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Anopheles gambiae
cluster # 6343 cluster # 6343       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6343#0 length = 1102 sequences # 5  
consensusID : consensus_6343#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1102
fasta sequence 
                              [GGCTGGTTATCAGTCTCTGACTGTGTTATAACGGTGAAAGACCTACTGATGGCTGAAAGAAGCAAAAACATATTTGGTGGAGAGTATTGTTTTGGCACGGTTCGTTGAATTGACCAGATACGAACGAAATGGCGAACGACTTGTCAGAGTATTACTGTATCAGCTTGCACCTCACGGCACTACAAGTGGAGGATAATCTATTTTACGGTCCTGAAGTTGCGGGACCGTTGCCTGGAGCAATTGTTTCGTTGTATTGGATAACGAAAAATGGCACCGCTGCTGTGGTTGTACATTTGAGTTGAGGAATTCTGGACACCGAGGGACTGGAAATGCACAGGAAGGAATGGAATGGATGTATTTTAAAACACAGGAGTAATCGTGTGGATGCTGTGGATGTCACATTGCTTTGCACTGTAATTAGGATTGGTCGGATTCGTGGGATCATCGTTGGAGAAAGGAGGTGTTTGGTCTGGAATAGTGGTACATTGCTGATCATTCTCACCGACGTTCACAAACACACACACACAAAGTCTTACCAAACTGTTTTCCCATCGCTGGACGACGAGGGATATGGATAGTAGGATTGATCGTATGAGGATTGATCACTGGATCACTGGAGATCGTACCCAGGTTTCGGCAGGTACTGTTGGTATCTGTTGCGAGTGGAACGATATGATTCTACCTTTGGACGCGTCTGCTGCGGTTGAGCCAGCATTAGAGCGGGGAAAAGGCATTAGGAATACCCTTATCCGAGGTTGGATCGACGTTGGAAATGGAAGTTGCAAATATTCGGTAACCCAAAATCAGATTTTCTTCTCAATTAACACGTGTTTTACCTTCCTGTAGCATTTAACCTTATTTCATAACTCTTTCTCTCTCTATATGTCATAACCTCTGGAATGTCCTTAGCTGTATACTCCCTCATTCACAGCTTAGCACTAGAGGATTTAGACTGGGTAAAAAGATCCTTCCATCTTTCTGTTTTGTCTTCCTCCAAACGTATACTGACTGTATTGTTTTCTTATGGCATCCATTCATGCTCTCAATGTCTAAAAAAATTAAATCTT-GAATTTAAAACACTCTTTGCTATACGTGCTCCTTA]

[+] EMBL BX605489             [GGCTGGTTATCAGTCTCTGACTGTGTTATAACGGTGAAAGACCTACTGATGGCTGAAAGAAGCAAAAACATATTTGGTGGAGAGTATTGTTTTGGCACGGTTCGTTGAATTGACCAGATACGAACGAAATGGCGAACGACTTGTCAGAGTATTACTGTATCAGCTTGCACCTCACGGCACTACAAGTGGAGGATAATCTATTTTACGGTCCTGAAGTTGCGGGACCGTTGCCTGGAGCAATTGTTTCGTTGTATTGGATAACGAAAAATGGCACCGCTGCTGTGGTTGTACATTTGAGTTGAGGAATTCTGGACACCGAGGGACTGGAAATGCACAGGAAGGAATGGAATGGATGTATTTTAAAACACAGGAGTAATCGTGTGGATGCTGTGGATGTCACATTGCTTTGCACTGTAATTAGGATTGGTCGGATTCGTGGGATCATCGTTGGAGAAAGGAGGTGTTTGGTCTGGAATAGTGGTACATTGCTGATCATTCTCACCGACGTTCACAAACACACACACACAAAGTCTTACCAAACTGTTTTCCCATCGCTGGACGACGAGGGATATGGATAGTAGGATTGATCGTATGAGGATTGATCACTGGATCACTGGAGATCGTACCCAGGTTTCGGCAGGTACTGTTGGTATCTGTTGCGAGTGGAACGATATGATTCTACCTTTGGACGCGTCTGCTGCGGTTGAGCCAGCATTAGAGCGGGGAAAAGGCATTAAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX603844             [                                                                                                ACGGTTCGTTGAATTGACCAGATGCGAACGAAATGGCGAACGACTTGTCAGAGTATTACTGTATCAGCTTGCACCTCACGGCACTACAAGTGGAGGATAATCTATTTTACGGTCCTGAAGTTGCGGGACCGTTGCCTGGAGCAATTGTTTCGTTGTATTGGATAACGAAAAATGGCACCGCTGCTGTGGTTGTACATTAGAGTTGAGGAATTCTGGACACCGAGGGACTGGAAATGCACAGGAAGGAATGGAAAGGATGTATTTTAAAACACAGGAGTAATCGTGTGGATGCTGTGGATGTCACATTGCTTTGCACTGTAATTAGGATTGGTCGGATTCGTGGGATCATCGTTGGAGAAAGGAGGTGTTTGGTCTGGAATAGTGGTACATTGCTGATCATTCTCACCGACGTTCACAAACACACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX617641             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCATCGTTGGAGAAAGGAGGTGTTTGGTCTGGAATAGTGGTACATTGCTGATCATTCTCACCGACGTTCACAAACACACACACACAAAGTCTTACCAAACTGTTTTCCCATCGCTGGACGACGAGGGATATGGATAGTAGGATTGATCGTATGAGGATTGATCACTGGATCACTGGAGATCGTACCCAGGTTTCGGCAGGTACTGTTGGTATCTGTTGCGAGTGGAACGATATGATTCTACCTTTGGACGCGTCTGCTGCGGTTGAGCCAGCATTAGAGCGGGGAAAAGGCATTAGGAATACCCTTATCCGAGGTTGGATCGACGTTGGAAATGGAAGTTGCAAATATTCGGTAACCCAAAATCAGATTTTCTTCTCAATTAACACGTGTTTTACCTTCCTGTAGCATTTAACCTTATTTCATAACTCTTTCTCTCTCTATATGTCATAACCTCTGGAATGTCCTTAGCTGTATACTCCCTCATTCACAGCTTAGCACTAGAGGATTTAGACTGGGTAAAAAGATCCTTCCATCTTTCTGTTTTGTCTTCCTCCAAATGTATACTGACTGTATTGTTTTCTTATGGCATCCATTCATGCTCTCAATGTCTAAAAAAATTAAATCTT GAATTTAAAACACTCTTTGCTATACGTGCTCCTTA]
[+] EMBL BM615734             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCGAACTGTTTTCCCATCGCTGGACGACGAGGGATATGGATAGTAGGATTGATCGTATGAGGATTGATCACTGGATCACTGGAGATCGTACCCAGGTTTCGGCAGGTACTGTTGGTATCTGTTGCGAGTGGAACGATATGATTCTACCTTTGGACGCGTCTGCTGCGGTTGAGCCAGCATTAGAGCGGGGAAAAGGCATTAGGAATACCCTTATCCGAGGTTGGATCGACGTTGGAAATGGAAGTTGCAAATATTCGGTAACCCAAAATCAGATTTTCTTCTCAATTAACACGTGTTTTACCTTCCTGTAGCATTTAACCTTATTTCATAACTCTTTCTCTCTCTATATGTCATAACCTCTGGAATGTCCTTAGCTGTATACTCCCTCATTCACAGCTTAGCACTAGAGGATTTAGACTGGGTAAAAAGATCCTTCCATTTTTCTGTTTTGTCTTCCTCCAAACGTATACTGACTGGATTGTTTTCTTATGGCATCCATTCATGCTCTCAATGTCTAAAAAAATTAAATCTTGGAATTTAAAACACTCTTTGCTA             ]
[+] EMBL BX617415             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GACGAGGGATATGGATAGTAGGATTGATCGTATGAGGATTGATCACTGGATCACTGGAGATCGTACCCAGGTTTCGGCAGGTACTGTTGGTATCTGTTGCGAGTGGAACGATATGATTCTACCTTTGGACGCGTCTGCTGCGGTTGAGCCAGCATTAGAGCGGGGAAAAGGCATTAGGAATACCCTTATCCGAGGTTGGATCGACGTTGGAAATGGAAGTTGCAAATATTCGGTAACCCAAAATCAGATTTTCTTCTCAATTAACACGTGTTTTACCTTCCTGTAGCATTTAACCTTATTTCATAACTCTTTCTCTCTCTATATGTCATAACCTCTGGAATGTCCTTAGCTGTATACTCCCTCATTCACAGCTTAGCACTAGAGGATTTAGACTGGGTAAAAAGATCCTTCCATCTTTCTGTTTTGTCTTCCTCCAAACGTATACTGACTGTATTGTTTTCTTATGGCATCCATTCATGCTCTCAATGTCTAAAAAAATTAAATCTT GAATTTAAAACA                       ]




>consensus_6343#0
GGCTGGTTATCAGTCTCTGACTGTGTTATAACGGTGAAAGACCTACTGATGGCTGAAAGA
AGCAAAAACATATTTGGTGGAGAGTATTGTTTTGGCACGGTTCGTTGAATTGACCAGATA
CGAACGAAATGGCGAACGACTTGTCAGAGTATTACTGTATCAGCTTGCACCTCACGGCAC
TACAAGTGGAGGATAATCTATTTTACGGTCCTGAAGTTGCGGGACCGTTGCCTGGAGCAA
TTGTTTCGTTGTATTGGATAACGAAAAATGGCACCGCTGCTGTGGTTGTACATTTGAGTT
GAGGAATTCTGGACACCGAGGGACTGGAAATGCACAGGAAGGAATGGAATGGATGTATTT
TAAAACACAGGAGTAATCGTGTGGATGCTGTGGATGTCACATTGCTTTGCACTGTAATTA
GGATTGGTCGGATTCGTGGGATCATCGTTGGAGAAAGGAGGTGTTTGGTCTGGAATAGTG
GTACATTGCTGATCATTCTCACCGACGTTCACAAACACACACACACAAAGTCTTACCAAA
CTGTTTTCCCATCGCTGGACGACGAGGGATATGGATAGTAGGATTGATCGTATGAGGATT
GATCACTGGATCACTGGAGATCGTACCCAGGTTTCGGCAGGTACTGTTGGTATCTGTTGC
GAGTGGAACGATATGATTCTACCTTTGGACGCGTCTGCTGCGGTTGAGCCAGCATTAGAG
CGGGGAAAAGGCATTAGGAATACCCTTATCCGAGGTTGGATCGACGTTGGAAATGGAAGT
TGCAAATATTCGGTAACCCAAAATCAGATTTTCTTCTCAATTAACACGTGTTTTACCTTC
CTGTAGCATTTAACCTTATTTCATAACTCTTTCTCTCTCTATATGTCATAACCTCTGGAA
TGTCCTTAGCTGTATACTCCCTCATTCACAGCTTAGCACTAGAGGATTTAGACTGGGTAA
AAAGATCCTTCCATCTTTCTGTTTTGTCTTCCTCCAAACGTATACTGACTGTATTGTTTT
CTTATGGCATCCATTCATGCTCTCAATGTCTAAAAAAATTAAATCTTGAATTTAAAACAC
TCTTTGCTATACGTGCTCCTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)