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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5855#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1996 fasta sequence
[CCGCTCTGCGAAACGAAATCTCCGACACGCGAAAAAAAAGGACGCGCAAAACCTGCGCAAAACAGGAAACCGATCGACATGACACACGCTTAGAAGGTTTATCCGCGTATTACCTTACAATTTTTCTATTTTTGTTTTTTTTTTTTGTTAACTTTCTCATTTCACTGCTCTTTATGTTCACTCGTCCACTGTTTTGGATGTAAATCATATCCTACCATATACGTACATTCGTTCGTTCGTGATTCGTTGGT-AAGTGTGAAATAACCGCGTATAGTTCGTTAGCCGTTAGTTAGCGTGTAAGCTGCGCAATGTTATAAGAATATAAGATCAATAATGAGGCAGGCTTCTCAAACGTTTACGTTATTAAGTAATAGCAGCAGTAGAGAGGACGCCACTAACTATAATTAATGTTGAATTGCACTATGTAATTGCACTGTCCTATGAGGAGAGAGCA--AGAGAGAGAGAGATGATAGCAAGCTGGTTATGTTGTAGCTTTTATTTAAATTTGTTATCGTAAAACGACGCAAGCTAATGGAAGCGAGAGAGAGA---AAAACC-GGATACAGCAGGACTCGTTATCGAAACTAACAGCATTATTTTGGCAATGGCAAAAGACTTAGAGAATGCATGC----GACACTCCGTATGCAATTGTGCAAGCTCCTCCAAAAACTCACACAAGTGCCATTCTATGCTGTGAGGTGGTGGTACATCTTACAGCGCATAAGGCATCCTCCTCCTCTCGGTATTATTGGCTGCTTTTACAATAACTCACAAGGATTTGCTCACTTCACCCATCCGCAC-CACGCTCTTCGTGAGTGTGGTGAAGTGAGTAAGCGTGTTGTGTTATCAAACCATAGAAAACAAACGCGTTGTATCCATTATATCACACTTGTTCGATTAGAAAATGCTATTCTATATGATGTGCCGCTGTAGTATGTTGCATTCTATATCGTTAGGCAAATTGTTTGATACTCTGTGCAGGCAGCGAACATGTATTATTCCCCCCTCTCTATACTAGATCCATACGTTTATCATTCGTTACAGCTGACAATGCCTCTAGCTATGTTGCCGGCATAGTTTTCTTAGGCAACAACAAGAAAACCAAGGACCCCAACATGTTTAAAGCTATTACCATTTCCGTTCGCGCTCGACAGACAAAACCTGCCAATGGTTTCTATTCAAAGAGGGCAGAAGGGAATCGTCCTTTTAGAAACTCCCTCCGATGTGTTATGCTTAATGCAATCATGCAGATTTTAATAATTGAATTTTGAGCTAAGAAATAGATAAAAGCTGAAAGATAGTTTATTTGCGAGCAAACAAACTTACACATACACACAATCATGTGCTAGGAAAATAGTGTTGTACGTTATTTTGTTTCTGCATAATGCTATGAAATCATTTAATGGAAATCTTTTCTAAAAAGGTGTGTTATTAATCAAAATTAGCTTTGGTGTGTGAAAAGATCCCCACAACAGGACGCCTCAAACAACCCAAAAACACACACCGTACCTGTGAGATTTGTGGCGTGAAACGAAAGAGAGTGGTTATGTAGTAGCTAAAAGTGAAAGTAAATGTGATTTGATAAAAAAAGAAAAGAAAATCGAACCAAAAAGATACAAGCAGATGGTAAATGTTATGCGCTACGCGCCCTTATCTGATGGAATGATAGTTTTAAAAAAACGCATAAATCGTTTAGATGGAATTTTAACGATTTTAAAACCTGTTTAACCCTATCCCAATTCGGTTGGTATGTTTACTTTTTCTATGCATGTTACGTTTTTCCTATTCTCTCTTGTTTAGAGTCCTGTTAAGGACATATTTTTTGTTGCTATAACAAGCTTATCGTGCGTACAAAGAATACATACAACAACAAAAAACACCTTCCCCTTTAGCGAGTGTAGCAAAAAGCGCTGGCAACAACGTTGTGCAGGAAGGATAACCTTTTCTAGTGATTGATAGAATCTTTTCTTTTGTCGATAGCATGAAATAATAAATGGGGT]
[+] EMBL BM657112 [CCGCTCTGCGAAACGAAATCTCCGACACGCGAAAAAAAAGGACGCGCAAAACCTGCGCAAAACAGGAAACCGATCGACATGACACACGCTTAGAAGGTTTATCCGCGTATTACCTTACAATTTTTCTATTTTTGTTTTTTTTTTTTGTTAACTTTCTCATTTCACTGCTCTTTATGTTCACTCGTCCACTGTTTTGGATGTAAATCATATCCTACCATATACGTACATTCGTTCGTTCGTGATTCGTTGGTAAAGTGTGAAATAACCGCGTATAGTTCGTTAGCCGTTAGTTAGCGTGTAAGCTGCGCAATGTTATAAGAATATAAGATCAATAATGAGGCAGGCTTCTCAAACGTTTACGTTATTAAGTAATAGCAGCAGTAGAGAGGACGCCACTAACTATAATTAATGTTGAATTGCACTATGTAATTGCACTGTCCTATGAGGAGAGAGCA AGAGAGAGAGAGATGATAGCAAGCTGGTTATGTTGTAGCTTTTATTTAAATTTGTTATCGTAAAACGACGCAAGCTAATGGAAGCGAGAGAGAGAGAGAAAACCAGGATACAGCAGGACTCGTTATCGAAACTAACAGCATTATTTTGGCAATGGCAAAAGACTTAGAGAATGCATGCAATAGACACTCCGTATGCAATTGT ]
[+] EMBL CNS08JTY [ TTGGT AAGTGTGAAATAACCGCGTATAGTTCGTTAGCCGTTAGTTAGCGTGTAAGTTGCGCAATGTTATAAGAAGATAAGATCAATAATGAGGCAGGCTTCTCAAACGTTTACGTTATTAAGTAATAGCGGCAGTGGAGAGAACGCCACTGACTATAATTAATGTTGAATTGCACTATGTATTTGCCCTGTCCTATGAGGAGAGAGCAAGAGAGAGAGAGAGATGATAGCAAGCTGGTTATGTTGTAGCTTTTATTTAAATTTGTTATCGTAAAACGACGCAAGCTAATGGAAGCGAGAGAGAGA AAAACC GGATACAATAGGACTCGTCATCGAAACTAACAGCATTATTTTGGCAATGGCAAAAGACTTAGAGAATGCATGC GACACTCCGTATGCAATTGAGCAAGCTCCTCCAAAAACTCACACAAGTGCCATTCTATGCTGTGAGGTGGTGGTACATCTTACAGCGCATAAGGCATCCTCCTCCTCTCGGTATTATTGGCTGCTTTTACAATAACTCACAAGGATTTGCTCACTTCACCCATCCGCAC CACGCTCTTCGTGAGTGTGGTGAAGTGAGTAAGCGTGTTGTGTTATCAAACCATAGAAAACAAACGCGTTGTATCCATTATATCACACTTGTTCGATTAGAAAATGCTATTCTATATGATGTGCCGCTGTAGTATGTTGCATTCTATATCGTTAGGCAAATTGTTTGATACTCTGTGCAGGCAGCGAACATGTATTATTCCCCCCTCTCTATACTAGATCCATACGTTTATCATTCGTTACAGCTGACAATGCCTCTAGCTATGTTGCCGGCATAGTTTTCTTAGGCAACAACAAGAAAACCAAGGACCCCAACATGTTTAAAGCTATTACCATTTCCGTTCGCGCTCGACAGACAAAACCTGCCAATGGTTTCTATTCAAAGAGGGCAGAAGGGAATCGTCCTTTTAGAAACTCCCTCCGATGTGTTATGCT ]
[-] EMBL CNS08JTZ [ GCACTAACGCTCTTCGTTAGTGTGGTGAAGTGAGTGAGCGTGTTGTGTTATCAAACCATAGAAAACAAACGCGTTGTATCCATTATATTAAACTTGTTCGATTAGAAAATGCTATTCTATATGATGTGCCGCTGTAGTATGTTGCATTCTATATCGTTAGGCAAATTGTTTGATACTCTGTGCAGGCAGCGAACATGTATTATTCCCCCCTCTCTATACTAGATCCATACGTTTATCATTCGTTACAGCTGACAATGCCTCTAGCTATGTTGCCGGCATAGTTTTTTTAGGCAACAACAAGAAAACCAAGGACCCCAACATGTTTAAAGCTATTACCATTTCCGTTCGCGCTCCACAGACAAAACCTGCCAATGGTTTCTATTCAAAGAGGGCAGAAGGGAATCGTCCTTTTAGAAACTCCCTCCGATGTGTTATGCTTAATGCAATCATGCAGATTTTAATAATTGAATTTTGAGCTAAGAAATAGATAAAAGCTGAAAGATAGTTTATTTGCGAGCAAACAAACTTACACATACACACAATCATGTGCTAGGAAAATAGTGTTGTACGTTATTTTGTTTCTGCATAATGCTATGAAATCATTTAATGGAAATCTTTTCTAAAAAGGTGTGTTATTAATCAAAATTAGCTTTGGTGTGTGAAAAGATCCCCACAACAGGACGCCTCAAACAACCCAAAAACACACACCGTACCTGTGAGATTTGTGGCGTGAAACGAAAGAGAGTGGT ]
[+] EMBL BX616762 [ GTTATTAATCGAAATTAGCTTTGGTGTGTGAAAAGATCCCCACAACAGGACGCCTCAAACAACCCACACACACACACCGTACCTGTGAGATATGTGGCGTGAAACGAAAGAGAGTGGGTATGTAGTAGCTAAAAGTGAAAGTAAATGTGATTTGATAAAAAAAGAAAAGAAAATCGAACCAAAAAGATACAAGCAGATGGTAAATGTTATGCGCTACGCGCCCTTATCTGATGGAATGATAGTTTTAAAAAAACGCATAAATCGTTTAGATGGAATTTTAACGATTTTAAAACCTGTTTAACCCTATCCCAATTCGGTTGGTATGTTTACTTTTTCTATGCATGTTACGTTTTTCCTATTCTCTCTTGTTTAGAGTCCTGTTAAGGACATATTTTTTGTTGCTATAACAAGCTTATCGTGCGTACAAAGAATACATACAACAACAAAAAACACCTTCCCCTTTAGCGAGTGTAGCAAAAAGCGCTGGCAACAACGTTGTGCAGGAAGGATAACCTTTTCTAGTGATTGATAGAATCTTTTCTTTTGTCGATAGCATGAAATAATAAATGGGGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||