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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6074#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1408 fasta sequence
[TGATTTTGCTTTCTTTTTCTTTGCAGTAATTATAATCTAACCATTCCAGTGCCGTTTACGATGCATATTATCTTACTGTAAGTTCTACCGTTTGTTCGAGTTACTTGCATCAAGTAGCATAATGCATGTCTTAAGATCATTGAGAAAGTTCAATGTTTGCTTATTCCATACCTGGAACCTACAACACGTGATCGTACGCTAATACGCTATGTATGAATGGAAGTATGTTGTTAGAATGGATAGAGAGGTACATATGAACACACGCCCTCCTACCTGTTTCAATGTATTACCCCCTAATCTATCGTTCCTGCTTACAGTGCTAACTTTTGCCTTTTGCTCATCAAACTTATGTCCCTCGCGATCGACCCCAGATTTGGGCCTGTTACCCTTTTTGAACATCGGTTTATCCTGTATCGTTCGTATACGTTTTGCACTCGGACGTGACTAATGATGAAATGTGGAAAGAACCTGTACCTCTCGGCTAAGGTGAAATAATTTGTTTGCGATTAAGCAGAAACATGCCTACCAAACTTTGGGTTGGCAGAAACAGGGTAACATACATTCTACGCAAGAATTAACATCAATTTCCTGCCTCTATATCTCACCATGGTGATGCAGATGATGA---------TTGGGTACTGTTACAAACACGCTAGCAGCTAATTCATGAGACTTTAGAC-CTACACGTCTATCGTATTTCTTGCTACGTCATTGTAATTCCAATTGTTCATGCATGGACGCGTTCAGAAACCAGACTTGAGAGTAAGAGAATACACACAATTTACACTCTAAAAACAACGTTGAGATATAAACCTTATGAAATTAAATTCTAAAACTATTTGCATTAACTCATCCAA-CGCTCCAATCAATGTGTGGTACACTAAATAAATCAGCAATTCACATACACACGGCGTACAGTACTACGACTGCTGTATCCCCTTCATCTTCGTCTTGCTACAATTTACTTGTACAATCGAATAAGCTTAACCAAGGGTCGCTGGCAATTTAAAAACCAATTTTGGTTTGACTATGCGCTCACCATACCATAGACTATAAAGCAGCGAAAATCGTTCGACTTTGGAAGTATATATTAATAAATAATAAACAGTTTTGTCTGCTAACGCTACCCAGTTGAGCGATCATTTCGATCCAGAACTTTTAACCACAGCTTTCCGCTTGGTTACCACAATGCGTTTCCAAAACAATTACAAAACAAAACTAATTTTAAAAAAAACCATGCTACTGAGCTATCATCTGCCGTCAAAAGCTATCTTAATCGCTTTGGAGCGCATTAATCTCCTTCCATTCTGTACACTTAAACAATATTATGATCAATTTGTCATGCACGATTGTATCCACTATCAATATCACCGTCATTTTTGTCAGCCAAAGATATTCTCCCACGCGTCCGCGG]
[+] EMBL CNS08SE0 [TGATTTTGCTTTCTTTTTCTTTGCAGTAATTATAATCTAACCATTCCAGTGCCGTTTACGATGCATATTATCTTACTGTAAGTTCTACCGTTTGTTCGAGTTACTTGCATCAAGTAGCATAATGCATGTCTTAAGATCATTGAGAAAGTTCAATGTTTGCTTATTCCATACCTGGAACCTACAACACGTGATCGTACGCTAATACGCTATGTATGAATGGAAGTATGTTGTTAGAATGGATAGAGAGGTACATATGAACACACGCCCTCCTACCTGTTTCAATGTATTACCCCCTAATCTATCGTTCCTGCTTACAGTGCTAACTTTTGCCTTTTGCTCATCAAACTTATGTCCCTCGCGATCGACCCCAGATTTGGTTTTTTTACCCTTTTTGAACATCGGTTTATCCTGTATCGTTCGTATACGTTTTGCACTCGGACGTGACTAATGATGAAATGTGGAAAGAACCTGTACCTCTCGGCTAAGGTGAAATAATTTGTTTGCGATTAAGCAGAAACATGCCTACCAAACTTTGGGTTGGCAGAAACAGGGTAACATACATTCTACGCAAGAATTAACATCAATTTCCTGCCTCTATATCTCATCATGGTGATGCAGATGATGA TTGGGTACTGTTACAAACACGCTAGCAGCTAATTCATGAGACTTTAGAC CTACACGTCTATCGTATTTCTTGCTACGTCATTGTAATTCCAATTGTTCATTCATGGACGCGTTCAGAAACCAGACTTGAGAGTAAGAGAATACACACAATTTACACTCTAAAAACAACGT ]
[-] EMBL BX616537 [ ACGTGATCGTACGCTAATACGCTATGTATGAATGGAAGTATG TGTTAGAAT GATAGAGAGGTACATATGAACACACGCCCTCCTACCTGTTTCAATGTATTACCCCCTAATCCATCGTTCCTGCTTACAGTGCTAACTTTTGCCTTTTGCTCATCAAACTTATGTCCCTCGCGATCGACCCCAGATTTGGGCCTGTTACCCTTTTTGAACATCGGTTTATCCTGTATCGTTCGTATACGTTTTGCACTCGGACGTGACTAATGATGAAATGTGGAAAGAACCTGTACCTCTCGGCTAAGGTGAAATAATTTGTTTGCGATTAAGCAGAAACATGCCTACCAAACTCTAGGTTGGCAGAA AGGGTAACATACATTCTACGCAAAAATTAACATCAATTTCCTGCCTCTATATCTCACCATGGTGATGCAGATGATGATAATGATGCTTGGGTATTGTTACAAACACGCTAGCAGCTAATTCATGAGACTTTAGAC CTACACGTCTATCGTAATTCATGCTACGTCATTGTAATTCCAATTGTTCATGCATGGACGCGTTCAGAAACCAGACTTGGGAGTAAGAGAATACACAC ATTTACACTCTAAAAACAACGTTGAGATATAAACCTTATGAAATTAAATTCTAAAACTATTTGCATTAACTCATCCAA CGCTCCAATCAATGTGTGGTACACTAAATAAATCAGCAATTCAAATACACACGGCGTACAGTACTACGACTG ]
[-] EMBL CNS08SDZ [ CGACCCCAGATTTGGGCCTGTTACCCTTTTTGAACATCGGTTTATCCTGTATCGTTCGTATACGTTTTGCACTCGGACGTGACTAATGATGAAATGTGGAAAGAACCTGTACCTCTCGGCTAAGAAGAAATAATTTGTTTGCGATTAAGCAGAAACATGCCTACCAAACTTTGGGTTGGCAGAAACAGGGTAACATACATTCTACGCAAGAATTAACATCAATTTCCTGCCTCTATATCTCACCATGGTGATGCAGATGATGA TTGGGTACTGTTACAAACACGCTAGCAGCTAATTCATGAGACTTTAGACACTACACGTCTATCGTATTTCTTGCTACGTCATTGTAATTCCAATTGTTCATGCATGGACGCGTTCAGAAACCAGACTTGAGAGTAAGAGAATACACACAATTTACACTCTAAAAACAACGTTGAGATGTAAACCTTATGAAATTAAATTCTAAAACTATTTGCATTAATTCATCCAACCGGTCCAATCAATGTGTGGTACACTAAATAAATCATCAATTCACATACACACGGCGTACAGTACAACGGCTGCTGTATCCCCTTCATCTTCGTCTTGCTACAATTTACTTGTACAATCGAATAAGCTTAACCAAGGGTCGCTGGCAATTTAAAAACCAATTTTGGTTTGACTATGCGCTCACCATACCATAGACTATAAAGCAGCGAAAATCGTTCGACTTTGGAAGTATA ]
[-] EMBL AL693518 [ CGTTCGTATACGTTTTGCACTCGGACGTGACTAATGATGAAATGTGGAAAGAACCTGTACCTCTCGGCTAAGGTGAAATAATTTGTTTGCGATTAAGCAGAAACATGCCTACCAAACTCTAGGTTGGCAGAA AGGGTAACATACATTCTACGCAAAAATTAACATCAATTTCCTGCCTCTATATCTCACCATGGTGATGCAGATGATGATAATGATGCTTGGGTATTGTTACAAACACGCTAGCAGCTAATTCATGAGACTTTAGAC CTACACGTCTATCGTAATTCATGCTACGTCATTGTAATTCCAATTGTTCATGCATGGACGCGTTCAGAAACCAGACTTGGGAGTAAGAGAATACACAC ATTTACACTCTAAAAACAACGTTGAGATATAAACCTTATGAAATTAAATTCTAAAACTATTTGCATTAACTCATCCAA CGCTCCAATCAATGTGTGGTACACTAAATAAATCAGCAATTCACATACAC CGGCGTAC GTACTACGACTGCTGTATCCCCTT ATCCTCGggcgatt ]
[-] EMBL BM586715 [ TAAATTCTAAAACTATTTGCATTAATTCATCCAA CGGTCCAATCAATGTGTGGTACACTAAATAAATCATCAATTCACATACACACGGCGTACAGTACAACGGCTGCTGTATCCCCTTCATCTTCGTCTTGCTACAATTTACTTGTACAATCGAATAA CTTAACCAAGGGTCGCTGGCAATTTAAAAACCAATTTTGGTTTGACTATGCGCTCACCATACCATAGACTATAAAGCAGCGAAAATCGTTCGACTTTGGAAGTAAATATTAATAAATAATAAACAGTTTTGTCTGCTAACGCTACCCAGTTGAGCGATCATTTCGATCCAGAACTTTTAACCACAGCTTTCCGCTTGGTTACCACAATGCGTTTCCAAAACAATTACAAAACAAAACTAATTTTAAAAAAAACCATGCTACTGAGCTATCATCTGCCGTCAAAAGCTATCTTAATCGCTTTGGAGCGCATTAATCTCCTTCCATTCTGTACACTTAAACAATATTATGATCAATTTGTCATGCACGATTGTATCCACTATCAATATCACCGTCATTTTTGTCAGCCAAAGATATTCTCCCACGCGTCCGCGG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||