205#1      ACAGCTTGTCGTTCAACGATTCTGCCGGCATTCGCTTGACCGACTGTCCAACAAGAAACA 604
                      * **    * *    * * **    *  * ** ***  ****   *   ** * * *** 

consensus_4205#0      TTTTAATGCTTCAACAATGGTGACGACTGACATTGGGG-GTGATCTGTTAAGGGCCACTT 777
consensus_4205#1      GCCAACT--TGTGTGCGTACTGACAGC--ACGCCGGCACACGAATCGTGCCGGTCCAGTT 660
                          * *  *       *  ****  *  **   **     **   **   ** *** **

consensus_4205#0      AGGGTTCCGGTTATGGCATTCTCNCTAATTAGGGGATAACACCCAAAAATNTTCTAACCC 837
consensus_4205#1      GTAGTACA---TGTAGCACATCTTGTAGCTCAGCTGTTGCA-----GAATGTCGGG---C 709
                         ** *    * * ***       **  *  *   *  **      *** *       *

consensus_4205#0      CAANGGTCAAANTCTAACGTCCAAGGACNNTTATGNAGTTCCCCGAATTGT 888
consensus_4205#1      GAAAACTTGGAATC----GTCCCGCAGCAC--------------------- 735
                       **   *   * **    ****     *