cluster # 6479

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Anopheles gambiae
cluster # 6479 cluster # 6479 Sequences # 5 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6479#0 length = 1024 sequences # 4

consensus_6479#1 length = 679 sequences # 1

consensusID : consensus_6479#0
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Sequences nbr = 4
consensus length = 1024
fasta sequence

                              [TTTTTTTTTCTTTTTCGGGAAGTTTTCACAGATGAACGTCCCACCGTGACCGTGGACCGTTTTCTTATGTTTCTCGATGCTGAACTTTGTAAATGGTTTGTTACATTCCTCACAGATAATGTCCTTCTTCATGTGCACCTTGGCCATGTGGGCAGTGAGTCTGTTCTTGAAAGGAAACCGCTTGCCGCACTCCTCGCAAGCAAACTCCCACTCCTGGTGCTTGTTCTGCATGTGCTCCTCCAGGTTCTGGTGCACCTCCTGGCACACGCCGCACCGGAACCGTTCCGGATTCTCGTGCATATCCTTATGCTCGA-CCAGCTTGACGCGCGA--GAAACTTTTTCGCGCACAGCTGACACTTGTCCGTGCCCGACTCGAGCCCGTGCACCGTCCGCATGTGCTGGTTCAGCTGCTTCAGCGACCGGTACTCCTCCTCCTGGGTCGTTGCTGCTGCTGCCGCTTCCGGATGGCCCGCTCCCGCGGCAACACTGCCCGGGTCACCGCCGGGGCCGGCCACCGCGACAGCCACAGCGACCTTTTCCGGATCGCAAATCTCACATATGATGGGTTTGTAGAAATCGAATATTTCTCTATCTAGCGTCTGCTTCTGCTCCTCGGTCAGCTCGGGCCCCGGCTCGCCGCCCGGGTTGCCCGACTTGCCGGAATCTTCCTCCAGCAGCGCG-TTTGGCTGGTGCATGCGCTTGTGCTCGAGCAGTTTCGGGCGCGTACGGATCTTCTTCTCACACAGTGGACACTTTACCGTACCGGCCTGCTGCCCGTGCACCAGCCGCATGTGGTGGTTTAGCTCCTTCACCGTCGCGTACAGCATCGCGCTGGCCTGTGGACCGGCCCCGGCAGCAGCACTGGCCGCCGTGTCGCACACATCGACGGACACTCTGCCGCTGTACCGTTGCCCCCGACAGCCGTTACCCCGGATCCGCCGGATGGTAGCATTCCGTTTCTTCGTGCTTCATCCCATAATCCGGAACATCGGACAGCAACGGCACGGGCCCGTCCACCAGCGGCG]

[+] EMBL CNS09DT6             [TTTTTTTTTCTTTTTCGGGAAGTTTTCACAGATGAACGTCCCACCGTGACCGTGGACCGTTTTCTTATGTTTCTCGATGCTGAACTTTGTAAATGGTTTGTTACATTCCTCACAGATAATGTCCTTCTTCATGTGCACCTTGGCCATGTGGGCAGTGAGTCTGTTCTTGAAAGGAAACCGCTTGCCGCACTCCTCGCAAGCAAACTCCCACTCCTGGTGCTTGTTCTGCATGTGCTCCTCCAGGTTCTGGTGCACCTCCTGGCACACGCCGCACCGGAACCGTTCCGGATTCTCGTGCATATCCTTATGCTCGA CCAGCTTGACGCGCGA  GAAACTTTTTCGCGCACAGCTGACACTTGTCCGTGCCCGACTCGAGCCCGTGCACCGTCCGCATGTGCTGGTTCAGCTGCTTCAGCGACCGGTACTCCTCCTCCTGGGTCGTTGCTGCTGCTGCCGCTTCCGGATGGCCCGCTCCCGCGGCAACACTGCCCGGGTCACCGCCGGGGCCGGCCACCGCGACA CCACAGCGACCTTTTCCGGATCGCAAATCTCACATATGAGGGGTTTGTAGAAATCGAATATTTCTCTATCTAGCGTCTGCTTCTGCTCCTCGGTCAGCTCGGGCCCCGGCTCGCCGCCCGGGTTGCCCGACTTGCCGGAATCTTCCTCCAGCAGCGCGTTTTGGCTGGTGCATGCGCTTTTTCTCGAGCAGTTTCGGGCGCGTACGGATCTTCTTCTCACACAGTGGACACTTTACCGTACCGGCCTGCTGCCCGTGCACCAGCCGCATGTGGTGGTTTAGCTCCTTCACCGTCGCGTACAGCATCGCGCTGGCCTGTGGACCGGCCCCGGCAGCAGCACTGGCCGCCGTGTCGCACACATCGACGGACACTCTGCCGCTGTACCGTTGCCCCCGACAGCCGTTACCCCG                                                                                             ]
[+] EMBL CNS093QA             [                                    CGTCCCACCGTGACCGTGGACCGTTTTCTTATGTTTCTCGATGCTGAACTTTGTAAATGGTTTGTTACATTCCTCACAGATAATGTCCTTCTTCATGTGCACCTTGGCCATGTGGGCAGTGAGTCTGTTCTTGAAAGGAAACCGCTTGCCGCACTCCTCGCAAGCAAACTCCCACTCCTGGTGCTTGTTCTGCATGTGCTCCTCCAGGTTCTGGTGCACCTCCTGGCACACGCCGCACCGGAACCGTTCCGGATTCTCGTGCATATCCTTATGCTCGA CCAGCTTGACGCGCGA  GAAACTTTTTCGCGCACAGCTGACACTTGTCCGTGCCCGACTCGAGCCCGTGCACCGTCCGCATGTGCTTTTTCAGCTGCTTCAGCGACCGGTACTCCTCCTCCTGGGTCGTTGCTGCTGCTGCCGCTTCCGGATGGCCCGCTCCCGCGGCAACACTGCCCGGGTCACCGCCGGGGCCGGCCACCGCGACAGCAACAGCGACCTTTTCCGGATCGCAAATCTCACATATGATGGGTTTGTAGAAATCGAATATTTCTCTATCTAGCGTCTGCTTCTGCTCCTCGGTCAGCTCGGGCCCCGGCTCGCCGCCCGGGTTGCCCGACTTGCCGGAATCTTCCTCCAGCAGCGCG TTTGGCTGGTGCATGCGCTTGTGCTCGAGCAGTTTCGGGGGCGTACGGATCTTCTTCTCACACAGTGGACACTTTACCGTACCGGCCTGCTGCCCGTGCACCAGCCGCATGTGGTGGTTTAGCTCCTTCACCGTCGCGTACAGCATCGCGCTGGCCTGTGGACCGGCCCCGGCA                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CNS09DT5             [                                                                                                                 AGATAATGTCCTTCTTCATGTGCACCTTGGCCATGTGGGCAGTGAGTCTGTTCTTGAAAGGAAACCGCTTGCCGCACTCCTCGCAAGCAAACTCCCACTCCTGGTGCTTGTTCTGCATGTGCTCCTCCAGGTTCTGGTGCACCTCCTGGCACACGCCGCACCGGAAACGTTCCGGATTCTCGTGCATATCCTTATGCTCGACCCAGCTTGACGCGCGAGCGAAACTTTTTCGCGCACAGCTGACACTTGACCGTGCCCGACTCGAGCCCGTGCACCGTCCGCATGTGCTGGTTCAGCTGCTTCAGCGACCGGTACTCCTCCTCCTGGGTCGTTGCTGCTGCTGCCGCTTCCGGATGG CCGCTCCCGCGGCAACACTGCCCGGGTCACCGCCGGGGCCGGCCACCGCGACAGCCACAGCGACCTTTTCCGGATCGCAAATCTCACATATGATGGGTTTGTAGAAATCGAATATTTCTCTATCTAGCGTCTGCTTCTGCTCCTCGGTCAGCTCGGGCCCCGGCTCGCCGCCCGGGTTGCCCGACTTGCCGGAATCTTCCTCCAGCAGCGCG TTTGGCTGGTGAAAGCGCTTGTGCTCGAGCAGCTTCGGGCGCGTACGGATCTTCTTCTCACACAGTGGACACTTTA CGTACCGGCCTGCTGCCCGTGCACCAGCCGCATGTGGTGGTTTAGCTCCTTCACCGTCGCGTACAGCATCGCGCTGGCCTGTGGACCGGCCCCGGCAGCAGCACTGGCCGCCGTGTCGCACACATCGACGGACACTCTGCCGCTGTACCGTTGCCCCCGACAGCCGTTACCCCGGATCCGCCGGATGGTAGCATTCCGTTTCTTCGTGCTTCATCCCATAATCCGGAACATCGGACAGCAACGGCACGGGCCCGTCCACCAGCGGCG]
[-] EMBL CNS093Q9             [                                                                                                                                                                                                   GCAAGCAAACTCCCACTCCTGGTGCTTGTTCTGCATGTGCTCCTCCAGGTTCTGGTGCACCTCCTGGCACACGCCGCACCGGAACCGTTCCGGATTCTCGTGCATATCCTTATGCTCGA CCAGCTTCACGCGCGAGCGAAACTTTTTCGCGCACAGCTGACACTTGACCGTGCCCGACTCGAGCCCGTGCACCGTCCGCATGTGCTGGTTCAGCTGCTTCAGCGACCGGTACTCCTCCTCCTGGGTCGTTGCTGCTGCTGCCGCTTCCGGATGG CCGCTCCCGCGGCAACACTGCCCGGGTCACCGCCGGGGCCGGCCACCGCGACAGCCACAGCGACCTTTTCCGGATCGCAAATCTCACATATGATGGGTTTGTAGAAATCGAATATTTCTCTATCTAGCGTCTGCTTCTGCTCCTCGGTCAGCTCGGGCCCCGGCTCGCCGCCCGGGTTGCCCAACTTGCCGGAATCTTCCTCCAGCAGCGCG TTTGGCTGGTGCAAGCGCTTGTGCTCGAGCAGCTTCGGGCGCGTACGGATCTTCTTCTCACACAGTGGACACTTTA CGTACCGGCCTGCTGCCCGTGCACCAGCCGCATGTGGTGGTTTAGCTCCTTCACCGTCGCGTACAGCATCGCGCTGGCCTGTGGACCGGCCCCGGCAGCAGCACTGGCCGCCGTGTCGCACACATCGACGGACACTCTGCCGCTGTACCGTTGCCCCCGACAGCCGTTACCCCGGATCCGCCGGATGGTAGCATTCCGATTATTCGTGCTTCATCCCATAATCCGGAACATCGGACAGCAACGGCACGGGCCCGTCCAC        ]




>consensus_6479#0
TTTTTTTTTCTTTTTCGGGAAGTTTTCACAGATGAACGTCCCACCGTGACCGTGGACCGT
TTTCTTATGTTTCTCGATGCTGAACTTTGTAAATGGTTTGTTACATTCCTCACAGATAAT
GTCCTTCTTCATGTGCACCTTGGCCATGTGGGCAGTGAGTCTGTTCTTGAAAGGAAACCG
CTTGCCGCACTCCTCGCAAGCAAACTCCCACTCCTGGTGCTTGTTCTGCATGTGCTCCTC
CAGGTTCTGGTGCACCTCCTGGCACACGCCGCACCGGAACCGTTCCGGATTCTCGTGCAT
ATCCTTATGCTCGACCAGCTTGACGCGCGAGAAACTTTTTCGCGCACAGCTGACACTTGT
CCGTGCCCGACTCGAGCCCGTGCACCGTCCGCATGTGCTGGTTCAGCTGCTTCAGCGACC
GGTACTCCTCCTCCTGGGTCGTTGCTGCTGCTGCCGCTTCCGGATGGCCCGCTCCCGCGG
CAACACTGCCCGGGTCACCGCCGGGGCCGGCCACCGCGACAGCCACAGCGACCTTTTCCG
GATCGCAAATCTCACATATGATGGGTTTGTAGAAATCGAATATTTCTCTATCTAGCGTCT
GCTTCTGCTCCTCGGTCAGCTCGGGCCCCGGCTCGCCGCCCGGGTTGCCCGACTTGCCGG
AATCTTCCTCCAGCAGCGCGTTTGGCTGGTGCATGCGCTTGTGCTCGAGCAGTTTCGGGC
GCGTACGGATCTTCTTCTCACACAGTGGACACTTTACCGTACCGGCCTGCTGCCCGTGCA
CCAGCCGCATGTGGTGGTTTAGCTCCTTCACCGTCGCGTACAGCATCGCGCTGGCCTGTG
GACCGGCCCCGGCAGCAGCACTGGCCGCCGTGTCGCACACATCGACGGACACTCTGCCGC
TGTACCGTTGCCCCCGACAGCCGTTACCCCGGATCCGCCGGATGGTAGCATTCCGTTTCT
TCGTGCTTCATCCCATAATCCGGAACATCGGACAGCAACGGCACGGGCCCGTCCACCAGC
GGCG

consensusID : consensus_6479#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 679
fasta sequence

                              [GCTGACACTTTGACCGTTGCCCGACTCGAGCCCCGTGCACCGTCCGCATGTGCTGGTTCAGCTGCTTCAGCGACCGGTACTCCCTCCTCCTGGGGTCGTTGCTGCTGCTGCCGCTTCCGGATGGCCCGCTCCCGCGGGCAACACCGCCCCGGGTCCACCGCCGGGGCTCGGCCACCGCGACAGCCCACAGCGACCTTTTCCGGATCGCAAATCTCACATATGATGGGTTTGTAGAAATCGAATATTTCTCTATCTAGCGTCTGCTTCTGCTCCTCGGTCAGCTCGGGCCCCGGCTCGCCGCCCGGGTTGCCCGACTTGCCGGAATCTTCCTCCAGCAGCGCGTTTGGCTGGTGCATGCGCTTGTGCTCGAGCAGCTTCGGGCGCGTACGGATCTTCTTCTCACACAGTGGACACTTTACCGTACCGGCCTGCTGCCCGTGCACCAGCCGCATGTGGTGGTTTAGCTCCTTCACCGTCGCGTACAGCATCGCGCAGGCCTGTGGACCGGCCCCGGCAGCAGCACTGGCCGCCGCGTCGCACACATCGCAGCTGATGCGCTTGTAAAACTCCAGTATCTCCTTGTCCATCTGCTCGGACTGCAGCTTCTCCGCGTCGTCCTCGGACGTGGCGTCCTGTCGCTGGTGCACGCTCTTGTGCTCCAGCAGCTTCCCCCGCGCGG]

[-] EMBL BM602656             [GCTGACACTTTGACCGTTGCCCGACTCGAGCCCCGTGCACCGTCCGCATGTGCTGGTTCAGCTGCTTCAGCGACCGGTACTCCCTCCTCCTGGGGTCGTTGCTGCTGCTGCCGCTTCCGGATGGCCCGCTCCCGCGGGCAACACCGCCCCGGGTCCACCGCCGGGGCTCGGCCACCGCGACAGCCCACAGCGACCTTTTCCGGATCGCAAATCTCACATATGATGGGTTTGTAGAAATCGAATATTTCTCTATCTAGCGTCTGCTTCTGCTCCTCGGTCAGCTCGGGCCCCGGCTCGCCGCCCGGGTTGCCCGACTTGCCGGAATCTTCCTCCAGCAGCGCGTTTGGCTGGTGCATGCGCTTGTGCTCGAGCAGCTTCGGGCGCGTACGGATCTTCTTCTCACACAGTGGACACTTTACCGTACCGGCCTGCTGCCCGTGCACCAGCCGCATGTGGTGGTTTAGCTCCTTCACCGTCGCGTACAGCATCGCGCAGGCCTGTGGACCGGCCCCGGCAGCAGCACTGGCCGCCGCGTCGCACACATCGCAGCTGATGCGCTTGTAAAACTCCAGTATCTCCTTGTCCATCTGCTCGGACTGCAGCTTCTCCGCGTCGTCCTCGGACGTGGCGTCCTGTCGCTGGTGCACGCTCTTGTGCTCCAGCAGCTTCCCCCGCGCGG]




>consensus_6479#1
GCTGACACTTTGACCGTTGCCCGACTCGAGCCCCGTGCACCGTCCGCATGTGCTGGTTCA
GCTGCTTCAGCGACCGGTACTCCCTCCTCCTGGGGTCGTTGCTGCTGCTGCCGCTTCCGG
ATGGCCCGCTCCCGCGGGCAACACCGCCCCGGGTCCACCGCCGGGGCTCGGCCACCGCGA
CAGCCCACAGCGACCTTTTCCGGATCGCAAATCTCACATATGATGGGTTTGTAGAAATCG
AATATTTCTCTATCTAGCGTCTGCTTCTGCTCCTCGGTCAGCTCGGGCCCCGGCTCGCCG
CCCGGGTTGCCCGACTTGCCGGAATCTTCCTCCAGCAGCGCGTTTGGCTGGTGCATGCGC
TTGTGCTCGAGCAGCTTCGGGCGCGTACGGATCTTCTTCTCACACAGTGGACACTTTACC
GTACCGGCCTGCTGCCCGTGCACCAGCCGCATGTGGTGGTTTAGCTCCTTCACCGTCGCG
TACAGCATCGCGCAGGCCTGTGGACCGGCCCCGGCAGCAGCACTGGCCGCCGCGTCGCAC
ACATCGCAGCTGATGCGCTTGTAAAACTCCAGTATCTCCTTGTCCATCTGCTCGGACTGC
AGCTTCTCCGCGTCGTCCTCGGACGTGGCGTCCTGTCGCTGGTGCACGCTCTTGTGCTCC
AGCAGCTTCCCCCGCGCGG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6479#0      TTTTTTTTTCTTTTTCGGGAAGTTTTCACAGATGAACGTCCCACCGTGACCGTGGACCGT 60
consensus_6479#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6479#0      TTTCTTATGTTTCTCGATGCTGAACTTTGTAAATGGTTTGTTACATTCCTCACAGATAAT 120
consensus_6479#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6479#0      GTCCTTCTTCATGTGCACCTTGGCCATGTGGGCAGTGAGTCTGTTCTTGAAAGGAAACCG 180
consensus_6479#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6479#0      CTTGCCGCACTCCTCGCAAGCAAACTCCCACTCCTGGTGCTTGTTCTGCATGTGCTCCTC 240
consensus_6479#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6479#0      CAGGTTCTGGTGCACCTCCTGGCACACGCCGCACCGGAACCGTTCCGGATTCTCGTGCAT 300
consensus_6479#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6479#0      ATCCTTATGCTCGACCAGCTTGACGCGCGAGAAACTTTTTCGCGCACAGCTGACACTT-G 359
consensus_6479#1      ------------------------------------------------GCTGACACTTTG 12
                                                                      ********** *

consensus_6479#0      TCCGT-GCCCGACTCGAGCCC-GTGCACCGTCCGCATGTGCTGGTTCAGCTGCTTCAGCG 417
consensus_6479#1      ACCGTTGCCCGACTCGAGCCCCGTGCACCGTCCGCATGTGCTGGTTCAGCTGCTTCAGCG 72
                       **** *************** **************************************

consensus_6479#0      ACCGGTACTCC-TCCTCCTGGG-TCGTTGCTGCTGCTGCCGCTTCCGGATGGCCCGCTCC 475
consensus_6479#1      ACCGGTACTCCCTCCTCCTGGGGTCGTTGCTGCTGCTGCCGCTTCCGGATGGCCCGCTCC 132
                      *********** ********** *************************************

consensus_6479#0      CGCGG-CAACACTGCCCGGG--TCACCGCCGGGGC-CGGCCACCGCGACAGCC-ACAGCG 530
consensus_6479#1      CGCGGGCAACACCGCCCCGGGTCCACCGCCGGGGCTCGGCCACCGCGACAGCCCACAGCG 192
                      ***** ****** **** **   ************ ***************** ******

consensus_6479#0      ACCTTTTCCGGATCGCAAATCTCACATATGATGGGTTTGTAGAAATCGAATATTTCTCTA 590
consensus_6479#1      ACCTTTTCCGGATCGCAAATCTCACATATGATGGGTTTGTAGAAATCGAATATTTCTCTA 252
                      ************************************************************

consensus_6479#0      TCTAGCGTCTGCTTCTGCTCCTCGGTCAGCTCGGGCCCCGGCTCGCCGCCCGGGTTGCCC 650
consensus_6479#1      TCTAGCGTCTGCTTCTGCTCCTCGGTCAGCTCGGGCCCCGGCTCGCCGCCCGGGTTGCCC 312
                      ************************************************************

consensus_6479#0      GACTTGCCGGAATCTTCCTCCAGCAGCGCGTTTGGCTGGTGCATGCGCTTGTGCTCGAGC 710
consensus_6479#1      GACTTGCCGGAATCTTCCTCCAGCAGCGCGTTTGGCTGGTGCATGCGCTTGTGCTCGAGC 372
                      ************************************************************

consensus_6479#0      AGTTTCGGGCGCGTACGGATCTTCTTCTCACACAGTGGACACTTTACCGTACCGGCCTGC 770
consensus_6479#1      AGCTTCGGGCGCGTACGGATCTTCTTCTCACACAGTGGACACTTTACCGTACCGGCCTGC 432
                      ** *********************************************************

consensus_6479#0      TGCCCGTGCACCAGCCGCATGTGGTGGTTTAGCTCCTTCACCGTCGCGTACAGCATCGCG 830
consensus_6479#1      TGCCCGTGCACCAGCCGCATGTGGTGGTTTAGCTCCTTCACCGTCGCGTACAGCATCGCG 492
                      ************************************************************

consensus_6479#0      CTGGCCTGTGGACCGGCCCCGGCAGCAGCACTGGCCGCCGTGTCGCACACATCG--ACGG 888
consensus_6479#1      CAGGCCTGTGGACCGGCCCCGGCAGCAGCACTGGCCGCCGCGTCGCACACATCGCAGCTG 552
                      * ************************************** *************   * *

consensus_6479#0      ACACTCTGCCGCTGTACCGTTGCCCCCGACAGCCGTTACCCCGGATCCGCCGGATGGTAG 948
consensus_6479#1      ATGCGCTTGTAAAACTCCAGTATCTCCT-TGTCCATCTGCTCGGA-CTGCAGCTTCTCCG 610
                      *  * **         **  *  * **     ** *   * **** * ** *  *    *

consensus_6479#0      CATTCCGTTTCTTCGTGCTTCATCCCATAATCCGGAACATCGGACAGCAACGGCACGGGC 1008
consensus_6479#1      CGT--CGTCCTCGGACGTGGCGTCCTGTCG-CTGGTGCACGCTCTTGTGCTCCAGCAGCT 667
                      * *  ***        *   * ***  *   * **  **       *        * *  

consensus_6479#0      CCGTCCACCAGCGGCG 1024
consensus_6479#1      TCCCCCGC--GCGG-- 679
                       *  ** *  ****